More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2437 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2437  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 554 aa  1110    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2438  extracellular solute-binding protein  43.42 
 
 		 526 aa  381  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2435  extracellular solute-binding protein  42.29 
 
 		 549 aa  371  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.882532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1982  extracellular solute-binding protein  40.15 
 
 		 543 aa  355  1e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.17175 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2028  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein  36.28 
 
 		 544 aa  343  5.999999999999999e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0038  extracellular solute-binding protein  36.07 
 
 		 533 aa  276  9e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830083  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1588  extracellular solute-binding protein family 5  31.24 
 
 		 533 aa  275  1.0000000000000001e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2027  periplasmic oligopeptide-binding protein precursor  33.15 
 
 		 555 aa  275  2.0000000000000002e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.197641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4685  extracellular solute-binding protein  33.92 
 
 		 532 aa  272  1e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.192999  normal  0.292705 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2961  extracellular solute-binding protein  33.08 
 
 		 541 aa  272  1e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0609  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  31.95 
 
 		 543 aa  270  4e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1913  extracellular solute-binding protein family 5  31.48 
 
 		 535 aa  266  7e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.988615  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2024  extracellular solute-binding protein family 5  31.66 
 
 		 536 aa  263  4e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000427312  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1405  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  32.75 
 
 		 532 aa  263  6.999999999999999e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002959  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  33.81 
 
 		 558 aa  262  1e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0592  extracellular solute-binding protein  32.96 
 
 		 545 aa  262  1e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0469  extracellular solute-binding protein family 5  31 
 
 		 552 aa  260  5.0000000000000005e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0132  extracellular solute-binding protein  35.86 
 
 		 529 aa  260  5.0000000000000005e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.229364  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1481  ABC oligopeptide transporter, perplasmic substrate-binding protein OppA  35.86 
 
 		 529 aa  259  6e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.869658  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2170  extracellular solute-binding protein family 5  32.86 
 
 		 535 aa  259  1e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02949  hypothetical protein  31.41 
 
 		 555 aa  258  2e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2890  extracellular solute-binding protein  36.06 
 
 		 529 aa  258  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0332  extracellular solute-binding protein  33.92 
 
 		 523 aa  257  4e-67  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3311  putative binding protein  32.44 
 
 		 535 aa  256  6e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.43332  normal  0.120975 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02892  predicted transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  32.44 
 
 		 535 aa  256  7e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.922865  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0680  extracellular solute-binding protein family 5  32.44 
 
 		 535 aa  256  7e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3198  putative binding protein  32.44 
 
 		 535 aa  256  7e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0677  putative binding protein  32.44 
 
 		 535 aa  256  7e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.682272 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02842  hypothetical protein  32.44 
 
 		 535 aa  256  7e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.81173  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4331  putative binding protein  32.06 
 
 		 535 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1946  oligopeptide transport system permease protein B  33.33 
 
 		 554 aa  254  3e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3596  extracellular solute-binding protein  33.8 
 
 		 526 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3812  extracellular solute-binding protein family 5  34.66 
 
 		 528 aa  252  1e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0629305 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07058  hypothetical protein  31.52 
 
 		 559 aa  251  2e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2023  extracellular solute-binding protein family 5  32.46 
 
 		 531 aa  252  2e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0292401  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2601  extracellular solute-binding protein family 5  32.65 
 
 		 538 aa  251  3e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001004  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  32.33 
 
 		 541 aa  249  1e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2701  extracellular solute-binding protein  31.53 
 
 		 545 aa  247  4.9999999999999997e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.301975  hitchhiker  0.00251286 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0333  extracellular solute-binding protein  29.96 
 
 		 528 aa  246  6e-64  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.31964  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3016  extracellular solute-binding protein family 5  30.7 
 
 		 545 aa  246  6e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0244604  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1770  extracellular solute-binding protein family 5  31.36 
 
 		 560 aa  246  6.999999999999999e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0044  extracellular solute-binding protein family 5  29.96 
 
 		 538 aa  246  6.999999999999999e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1448  extracellular solute-binding protein family 5  31.25 
 
 		 535 aa  246  8e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2834  extracellular solute-binding protein family 5  30.66 
 
 		 526 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.360597 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0587  extracellular solute-binding protein family 5  29.68 
 
 		 534 aa  246  9.999999999999999e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1602  extracellular solute-binding protein family 5  29.87 
 
 		 534 aa  245  9.999999999999999e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3103  extracellular solute-binding protein family 5  30.66 
 
 		 526 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.529212  normal  0.177978 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2238  extracellular solute-binding protein family 5  31.77 
 
 		 534 aa  244  3e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00707838  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0586  extracellular solute-binding protein family 5  29.07 
 
 		 544 aa  244  3.9999999999999997e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3599  extracellular solute-binding protein  31.57 
 
