15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0976 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0976  pullulanase  100 
 
 		 379 aa  758    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.853358 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1899  pullulanase  79.69 
 
 		 390 aa  632  1e-180  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0915  pullulanase  76.74 
 
 		 386 aa  606  9.999999999999999e-173  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.521806  normal  0.517446 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1416  pullulanase  70.28 
 
 		 386 aa  529  1e-149  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1616  glycoside hydrolase family protein  38.85 
 
 		 1006 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1866  glycoside hydrolase family protein  34.64 
 
 		 1000 aa  123  4e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0985  glycoside hydrolase family protein  29.95 
 
 		 994 aa  123  5e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.369995  normal  0.376092 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0676  pullulanase  28.06 
 
 		 267 aa  84  0.000000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0803  glycoside hydrolase family protein  27.66 
 
 		 1162 aa  75.5  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16030  Membrane-anchored protein predicted to be involved in regulation of amylopullulanase  26.12 
 
 		 313 aa  66.2  0.0000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0675  glycoside hydrolase family 57  27.24 
 
 		 1042 aa  64.3  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1616  glycoside hydrolase family 13 protein  24.9 
 
 		 663 aa  54.3  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4286  membrane-anchored protein  39.47 
 
 		 267 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4133  membrane-anchored protein  39.47 
 
 		 267 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4264  membrane-anchored protein  38.16 
 
 		 267 aa  50.4  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>