83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1866 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_0985  glycoside hydrolase family protein  71.1 
 
 
994 aa  1497    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.369995  normal  0.376092 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1616  glycoside hydrolase family protein  76.87 
 
 
1006 aa  1497    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1866  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
1000 aa  2043    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0803  glycoside hydrolase family protein  31.11 
 
 
1162 aa  276  1.0000000000000001e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0675  glycoside hydrolase family 57  31.95 
 
 
1042 aa  274  7e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0856  glycoside hydrolase family protein  32.06 
 
 
732 aa  262  3e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3177  glycoside hydrolase family protein  31.1 
 
 
734 aa  253  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.392002 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3464  glycoside hydrolase family 57  30.99 
 
 
728 aa  245  3.9999999999999997e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3401  glycoside hydrolase family 57  31.04 
 
 
728 aa  243  9e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0408  glycoside hydrolase family 57  31.05 
 
 
729 aa  243  2e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3255  hypothetical protein  30.51 
 
 
729 aa  241  5.999999999999999e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0027  glycoside hydrolase family protein  32.11 
 
 
731 aa  240  8e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0734  glycoside hydrolase family protein  33.21 
 
 
1022 aa  238  3e-61  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.983175  normal  0.257164 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0770  glycoside hydrolase family 57  29.05 
 
 
829 aa  231  5e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0999  glycoside hydrolase family 57  28.21 
 
 
674 aa  228  6e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0149  glycoside hydrolase family 57  29.01 
 
 
726 aa  223  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00221085  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0131  glycoside hydrolase family protein  29.69 
 
 
726 aa  223  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0840945  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2965  glycoside hydrolase family 57  29.16 
 
 
749 aa  223  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.993077  normal  0.662325 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0138  glycoside hydrolase family 57  29.01 
 
 
726 aa  222  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.806114  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3440  family 57 glycoside hydrolase  29.22 
 
 
744 aa  221  3.9999999999999997e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3153  glycoside hydrolase family 57  28.99 
 
 
749 aa  221  7e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2957  alpha-mannosidase  29.3 
 
 
695 aa  215  3.9999999999999995e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4047  glycoside hydrolase family 57  29.18 
 
 
747 aa  209  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.422577 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3035  glycoside hydrolase family protein  28.11 
 
 
744 aa  209  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1516  glycoside hydrolase family protein  28.97 
 
 
759 aa  203  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.757577  normal  0.533903 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4927  glycoside hydrolase family 57  28.74 
 
 
743 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.269999  normal  0.543005 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0135  glycoside hydrolase family protein  28.99 
 
 
722 aa  192  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000920685  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1528  glycoside hydrolase family 57  27.42 
 
 
580 aa  186  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000278955 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2072  glycoside hydrolase, family 57  26.53 
 
 
577 aa  185  4.0000000000000006e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1432  glycoside hydrolase family protein  27.52 
 
 
570 aa  184  9.000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1369  glycoside hydrolase family protein  26.98 
 
 
582 aa  179  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0509  glycoside hydrolase family protein  26.18 
 
 
575 aa  179  2e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2060  glycosy hydrolase family protein  25.46 
 
 
574 aa  176  1.9999999999999998e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.725097  normal  0.224311 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0960  glycoside hydrolase family protein  25.77 
 
 
584 aa  173  1e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.285068 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1107  glycoside hydrolase family protein  26.67 
 
 
580 aa  171  5e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.185203  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0777  glycoside hydrolase family 57  26.12 
 
 
566 aa  158  4e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2839  glycosyl hydrolase, family 57  26.03 
 
 
568 aa  158  6e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2460  glycoside hydrolase family 57  26.03 
 
 
568 aa  158  6e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0584  glycoside hydrolase family protein  25.49 
 
 
551 aa  155  4e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0719  glycoside hydrolase family protein  26.03 
 
 
566 aa  144  8e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0976  pullulanase  32.7 
 
 
379 aa  142  3e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.853358 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0915  pullulanase  33.24 
 