 		 525 aa  243  6e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1646  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2611  extracellular solute-binding protein  31.32 
 
 		 544 aa  243  7e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.502409 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1483  extracellular solute-binding protein  32.03 
 
 		 542 aa  241  2e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2302  extracellular solute-binding protein  31.24 
 
 		 544 aa  241  2e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00365913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3462  extracellular solute-binding protein  33.08 
 
 		 552 aa  240  4e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0173201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1977  periplasmic murein peptide-binding protein  31.09 
 
 		 537 aa  239  1e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.526776 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2195  extracellular solute-binding protein family 5  31.39 
 
 		 547 aa  239  1e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.337162  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01307  murein tripeptide (L-ala-gamma-D-glutamyl-meso-DAP) transporter subunit  31.09 
 
 		 537 aa  238  2e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.466837  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2316  extracellular solute-binding protein family 5  31.09 
 
 		 537 aa  238  2e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.151568  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1446  periplasmic murein peptide-binding protein  31.09 
 
 		 537 aa  238  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01317  hypothetical protein  31.09 
 
 		 537 aa  238  2e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.441272  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2295  extracellular solute-binding protein  31.09 
 
 		 537 aa  238  2e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1542  periplasmic murein peptide-binding protein  31.09 
 
 		 537 aa  238  2e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1569  periplasmic murein peptide-binding protein  31.09 
 
 		 537 aa  238  2e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0537  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  31.39 
 
 		 525 aa  238  3e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.75807  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2743  extracellular solute-binding protein family 5  29.65 
 
 		 542 aa  238  3e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000076574  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3598  extracellular solute-binding protein  31.29 
 
 		 525 aa  237  5.0000000000000005e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000427863  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2319  extracellular solute-binding protein family 5  32.72 
 
 		 538 aa  236  6e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0190  extracellular solute-binding protein  28.08 
 
 		 533 aa  236  8e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2885  extracellular solute-binding protein  35.1 
 
 		 528 aa  236  8e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.128734  normal  0.843476 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1792  periplasmic murein peptide-binding protein  30.9 
 
 		 537 aa  236  9e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1984  extracellular solute-binding protein family 5  31.55 
 
 		 556 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0467  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  30.82 
 
 		 525 aa  235  1.0000000000000001e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1954  extracellular solute-binding protein family 5  32.38 
 
 		 547 aa  235  2.0000000000000002e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2285  extracellular solute-binding protein family 5  30.35 
 
 		 556 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.946227  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5343  extracellular solute-binding protein  35.69 
 
 		 535 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.220066  normal  0.0289508 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2000  extracellular solute-binding protein  29.78 
 
 		 550 aa  234  3e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003657  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  32.75 
 
 		 536 aa  234  4.0000000000000004e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0334  extracellular solute-binding protein  29.94 
 
 		 541 aa  234  5e-60  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.768653  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4639  extracellular solute-binding protein family 5  34.4 
 
 		 532 aa  233  9e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1803  periplasmic murein peptide-binding protein  31.07 
 
 		 537 aa  233  9e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00501366 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4404  extracellular solute-binding protein  30.11 
 
 		 536 aa  232  1e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1590  extracellular solute-binding protein family 5  30.33 
 
 		 530 aa  232  1e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0538  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  31.29 
 
 		 525 aa  231  2e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.461639  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2148  extracellular solute-binding protein  31.39 
 
 		 538 aa  231  2e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2999  extracellular solute-binding protein  33.2 
 
 		 549 aa  231  3e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.305947  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  28.14 
 
 		 536 aa  231  4e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1471  periplasmic murein peptide-binding protein  30.89 
 
 		 537 aa  231  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.857837  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0174  extracellular solute-binding protein  28.22 
 
 		 536 aa  230  5e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1865  periplasmic murein peptide-binding protein  30.7 
 
 		 537 aa  230  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529105  normal  0.987558 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1653  periplasmic murein peptide-binding protein  30.7 
 
 		 537 aa  230  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0552012 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2405  extracellular solute-binding protein family 5  30.47 
 
 		 558 aa  230  7e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000900492  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1985  extracellular solute-binding protein family 5  31.49 
 
 		 545 aa  229  7e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0177  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.2 
 
 		 529 aa  229  9e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.584873  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1804  periplasmic murein peptide-binding protein  30.89 
 
 		 537 aa  229  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.048276  normal  0.542022 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1735  extracellular solute-binding protein family 5  31.98 
 
 		 538 aa  229  1e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1897  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  30.28 
 
 		 558 aa  229  1e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.340522  normal  0.197408 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01227  hypothetical protein  30.28 
 
 		 543 aa  228  2e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.595865  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1729  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  30.28 
 
 		 558 aa  228  2e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.654548  normal  0.238122 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1352  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  30.28 
 
 		 543 aa  228  2e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0153639  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1412  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  30.02 
 
 		 543 aa  228  2e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.706367  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>