104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1494 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1494  glycoside hydrolase family 13 domain protein  100 
 
 		 97 aa  206  1e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0815  glycoside hydrolase family 13 domain protein  49.43 
 
 		 101 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4079  glycoside hydrolase family 13 protein  47.25 
 
 		 101 aa  79  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1855  glycoside hydrolase family 13 domain protein  43.16 
 
 		 103 aa  77.8  0.00000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0255733  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0280  glycoside hydrolase family 13 domain protein  45.68 
 
 		 92 aa  73.6  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2682  isoamylase protein-like  42.11 
 
 		 102 aa  72.8  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0061  hypothetical protein  42.27 
 
 		 110 aa  70.5  0.000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000139615  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1666  glycoside hydrolase family 13 domain protein  38.54 
 
 		 131 aa  69.3  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1180  glycoside hydrolase family 13 protein  39.51 
 
 		 648 aa  67.8  0.00000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3053  isoamylase N-terminal domain protein  47.3 
 
 		 102 aa  67  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.199592 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2143  glycoside hydrolase family protein  43.75 
 
 		 102 aa  66.2  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2047  isoamylase N-terminal domain-containing protein  40.59 
 
 		 102 aa  66.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2301  glycoside hydrolase family 13 protein  39.08 
 
 		 84 aa  66.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000000870464  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3372  isoamylase N-terminal domain-containing protein  40.96 
 
 		 93 aa  65.5  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.770177  hitchhiker  0.00400733 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05304  hypothetical protein  38 
 
 		 101 aa  64.3  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000578  1,4-alpha-glucan branching enzyme  38.14 
 
 		 98 aa  64.3  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00704664  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0107  glycoside hydrolase family 13 domain protein  43.56 
 
 		 102 aa  63.5  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.724495  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7533  hypothetical protein  41.33 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.302047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0960  glycoside hydrolase family 13 protein  39.44 
 
 		 674 aa  61.2  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000677412  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0979  glycoside hydrolase family 13 protein  39.44 
 
 		 674 aa  60.5  0.000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0346401  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0850  glycoside hydrolase family protein  38.89 
 
 		 102 aa  59.7  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000054884  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00998  isoamylase protein-like protein  40.96 
 
 		 102 aa  59.3  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.590602  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1368  glycoside hydrolase family 13 domain protein  37.5 
 
 		 104 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0803  glycoside hydrolase family protein  32.94 
 
 		 1162 aa  57.8  0.00000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1616  glycoside hydrolase family 13 protein  35.63 
 
 		 663 aa  57.8  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1470  glycoside hydrolase family 13 protein  39.13 
 
 		 98 aa  55.5  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5813  isoamylase N-terminal domain-containing protein  39.08 
 
 		 100 aa  56.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3888  glycoside hydrolase family 13 protein  34.02 
 
 		 119 aa  55.1  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1681  isoamylase N-terminal domain-containing protein  35.64 
 
 		 102 aa  52.8  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0546611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1533  glycoside hydrolase family 13 domain protein  34.02 
 
 		 196 aa  52.8  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0690435  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1569  glycoside hydrolase, family 13 domain protein  31.03 
 
 		 209 aa  50.4  0.000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.968091  normal  0.178775 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1518  glycogen branching enzyme  48.28 
 
 		 728 aa  49.3  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39818 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3124  isoamylase N-terminal domain-containing protein  35.8 
 
 		 93 aa  48.9  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.020256  normal  0.183077 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6053  glycoside hydrolase family 13 domain protein  36.62 
 
 		 169 aa  48.9  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.150126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3736  glycoside hydrolase family protein  34.72 
 
 		 206 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0639  glycoside hydrolase family protein  36.67 
 
 		 400 aa  48.9  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.401976  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3793  glycoside hydrolase family 13 domain protein  34.72 
 
 		 206 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.079655  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3877  glycoside hydrolase family 13 domain protein  34.72 
 
 		 206 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.106033  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4511  beta-lactamase  45.1 
 
 		 555 aa  47.4  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480191  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6551  serine/threonine protein kinase  32.88 
 
 		 1013 aa  45.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.285307 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1413  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  35.53 
 
 		 1117 aa  45.4  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6806  1,4-alpha-glucan branching enzyme  44.44 
 
 		 770 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.606577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7545  1,4-alpha-glucan branching enzyme  44.44 
 
 		 768 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1392  glycogen branching enzyme  52.5 
 
 		 723 aa  44.3  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4425  glycoside hydrolase family 13 protein  29.35 
 
 		 98 aa  44.3  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341885 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3657  glycogen branching enzyme  69.23 
 
 		 736 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0888692  normal  0.0129978 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1817  glycogen branching enzyme  69.23 
 
