More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2800 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2800  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 630 aa  1296    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1093  extracellular solute-binding protein  95.67 
 
 		 629 aa  1087    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0361636  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1581  periplasmic oligopeptide-binding protein  31.37 
 
 		 543 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197291  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2405  extracellular solute-binding protein family 5  29.6 
 
 		 558 aa  188  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000900492  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1937  periplasmic oligopeptide-binding protein  31.59 
 
 		 543 aa  189  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.26638 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1874  periplasmic oligopeptide-binding protein  31.59 
 
 		 543 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1399  periplasmic oligopeptide-binding protein  31.59 
 
 		 543 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.530492  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01217  oligopeptide transporter subunit  29.6 
 
 		 543 aa  188  3e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.584763  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1729  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  29.6 
 
 		 558 aa  188  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.654548  normal  0.238122 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1391  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  29.6 
 
 		 543 aa  188  3e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768286  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01227  hypothetical protein  29.6 
 
 		 543 aa  188  3e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.595865  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1352  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  29.6 
 
 		 543 aa  188  3e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0153639  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2385  extracellular solute-binding protein  29.6 
 
 		 558 aa  188  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.190524  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1897  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  29.6 
 
 		 558 aa  187  4e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.340522  normal  0.197408 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1880  periplasmic oligopeptide-binding protein  31.37 
 
 		 543 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.558162 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1412  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  29.22 
 
 		 543 aa  183  9.000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.706367  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02892  predicted transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  29.09 
 
 		 535 aa  182  2e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.922865  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0680  extracellular solute-binding protein family 5  29.09 
 
 		 535 aa  182  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3198  putative binding protein  29.09 
 
 		 535 aa  182  2e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0677  putative binding protein  29.09 
 
 		 535 aa  182  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.682272 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02842  hypothetical protein  29.09 
 
 		 535 aa  182  2e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.81173  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07058  hypothetical protein  30.36 
 
 		 559 aa  181  2.9999999999999997e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001004  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  30.79 
 
 		 541 aa  181  2.9999999999999997e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4331  putative binding protein  28.88 
 
 		 535 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1471  periplasmic murein peptide-binding protein  31.9 
 
 		 537 aa  181  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.857837  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1653  periplasmic murein peptide-binding protein  31.68 
 
 		 537 aa  180  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0552012 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1865  periplasmic murein peptide-binding protein  31.68 
 
 		 537 aa  180  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529105  normal  0.987558 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1804  periplasmic murein peptide-binding protein  31.9 
 
 		 537 aa  180  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.048276  normal  0.542022 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3311  putative binding protein  28.88 
 
 		 535 aa  180  8e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.43332  normal  0.120975 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0418  extracellular solute-binding protein family 5  28.63 
 
 		 622 aa  179  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1803  periplasmic murein peptide-binding protein  31.68 
 
 		 537 aa  179  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00501366 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4685  extracellular solute-binding protein  31.83 
 
 		 532 aa  179  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.192999  normal  0.292705 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1985  extracellular solute-binding protein family 5  29.03 
 
 		 545 aa  178  3e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2385  extracellular solute-binding protein family 5  31.25 
 
 		 594 aa  177  4e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0609  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  30.98 
 
 		 543 aa  177  4e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1588  extracellular solute-binding protein family 5  28.15 
 
 		 533 aa  177  5e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2070  extracellular solute-binding protein  28.25 
 
 		 545 aa  176  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.174491  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1405  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  30.58 
 
 		 532 aa  176  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1960  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  28.25 
 
 		 545 aa  175  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.390049  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2028  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein  29.57 
 
 		 544 aa  175  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2163  periplasmic oligopeptide-binding protein precursor  28.46 
 
 		 525 aa  175  1.9999999999999998e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.037967  normal  0.0426294 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2834  extracellular solute-binding protein family 5  32.63 
 
 		 526 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.360597 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1984  extracellular solute-binding protein family 5  28.52 
 
 		 556 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0019  extracellular solute-binding protein  29.64 
 
 		 533 aa  174  5.999999999999999e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4404  extracellular solute-binding protein  30.79 
 
 		 536 aa  173  9e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01307  murein tripeptide (L-ala-gamma-D-glutamyl-meso-DAP) transporter subunit  31.48 
 
 		 537 aa  172  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.466837  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2316  extracellular solute-binding protein family 5  31.48 
 
 		 537 aa  172  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.151568  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1792  periplasmic murein peptide-binding protein  31.25 
 
 		 537 aa  172  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2285  extracellular solute-binding protein family 5  30.8 
 
 		 556 aa  172  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.946227  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1542  periplasmic murein peptide-binding protein  31.48 
 
 		 537 aa  172  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1446  periplasmic murein peptide-binding protein  31.48 
 
