20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_4286 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_4286  membrane-anchored protein  100 
 
 
267 aa  548  1e-155  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4264  membrane-anchored protein  97.75 
 
 
267 aa  511  1e-144  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4133  membrane-anchored protein  96.25 
 
 
267 aa  508  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0676  pullulanase  31.84 
 
 
267 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0675  glycoside hydrolase family 57  35.61 
 
 
1042 aa  111  9e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1866  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 
1000 aa  95.5  8e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1616  glycoside hydrolase family protein  30.64 
 
 
1006 aa  89.4  6e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0985  glycoside hydrolase family protein  31.73 
 
 
994 aa  83.2  0.000000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.369995  normal  0.376092 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0803  glycoside hydrolase family protein  28.57 
 
 
1162 aa  70.5  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16030  Membrane-anchored protein predicted to be involved in regulation of amylopullulanase  26.92 
 
 
313 aa  64.7  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2960  Membrane-anchored protein predicted to be involved in regulation of amylopullulanase  31.82 
 
 
228 aa  57.4  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1616  glycoside hydrolase family 13 protein  30.97 
 
 
663 aa  55.8  0.0000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1899  pullulanase  35.71 
 
 
390 aa  53.1  0.000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0976  pullulanase  39.47 
 
 
379 aa  52.8  0.000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.853358 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7156  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  32.67 
 
 
1132 aa  52.4  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0565327  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1460  Protein of unknown function DUF2223  37.35 
 
 
1255 aa  52.4  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0327  Protein of unknown function DUF2223  29.79 
 
 
273 aa  50.4  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.590308 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1300  hypothetical protein  35.06 
 
 
249 aa  48.1  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0915  pullulanase  33 
 
 
386 aa  48.9  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.521806  normal  0.517446 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1416  pullulanase  33.33 
 
 
386 aa  45.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>