19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2960 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2960  Membrane-anchored protein predicted to be involved in regulation of amylopullulanase  100 
 
 		 228 aa  460  9.999999999999999e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0327  Protein of unknown function DUF2223  67.53 
 
 		 273 aa  306  2.0000000000000002e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.590308 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0803  glycoside hydrolase family protein  29.33 
 
 		 1162 aa  82  0.000000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1300  hypothetical protein  34.78 
 
 		 249 aa  81.3  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16030  Membrane-anchored protein predicted to be involved in regulation of amylopullulanase  27.96 
 
 		 313 aa  69.7  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1616  glycoside hydrolase family 13 protein  26.27 
 
 		 663 aa  68.6  0.00000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0675  glycoside hydrolase family 57  36.45 
 
 		 1042 aa  59.7  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0676  pullulanase  35.09 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0985  glycoside hydrolase family protein  32.59 
 
 		 994 aa  57  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.369995  normal  0.376092 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4286  membrane-anchored protein  31.82 
 
 		 267 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4264  membrane-anchored protein  31.06 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4133  membrane-anchored protein  31.06 
 
 		 267 aa  55.5  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1866  glycoside hydrolase family protein  37.25 
 
 		 1000 aa  52  0.000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1616  glycoside hydrolase family protein  39.05 
 
 		 1006 aa  49.7  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1428  alpha amylase catalytic region  26.6 
 
 		 838 aa  49.3  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000263704  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1416  pullulanase  41.33 
 
 		 386 aa  48.5  0.00009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0953  alpha amylase, catalytic region  23.24 
 
 		 814 aa  42.4  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0761659  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0915  pullulanase  38.67 
 
 		 386 aa  42.4  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.521806  normal  0.517446 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0976  pullulanase  38.67 
 
 		 379 aa  41.6  0.01  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.853358 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>