More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1828 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01271  predicted antimicrobial peptide transporter subunit  99.26 
 
 		 547 aa  1110    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2352  extracellular solute-binding protein family 5  99.26 
 
 		 547 aa  1110    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2613  extracellular solute-binding protein family 5  72.91 
 
 		 562 aa  840    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0942045  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1530  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  99.44 
 
 		 547 aa  1110    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.414717  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2331  extracellular solute-binding protein  99.44 
 
 		 547 aa  1110    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.815677 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2342  extracellular solute-binding protein family 5  75.38 
 
 		 580 aa  845    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1828  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  100 
 
 		 539 aa  1116    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.011145 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1816  peptide transport periplasmic protein SapA  90.2 
 
 		 549 aa  994    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.440252  hitchhiker  0.00000000112139 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1878  peptide transport periplasmic protein SapA  90.2 
 
 		 557 aa  994    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00804887 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1784  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  77.3 
 
 		 547 aa  837    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1640  peptide transport periplasmic protein SapA  90.2 
 
 		 549 aa  994    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000341731 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2171  extracellular solute-binding protein  86.27 
 
 		 546 aa  951    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0470091 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2629  extracellular solute-binding protein  78.34 
 
 		 550 aa  865    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.553559  normal  0.405199 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01282  hypothetical protein  99.26 
 
 		 547 aa  1110    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.856831  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1408  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  99.26 
 
 		 547 aa  1110    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1892  extracellular solute-binding protein  77.3 
 
 		 547 aa  837    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.110335  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1458  peptide transport periplasmic protein SapA  90.2 
 
 		 549 aa  993    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.483006  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1817  peptide transport periplasmic protein SapA  90.02 
 
 		 549 aa  1017    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.690019  normal  0.173891 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1501  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  99.44 
 
 		 547 aa  1110    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1718  extracellular solute-binding protein family 5  76.08 
 
 		 581 aa  840    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.264997  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1752  extracellular solute-binding protein family 5  73.26 
 
 		 582 aa  833    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2540  peptide transport periplasmic protein precursor  77.15 
 
 		 548 aa  831    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1935  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  99.07 
 
 		 539 aa  1103    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.101699 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01870  hypothetical protein  45.03 
 
 		 539 aa  464  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0479  peptide transport periplasmic protein precursor SapA  43.81 
 
 		 541 aa  459  9.999999999999999e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003816  peptide transport periplasmic protein SapA  43.66 
 
 		 539 aa  459  9.999999999999999e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2484  extracellular solute-binding protein  43.03 
 
 		 541 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0213722 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1604  extracellular solute-binding protein  43.03 
 
 		 525 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1638  extracellular solute-binding protein  43.03 
 
 		 525 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.547791 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2739  extracellular solute-binding protein family 5  43.03 
 
 		 541 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.941667  normal  0.188577 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2552  extracellular solute-binding protein  42.63 
 
 		 541 aa  457  1e-127  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0329561 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2650  acetate kinase  43.22 
 
 		 541 aa  456  1e-127  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.76691 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1615  extracellular solute-binding protein  42.83 
 
 		 541 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.577375  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1500  extracellular solute-binding protein  42.91 
 
 		 541 aa  443  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1805  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  41.85 
 
 		 525 aa  443  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1235  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  43.34 
 
 		 542 aa  442  1e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.650831  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1285  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  43.18 
 
 		 540 aa  441  9.999999999999999e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2498  extracellular solute-binding protein  42.4 
 
 		 547 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.228611  normal  0.10844 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3006  extracellular solute-binding protein  39.42 
 
 		 544 aa  434  1e-120  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1552  extracellular solute-binding protein  40.12 
 
 		 551 aa  430  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560356 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2671  extracellular solute-binding protein  41.2 
 
 		 542 aa  430  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.699901  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2482  extracellular solute-binding protein  41.55 
 
 		 582 aa  423  1e-117  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0259131  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02835  putative ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  37.75 
 
 		 578 aa  414  1e-114  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3775  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  40.08 
 
 		 556 aa  411  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2580  extracellular solute-binding protein  40.32 
 
 		 541 aa  409  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3102  extracellular solute-binding protein  39.68 
 
 		 549 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.522775  hitchhiker  0.0000411022 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4098  extracellular solute-binding protein family 5  37.33 
 