 
386 aa  140  1e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.521806  normal  0.517446 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1899  pullulanase  33.17 
 
 
390 aa  139  2e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2138  glycoside hydrolase family 57  30.54 
 
 
902 aa  102  3e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.205932  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1416  pullulanase  29.97 
 
 
386 aa  102  4e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0676  pullulanase  31.28 
 
 
267 aa  97.1  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1616  glycoside hydrolase family 13 protein  31.17 
 
 
663 aa  95.5  4e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4286  membrane-anchored protein  32.71 
 
 
267 aa  92  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4264  membrane-anchored protein  32.71 
 
 
267 aa  91.7  6e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16030  Membrane-anchored protein predicted to be involved in regulation of amylopullulanase  28.93 
 
 
313 aa  90.1  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4133  membrane-anchored protein  31.78 
 
 
267 aa  89.4  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1371  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 
606 aa  78.6  0.0000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1460  Protein of unknown function DUF2223  31.19 
 
 
1255 aa  75.1  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0932  glycoside hydrolase family protein  25.69 
 
 
1187 aa  72.8  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.26895  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0135  Alpha-amylase  28.9 
 
 
518 aa  63.9  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0199  glycoside hydrolase family protein  30.29 
 
 
485 aa  63.2  0.00000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.400833 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0672  glycoside hydrolase family protein  30.46 
 
 
485 aa  62  0.00000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.565437 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2765  glycoside hydrolase family 57  26.7 
 
 
766 aa  61.6  0.00000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000129952  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2118  hypothetical protein  28 
 
 
407 aa  60.8  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0183  glycoside hydrolase family protein  29.68 
 
 
471 aa  59.3  0.0000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00355516  normal  0.949853 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0210  glycoside hydrolase family protein  28.87 
 
 
609 aa  58.5  0.0000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.044129  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0536  Alpha-amylase  26.34 
 
 
407 aa  58.5  0.0000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1236  glycoside hydrolase family protein  30.52 
 
 
472 aa  57.8  0.0000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1383  Alpha-amylase  27.23 
 
 
407 aa  56.6  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.253379  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1766  glycoside hydrolase family protein  25.9 
 
 
823 aa  52.8  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0138478  normal  0.386412 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2734  glycoside hydrolase family protein  26.01 
 
 
394 aa  52.8  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2960  Membrane-anchored protein predicted to be involved in regulation of amylopullulanase  37.25 
 
 
228 aa  52  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0302  Alpha-amylase  25.56 
 
 
407 aa  52.4  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.526182  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1264  glycoside hydrolase family protein  25.71 
 
 
791 aa  50.1  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7156  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  24.77 
 
 
1132 aa  50.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0565327  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0171  Alpha-amylase  29.95 
 
 
448 aa  48.5  0.0007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.400898  normal  0.121411 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0601  Alpha-amylase  24.77 
 
 
407 aa  47.8  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0791  glycoside hydrolase family protein  23.7 
 
 
598 aa  47.8  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1916  glycoside hydrolase family 57  24.87 
 
 
812 aa  46.6  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.900625  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0011  Alpha-amylase  26.34 
 
 
580 aa  46.6  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.890558  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0433  glycoside hydrolase family 57  22.32 
 
 
514 aa  47  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.188798  hitchhiker  0.0014488 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0849  glycoside hydrolase family protein  26.16 
 
 
813 aa  46.2  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1300  hypothetical protein  30.61 
 
 
249 aa  46.2  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0953  alpha amylase, catalytic region  22.62 
 
 
814 aa  46.6  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0761659  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1966  Alpha-amylase  22.29 
 
 
447 aa  46.2  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0717936  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0255  Alpha-amylase  23.5 
 
 
495 aa  45.8  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.84105  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1094  hypothetical protein  26.67 
 
 
525 aa  45.8  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2048  glycoside hydrolase family protein  26.4 
 
 
816 aa  45.1  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.686637  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>