 		 537 aa  172  1e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2295  extracellular solute-binding protein  31.48 
 
 		 537 aa  172  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2961  extracellular solute-binding protein  29.52 
 
 		 541 aa  172  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01317  hypothetical protein  31.48 
 
 		 537 aa  172  1e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.441272  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1977  periplasmic murein peptide-binding protein  31.26 
 
 		 537 aa  172  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.526776 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2286  extracellular solute-binding protein family 5  29.33 
 
 		 545 aa  172  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.137787  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  29.57 
 
 		 520 aa  172  2e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1569  periplasmic murein peptide-binding protein  31.48 
 
 		 537 aa  172  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2701  extracellular solute-binding protein  30.42 
 
 		 545 aa  171  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.301975  hitchhiker  0.00251286 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02949  hypothetical protein  29.23 
 
 		 555 aa  171  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1770  extracellular solute-binding protein family 5  29.76 
 
 		 560 aa  171  4e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2148  extracellular solute-binding protein  31.68 
 
 		 538 aa  171  5e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2302  extracellular solute-binding protein  28.17 
 
 		 544 aa  171  5e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00365913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2654  extracellular solute-binding protein family 5  27.93 
 
 		 544 aa  169  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.411058  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1731  extracellular solute-binding protein family 5  28.04 
 
 		 539 aa  169  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.308556  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3103  extracellular solute-binding protein family 5  31.57 
 
 		 526 aa  169  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.529212  normal  0.177978 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3842  extracellular solute-binding protein family 5  27.56 
 
 		 535 aa  168  2e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.298652  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002959  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  29.62 
 
 		 558 aa  169  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0044  extracellular solute-binding protein family 5  27.85 
 
 		 538 aa  168  2.9999999999999998e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2195  extracellular solute-binding protein family 5  29.31 
 
 		 547 aa  167  8e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.337162  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0020  extracellular solute-binding protein  28.54 
 
 		 558 aa  166  9e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3812  extracellular solute-binding protein family 5  30.26 
 
 		 528 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0629305 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1954  extracellular solute-binding protein family 5  29.19 
 
 		 547 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2601  extracellular solute-binding protein family 5  29.18 
 
 		 538 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2372  extracellular solute-binding protein family 5  26.92 
 
 		 543 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.220552  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3462  extracellular solute-binding protein  30.84 
 
 		 552 aa  165  3e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0173201  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1698  extracellular solute-binding protein family 5  29.36 
 
 		 537 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.509853  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1906  extracellular solute-binding protein  29.55 
 
 		 538 aa  163  7e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1798  murein tripeptide ABC transporter, periplasmic murein peptide-binding protein  29.55 
 
 		 538 aa  164  7e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2389  murein tripeptide ABC transporter periplasmic murein peptide-binding protein  29.55 
 
 		 538 aa  163  7e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.536818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2702  extracellular solute-binding protein  27.7 
 
 		 545 aa  163  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.108728  hitchhiker  0.000845971 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0756  extracellular solute-binding protein family 5  27.62 
 
 		 549 aa  162  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2435  extracellular solute-binding protein  27.44 
 
 		 549 aa  162  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.882532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1612  extracellular solute-binding protein family 5  25.5 
 
 		 549 aa  160  6e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3050  extracellular solute-binding protein  28.69 
 
 		 539 aa  159  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.423075 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0067  extracellular solute-binding protein family 5  27.84 
 
 		 532 aa  159  2e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0021  extracellular solute-binding protein  29.4 
 
 		 561 aa  159  2e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1913  extracellular solute-binding protein family 5  28.21 
 
 		 535 aa  158  3e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.988615  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0038  extracellular solute-binding protein  30.25 
 
 		 533 aa  158  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830083  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4639  extracellular solute-binding protein family 5  30.77 
 
 		 532 aa  158  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0699  extracellular solute-binding protein family 5  28.31 
 
 		 590 aa  158  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2024  extracellular solute-binding protein family 5  27.94 
 
 		 536 aa  157  6e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000427312  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2437  extracellular solute-binding protein  28.38 
 
 		 554 aa  157  7e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0537  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  29.35 
 
 		 525 aa  156  9e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.75807  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1328  extracellular solute-binding protein  28.84 
 
 		 534 aa  156  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1569  extracellular solute-binding protein  28.84 
 
 		 534 aa  155  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.199164  normal  0.0577205 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1483  extracellular solute-binding protein  27.58 
 
 		 542 aa  156  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4272  extracellular solute-binding protein  31 
 
 		 532 aa  156  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0380913  normal  0.650765 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7030  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  29.07 
 
 		 537 aa  155  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.394274  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2742  extracellular solute-binding protein family 5  26.81 
 
 		 541 aa  154  4e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>