 		 535 aa  385  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0067  extracellular solute-binding protein  37.48 
 
 		 542 aa  386  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3231  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  36.71 
 
 		 532 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.704667  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1977  extracellular solute-binding protein  37.35 
 
 		 506 aa  383  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.719795 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0594  peptide ABC transporter, periplasmic-binding protein  36.3 
 
 		 562 aa  384  1e-105  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.564656  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3431  extracellular solute-binding protein  36.47 
 
 		 531 aa  384  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000878954 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3969  extracellular solute-binding protein  36.71 
 
 		 532 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3907  extracellular solute-binding protein family 5  36.94 
 
 		 535 aa  380  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1671  extracellular solute-binding protein  37.7 
 
 		 538 aa  382  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.901467 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3828  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  35.94 
 
 		 526 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.808847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3950  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  35.74 
 
 		 526 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4912  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  35.94 
 
 		 535 aa  376  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3906  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  35.74 
 
 		 526 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.938997 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3842  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  35.74 
 
 		 526 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03395  dipeptide transporter  35.74 
 
 		 535 aa  375  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0168  4-phytase  35.74 
 
 		 535 aa  375  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3744  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  35.74 
 
 		 535 aa  375  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03346  hypothetical protein  35.74 
 
 		 535 aa  375  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0049  extracellular solute-binding protein family 5  36.15 
 
 		 535 aa  373  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.46848  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0171  4-phytase  35.74 
 
 		 535 aa  375  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4037  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  35.74 
 
 		 535 aa  375  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4010  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  35.74 
 
 		 526 aa  375  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3863  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  35.74 
 
 		 535 aa  375  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2505  extracellular solute-binding protein family 5  37.85 
 
 		 531 aa  375  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5114  ABC transporter periplasmic binding protein  35.92 
 
 		 533 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5110  ABC transporter periplasmic binding protein  36.06 
 
 		 537 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.321263  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0138  extracellular solute-binding protein  35.76 
 
 		 535 aa  372  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4056  periplasmic dipeptide transport protein  35.36 
 
 		 535 aa  370  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4075  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  35.36 
 
 		 535 aa  370  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0088  4-phytase  35.36 
 
 		 535 aa  370  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.534677  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2411  extracellular solute-binding protein family 5  36.85 
 
 		 531 aa  369  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.334082  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0329  extracellular solute-binding protein  36.9 
 
 		 531 aa  367  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  0.0616043 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0044  extracellular solute-binding protein family 5  35.36 
 
 		 535 aa  368  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58350  putative binding protein component of ABC transpor  35.45 
 
 		 537 aa  364  2e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58390  putative binding protein component of ABC transpor  35.48 
 
 		 533 aa  364  2e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2930  extracellular solute-binding protein family 5  36.45 
 
 		 531 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.892948  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1531  extracellular solute-binding protein family 5  36.06 
 
 		 531 aa  362  9e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0184  extracellular solute-binding protein  34.96 
 
 		 535 aa  362  1e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.507506 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0816  extracellular solute-binding protein  37.43 
 
 		 533 aa  361  2e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0841  extracellular solute-binding protein  35.28 
 
 		 531 aa  359  9e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.960995  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4557  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  36.63 
 
 		 535 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1582  extracellular solute-binding protein  35.79 
 
 		 531 aa  355  1e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264898  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0815  extracellular solute-binding protein  35.05 
 
 		 532 aa  352  1e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.17042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0845  extracellular solute-binding protein  34.91 
 
 		 532 aa  350  5e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4234  extracellular solute-binding protein  36.24 
 
 		 535 aa  350  5e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4293  extracellular solute-binding protein  34.13 
 
 		 541 aa  350  5e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.5263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3508  extracellular solute-binding protein  36.83 
 
 		 553 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360798 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2914  extracellular solute-binding protein  35.29 
 
 		 543 aa  346  5e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0114  extracellular solute-binding protein  34.09 
 
 		 530 aa  345  8e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4558  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein, putative  33.92 
 
 		 540 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.44901  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4568  extracellular solute-binding protein  36.29 
 
 		 553 aa  344  2e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0928  extracellular solute-binding protein  33.03 
 
 		 541 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0924  extracellular solute-binding protein  33.03 
 
 		 541 aa  343  5.999999999999999e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0490  extracellular solute-binding protein family 5  35.32 
 
 		 531 aa  343  7e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>