36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4079 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_4079  glycoside hydrolase family 13 protein  100 
 
 
101 aa  210  4.9999999999999996e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2682  isoamylase protein-like  52.94 
 
 
102 aa  114  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00998  isoamylase protein-like protein  53 
 
 
102 aa  111  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.590602  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5813  isoamylase N-terminal domain-containing protein  52 
 
 
100 aa  110  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2143  glycoside hydrolase family protein  51 
 
 
102 aa  105  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1855  glycoside hydrolase family 13 domain protein  46.39 
 
 
103 aa  97.4  5e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0255733  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1681  isoamylase N-terminal domain-containing protein  43.88 
 
 
102 aa  94.4  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0546611  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0850  glycoside hydrolase family protein  48.98 
 
 
102 aa  94.4  5e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000054884  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2047  isoamylase N-terminal domain-containing protein  41 
 
 
102 aa  93.2  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3053  isoamylase N-terminal domain protein  47.52 
 
 
102 aa  92  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.199592 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1368  glycoside hydrolase family 13 domain protein  41.18 
 
 
104 aa  92  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0815  glycoside hydrolase family 13 domain protein  45 
 
 
101 aa  91.7  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0107  glycoside hydrolase family 13 domain protein  47 
 
 
102 aa  89  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.724495  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1494  glycoside hydrolase family 13 domain protein  47.25 
 
 
97 aa  79  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1470  glycoside hydrolase family 13 protein  42.86 
 
 
98 aa  76.3  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05304  hypothetical protein  40.59 
 
 
101 aa  70.1  0.000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1666  glycoside hydrolase family 13 domain protein  38.78 
 
 
131 aa  67.8  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000578  1,4-alpha-glucan branching enzyme  39.6 
 
 
98 aa  67.4  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00704664  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0061  hypothetical protein  44.32 
 
 
110 aa  63.9  0.0000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000139615  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2301  glycoside hydrolase family 13 protein  42.11 
 
 
84 aa  61.6  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000000870464  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7533  hypothetical protein  27.27 
 
 
109 aa  57.4  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.302047  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0280  glycoside hydrolase family 13 domain protein  35.29 
 
 
92 aa  55.1  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0960  glycoside hydrolase family 13 protein  40.91 
 
 
674 aa  54.3  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000677412  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0979  glycoside hydrolase family 13 protein  39.77 
 
 
674 aa  52.8  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0346401  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3372  isoamylase N-terminal domain-containing protein  34.29 
 
 
93 aa  51.6  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.770177  hitchhiker  0.00400733 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06020  hypothetical protein  43.14 
 
 
793 aa  51.2  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1180  glycoside hydrolase family 13 protein  40.45 
 
 
648 aa  49.3  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0500  hypothetical protein  38.96 
 
 
109 aa  48.5  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.562213  normal  0.0707696 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0803  glycoside hydrolase family protein  37.66 
 
 
1162 aa  46.2  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3736  glycoside hydrolase family protein  32.47 
 
 
206 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1616  glycoside hydrolase family 13 protein  38.96 
 
 
663 aa  44.3  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0639  glycoside hydrolase family protein  31.94 
 
 
400 aa  43.5  0.0009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.401976  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3877  glycoside hydrolase family 13 domain protein  31.51 
 
 
206 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.106033  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3793  glycoside hydrolase family 13 domain protein  31.08 
 
 
206 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.079655  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0327  1,4-alpha-glucan branching enzyme  30 
 
 
731 aa  41.2  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1051  1,4-alpha-glucan branching enzyme  36.07 
 
 
670 aa  41.2  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>