79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1616 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_0985  glycoside hydrolase family protein  71.31 
 
 		 994 aa  1499    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.369995  normal  0.376092 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1616  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 1006 aa  2055    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1866  glycoside hydrolase family protein  74.87 
 
 		 1000 aa  1508    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0675  glycoside hydrolase family 57  27.51 
 
 		 1042 aa  336  1e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0803  glycoside hydrolase family protein  33.77 
 
 		 1162 aa  286  2.0000000000000002e-75  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0856  glycoside hydrolase family protein  33.05 
 
 		 732 aa  273  1e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3177  glycoside hydrolase family protein  31.48 
 
 		 734 aa  259  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.392002 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0734  glycoside hydrolase family protein  34.17 
 
 		 1022 aa  251  5e-65  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.983175  normal  0.257164 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3464  glycoside hydrolase family 57  31.62 
 
 		 728 aa  247  6e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3255  hypothetical protein  30.83 
 
 		 729 aa  247  8e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0408  glycoside hydrolase family 57  31.89 
 
 		 729 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3401  glycoside hydrolase family 57  32.11 
 
 		 728 aa  244  5e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0999  glycoside hydrolase family 57  29.08 
 
 		 674 aa  237  7e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0027  glycoside hydrolase family protein  31.94 
 
 		 731 aa  237  9e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0131  glycoside hydrolase family protein  30.22 
 
 		 726 aa  234  7.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0840945  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0149  glycoside hydrolase family 57  30.05 
 
 		 726 aa  233  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00221085  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0138  glycoside hydrolase family 57  29.88 
 
 		 726 aa  231  4e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.806114  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2965  glycoside hydrolase family 57  28.57 
 
 		 749 aa  223  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.993077  normal  0.662325 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3440  family 57 glycoside hydrolase  30.3 
 
 		 744 aa  221  6e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3153  glycoside hydrolase family 57  28.4 
 
 		 749 aa  221  7e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0770  glycoside hydrolase family 57  28.52 
 
 		 829 aa  219  1e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0135  glycoside hydrolase family protein  29.43 
 
 		 722 aa  214  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000920685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2957  alpha-mannosidase  29.83 
 
 		 695 aa  210  9e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4047  glycoside hydrolase family 57  29.25 
 
 		 747 aa  208  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.422577 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1516  glycoside hydrolase family protein  29.31 
 
 		 759 aa  207  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.757577  normal  0.533903 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3035  glycoside hydrolase family protein  28.57 
 
 		 744 aa  206  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2072  glycoside hydrolase, family 57  28.34 
 
 		 577 aa  197  7e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1369  glycoside hydrolase family protein  28.92 
 
 		 582 aa  197  1e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4927  glycoside hydrolase family 57  28.94 
 
 		 743 aa  194  6e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.269999  normal  0.543005 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0509  glycoside hydrolase family protein  27.95 
 
 		 575 aa  184  6e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1528  glycoside hydrolase family 57  28.02 
 
 		 580 aa  183  1e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000278955 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2060  glycosy hydrolase family protein  26.82 
 
 		 574 aa  183  2e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.725097  normal  0.224311 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1107  glycoside hydrolase family protein  28.03 
 
 		 580 aa  178  4e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.185203  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2839  glycosyl hydrolase, family 57  27.24 
 
 		 568 aa  172  4e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1432  glycoside hydrolase family protein  26.32 
 
 		 570 aa  172  4e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2460  glycoside hydrolase family 57  27.24 
 
 		 568 aa  172  4e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0777  glycoside hydrolase family 57  27.59 
 
 		 566 aa  170  1e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0960  glycoside hydrolase family protein  26.98 
 
 		 584 aa  169  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285068 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0719  glycoside hydrolase family protein  27.35 
 
 		 566 aa  160  1e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0584  glycoside hydrolase family protein  26.33 
 
 		 551 aa  159  4e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0976  pullulanase  35.29 
 
 		 379 aa  141  7.999999999999999e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.853358 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1899  pullulanase  32.8 
 
 		 390 aa  140  1e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0915  pullulanase  32.45 
 
 		 386 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.521806  normal  0.517446 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1416  pullulanase  31.71 
 
 		 386 aa  105  4e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1616  glycoside hydrolase family 13 protein  31.25 
 
 		 663 aa  100  9e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0676  pullulanase  29.46 
 
 		 267 aa  95.5  4e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2138  glycoside hydrolase family 57  27.31 
 
 		 902 aa  94  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.205932  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4133  membrane-anchored protein  30.4 
 
 		 267 aa  86.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4286  membrane-anchored protein  30.67 
 
 		 267 aa  87  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4264  membrane-anchored protein  30.49 
 
 		 267 aa  85.5  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16030  Membrane-anchored protein predicted to be involved in regulation of amylopullulanase  25.7 
 
 		 313 aa  85.1  0.000000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0932  glycoside hydrolase family protein  24.66 
 
 		 1187 aa  77.8  0.0000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.26895  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1460  Protein of unknown function DUF2223  31.08 
 
 		 1255 aa  77  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1371  glycoside hydrolase family protein  27.23 
 
 		 606 aa  74.7  0.000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0199  glycoside hydrolase family protein  32.72 
 
 		 485 aa  63.5  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.400833 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1236  glycoside hydrolase family protein  32.04 
 
 		 472 aa  62.8  0.00000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0135  Alpha-amylase  26.91 
 
 		 518 aa  57.4  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0672  glycoside hydrolase family protein  29.89 
 
 		 485 aa  57.4  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.565437 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0536  Alpha-amylase  24.77 
 
 		 407 aa  56.6  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0183  glycoside hydrolase family protein  31.03 
 
 		 471 aa  57  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00355516  normal  0.949853 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0210  glycoside hydrolase family protein  27.36 
 
 		 609 aa  56.2  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.044129  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1383  Alpha-amylase  26.46 
 
 		 407 aa  55.5  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.253379  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2765  glycoside hydrolase family 57  26.63 
 
 		 766 aa  54.3  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000129952  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1766  glycoside hydrolase family protein  27.33 
 
 		 823 aa  53.5  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0138478  normal  0.386412 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2118  hypothetical protein  26.25 
 
 		 407 aa  51.6  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7156  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  24.68 
 
 		 1132 aa  51.6  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0565327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2960  Membrane-anchored protein predicted to be involved in regulation of amylopullulanase  39.05 
 
 		 228 aa  49.7  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0302  Alpha-amylase  24.22 
 
 		 407 aa  49.3  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.526182  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0601  Alpha-amylase  24.42 
 
 		 407 aa  48.5  0.0007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1264  glycoside hydrolase family protein  26.24 
 
 		 791 aa  48.1  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2734  glycoside hydrolase family protein  29.46 
 
 		 394 aa  48.1  0.0009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2244  4-alpha-glucanotransferase  24 
 
 		 706 aa  47.4  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0538  alpha-amylase  26.87 
 
 		 398 aa  47.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1966  Alpha-amylase  22.42 
 
 		 447 aa  48.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0717936  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0791  glycoside hydrolase family protein  23.18 
 
 		 598 aa  47.8  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0896  4-alpha-glucanotransferase  21.66 
 
 		 686 aa  46.6  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.252136  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1300  hypothetical protein  31 
 
 		 249 aa  46.6  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0849  glycoside hydrolase family protein  24.75 
 
 		 813 aa  46.6  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1831  glycoside hydrolase family 57  25.53 
 
 		 812 aa  44.7  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.699985  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>