20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_4133 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_4133  membrane-anchored protein  100 
 
 
267 aa  548  1e-155  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4286  membrane-anchored protein  96.25 
 
 
267 aa  507  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4264  membrane-anchored protein  96.25 
 
 
267 aa  506  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0676  pullulanase  34.8 
 
 
267 aa  132  5e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0675  glycoside hydrolase family 57  34.63 
 
 
1042 aa  108  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1866  glycoside hydrolase family protein  32.44 
 
 
1000 aa  92.8  6e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1616  glycoside hydrolase family protein  30.68 
 
 
1006 aa  89.4  6e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0985  glycoside hydrolase family protein  31.25 
 
 
994 aa  83.6  0.000000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.369995  normal  0.376092 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0803  glycoside hydrolase family protein  26.32 
 
 
1162 aa  70.5  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16030  Membrane-anchored protein predicted to be involved in regulation of amylopullulanase  28.1 
 
 
313 aa  67  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1616  glycoside hydrolase family 13 protein  30.47 
 
 
663 aa  56.6  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2960  Membrane-anchored protein predicted to be involved in regulation of amylopullulanase  31.06 
 
 
228 aa  55.8  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1460  Protein of unknown function DUF2223  37.35 
 
 
1255 aa  53.1  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0976  pullulanase  39.47 
 
 
379 aa  52.4  0.000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.853358 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1899  pullulanase  34.69 
 
 
390 aa  51.6  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7156  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  32.67 
 
 
1132 aa  50.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0565327  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0327  Protein of unknown function DUF2223  28.37 
 
 
273 aa  49.7  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.590308 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1300  hypothetical protein  33.77 
 
 
249 aa  47.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0915  pullulanase  38.16 
 
 
386 aa  47.8  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.521806  normal  0.517446 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1416  pullulanase  35.53 
 
 
386 aa  43.1  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>