 		 736 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.297047 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0904  glycogen branching enzyme  52.17 
 
 		 749 aa  43.9  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.294253  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0542  1,4-alpha-glucan branching enzyme  38.18 
 
 		 732 aa  43.9  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217591  normal  0.258391 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2074  glycogen branching enzyme  46.55 
 
 		 725 aa  43.9  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.296286  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4058  glycogen branching enzyme  69.23 
 
 		 736 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2293  glycogen branching enzyme  40 
 
 		 712 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.467117  hitchhiker  0.000028583 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1785  glycogen branching enzyme  69.23 
 
 		 736 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146996  normal  0.282857 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2714  1,4-alpha-glucan branching enzyme  69.23 
 
 		 784 aa  43.5  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1597  1,4-alpha-glucan branching enzyme  65.38 
 
 		 760 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.14436 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3937  glycogen branching enzyme  39.13 
 
 		 768 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.353505 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  69.23 
 
 		 785 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.573096  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2941  1,4-alpha-glucan branching enzyme  69.23 
 
 		 784 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.595342  hitchhiker  0.00590873 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4050  glycogen branching enzyme  39.13 
 
 		 768 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2907  alpha amylase catalytic subunit  32.79 
 
 		 715 aa  42.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.245602 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0239  glycogen branching enzyme  40.3 
 
 		 775 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0137851  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4229  glycogen branching enzyme  45.45 
 
 		 750 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7032  glycogen branching enzyme  60.71 
 
 		 735 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1339  1,4-alpha-glucan branching enzyme  37.5 
 
 		 282 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1105  glycogen branching enzyme  53.49 
 
 		 748 aa  42.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.545328  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0535  1,4-alpha-glucan branching enzyme  37.5 
 
 		 282 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3603  1,4-alpha-glucan branching enzyme  35.29 
 
 		 736 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.747738  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0889  1,4-alpha-glucan branching enzyme  53.85 
 
 		 807 aa  42  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3886  glycoside hydrolase family 13 protein  29.17 
 
 		 223 aa  42  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0366228 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3070  1,4-alpha-glucan branching enzyme  37.7 
 
 		 1217 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.34783  normal  0.34128 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1464  1,4-alpha-glucan branching enzyme  42.86 
 
 		 742 aa  42  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18260  glycoside hydrolase family 13 domain protein  32.26 
 
 		 900 aa  41.6  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000104255  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09520  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  51.28 
 
 		 1320 aa  42  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.100278 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3680  glycogen branching enzyme  60.71 
 
 		 716 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2863  glycogen branching enzyme  50 
 
 		 736 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1332  glycogen branching enzyme  60.71 
 
 		 736 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.802487  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6497  glycogen branching enzyme  60.71 
 
 		 736 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6086  glycogen branching enzyme  60.71 
 
 		 736 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.133555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4391  glycogen branching enzyme  65.38 
 
 		 741 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.470909 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6823  glycogen branching enzyme  50 
 
 		 736 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.851597 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03669  glycogen branching enzyme  47.73 
 
 		 727 aa  41.2  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2091  glycogen branching enzyme  53.12 
 
 		 677 aa  41.2  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0327  1,4-alpha-glucan branching enzyme  32.93 
 
 		 731 aa  41.6  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1737  glycogen branching enzyme  65.38 
 
 		 738 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.304043  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0958  glycogen branching enzyme  60.71 
 
 		 695 aa  41.2  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32011 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0676  glycogen branching enzyme  38 
 
 		 727 aa  41.2  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.214818  normal  0.407177 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1543  glycogen branching enzyme  65.38 
 
 		 738 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.408672  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1566  glycogen branching enzyme  65.38 
 
 		 738 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2458  1,4-alpha-glucan branching enzyme  65.38 
 
 		 735 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.106606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  65.38 
 
 		 732 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88710  alpha-1,4-glucan branching enzyme  41.86 
 
 		 701 aa  40.8  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.314091 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1279  alpha amylase catalytic region  30.36 
 
 		 560 aa  40.8  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1135  glycoside hydrolase family 13 protein  30 
 
 		 426 aa  40.8  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0202706  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4118  glycogen branching enzyme  53.49 
 
 		 727 aa  40.8  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.595644 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0147  glycogen branching enzyme  53.49 
 
 		 727 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5384  glycogen branching enzyme  45.61 
 
 		 737 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.475893  normal  0.712549 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2058  glycogen branching enzyme  34.92 
 
 		 740 aa  40.4  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0222807  normal  0.370562 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1104  1,4-alpha-glucan branching enzyme  65.38 
 
 		 729 aa  40.8  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4006  glycogen branching enzyme  51.22 
 
 		 727 aa  40.8  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0277  glycogen branching enzyme  60.71 
 
 		 727 aa  40.4  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>