20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_16030 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_16030  Membrane-anchored protein predicted to be involved in regulation of amylopullulanase  100 
 
 
313 aa  632  1e-180  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0803  glycoside hydrolase family protein  33.05 
 
 
1162 aa  142  9e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1616  glycoside hydrolase family 13 protein  33.19 
 
 
663 aa  124  2e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0676  pullulanase  32.07 
 
 
267 aa  97.1  4e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1866  glycoside hydrolase family protein  28.93 
 
 
1000 aa  89.7  6e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0985  glycoside hydrolase family protein  28.46 
 
 
994 aa  89  1e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.369995  normal  0.376092 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1616  glycoside hydrolase family protein  26.1 
 
 
1006 aa  86.3  7e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0675  glycoside hydrolase family 57  30.83 
 
 
1042 aa  85.9  8e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2960  Membrane-anchored protein predicted to be involved in regulation of amylopullulanase  27.96 
 
 
228 aa  69.7  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1460  Protein of unknown function DUF2223  27.51 
 
 
1255 aa  69.3  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0327  Protein of unknown function DUF2223  27.7 
 
 
273 aa  68.9  0.00000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.590308 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4264  membrane-anchored protein  31.5 
 
 
267 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4133  membrane-anchored protein  31.5 
 
 
267 aa  62.8  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0976  pullulanase  25.74 
 
 
379 aa  62.4  0.000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.853358 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0915  pullulanase  23.8 
 
 
386 aa  62  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.521806  normal  0.517446 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4286  membrane-anchored protein  30.71 
 
 
267 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1899  pullulanase  24.67 
 
 
390 aa  57.8  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7156  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  29.2 
 
 
1132 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0565327  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1300  hypothetical protein  28.44 
 
 
249 aa  48.9  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1416  pullulanase  22.49 
 
 
386 aa  48.1  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>