More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3275 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3275  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 570 aa  1137    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0712739  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7096  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  49.07 
 
 		 578 aa  563  1.0000000000000001e-159  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1954  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  44.76 
 
 		 567 aa  548  1e-155  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.754029 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2402  extracellular solute-binding protein family 5  46.51 
 
 		 566 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.951994 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0818  peptide/nickel transport system substrate-binding protein  45.54 
 
 		 568 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5593  extracellular solute-binding protein family 5  41.5 
 
 		 567 aa  450  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.38037 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3931  extracellular solute-binding protein  41.95 
 
 		 555 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0539387  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4005  extracellular solute-binding protein  41.95 
 
 		 555 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3946  extracellular solute-binding protein  42.12 
 
 		 554 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.436412  normal  0.0739925 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2258  extracellular solute-binding protein  40.76 
 
 		 558 aa  396  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.152339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11306  periplasmic oligopeptide-binding lipoprotein oppA  39.93 
 
 		 591 aa  393  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4433  extracellular solute-binding protein  39.89 
 
 		 550 aa  394  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.766057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8314  extracellular solute-binding protein family 5  39.25 
 
 		 576 aa  392  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0536  extracellular solute-binding protein family 5  36.91 
 
 		 565 aa  373  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08460  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  32.59 
 
 		 579 aa  310  2.9999999999999997e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0619  extracellular solute-binding protein family 5  35.05 
 
 		 551 aa  275  1.0000000000000001e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1251  extracellular solute-binding protein  28.65 
 
 		 580 aa  250  6e-65  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147859 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1116  extracellular solute-binding protein  29.32 
 
 		 581 aa  218  2e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.749385  normal  0.0404913 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7779  extracellular solute-binding protein family 5  27.83 
 
 		 597 aa  208  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.354248 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0917  extracellular solute-binding protein family 5  27.07 
 
 		 592 aa  200  5e-50  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.340529 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1835  extracellular solute-binding protein  27.02 
 
 		 563 aa  162  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00561184  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4014  extracellular solute-binding protein  26.01 
 
 		 569 aa  160  7e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3805  extracellular solute-binding protein family 5  25.36 
 
 		 590 aa  155  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0761  extracellular solute-binding protein family 5  24.95 
 
 		 604 aa  150  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.952848  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31140  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.27 
 
 		 586 aa  137  7.000000000000001e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31150  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.44 
 
 		 622 aa  136  8e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2164  extracellular solute-binding protein  30 
 
 		 599 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.10806 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1633  putative solute-binding dependent transport lipoprotein  25.72 
 
 		 585 aa  127  8.000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4039  extracellular solute-binding protein  34.23 
 
 		 624 aa  126  9e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.668084  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4114  extracellular solute-binding protein  34.23 
 
 		 624 aa  126  9e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4268  extracellular solute-binding protein  34.23 
 
 		 624 aa  126  9e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4539  extracellular solute-binding protein  37.68 
 
 		 608 aa  126  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0760  extracellular solute-binding protein family 5  26.15 
 
 		 566 aa  124  6e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.010503  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11191  lipoprotein lpqW  35.62 
 
 		 635 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0872  extracellular solute-binding protein  23.64 
 
 		 541 aa  119  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00426332  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4315  extracellular solute-binding protein family 5  29.72 
 
 		 603 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0499363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3330  extracellular solute-binding protein family 5  26 
 
 		 614 aa  115  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.424693  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2827  extracellular solute-binding protein  24.84 
 
 		 592 aa  114  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.320124  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4535  extracellular solute-binding protein family 5  27.11 
 
 		 567 aa  113  8.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4314  extracellular solute-binding protein family 5  23.23 
 
 		 606 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.986199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15570  extracellular solute-binding protein, family 5  23.53 
 
 		 619 aa  109  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0497629  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0785  extracellular solute-binding protein family 5  24 
 
 		 600 aa  107  4e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0510  extracellular solute-binding protein  24.17 
 
 		 510 aa  105  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0306064  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2749  extracellular solute-binding protein family 5  25.96 
 
 		 550 aa  103  6e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.954537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2944  extracellular solute-binding protein family 5  25.61 
 
 		 587 aa  103  9e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0305195 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  24.82 
 
 		 540 aa  102  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0093  extracellular solute-binding protein  26.86 
 
 		 604 aa  100  8e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26210  extracellular solute-binding protein, family 5  22.84 
 
 		 606 aa  99.8  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.825095  normal  0.282654 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7203  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  21.97 
 
 		 581 aa  97.4  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.120174  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2152  extracellular solute-binding protein  20.39 
 
 		 527 aa  95.5  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000101547  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5299  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  23.46 
 
 		 556 aa  94.7  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1660  extracellular solute-binding protein family 5  27.17 
 
 		 589 aa  92.4  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.299882  normal  0.183706 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0197  extracellular solute-binding protein  27.38 
 
 		 605 aa  91.7  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.386701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2402  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  24.48 
 
 		 538 aa  91.7  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0219  extracellular solute-binding protein  21.53 
 
 		 575 aa  90.9  6e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1797  extracellular solute-binding protein family 5  23.9 
 
 		 551 aa  90.9  6e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.645119  normal  0.0256709 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3501  extracellular solute-binding protein  23.06 
 
 		 639 aa  90.5  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000268642  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0145  extracellular solute-binding protein family 5  25.49 
 
 		 552 aa  90.5  8e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.602191 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3167  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  24.44 
 
 		 542 aa  90.5  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0208  extracellular solute-binding protein  20 
 
 		 575 aa  89.7  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0785  extracellular solute-binding protein  22.3 
 
 		 512 aa  90.1  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0600833  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0205  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  20.49 
 
 		 575 aa  89.4  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2657  extracellular solute-binding protein  22.5 
 
 		 617 aa  89  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000297428  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  24.77 
 
 		 559 aa  89.4  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0031  extracellular solute-binding protein family 5  26.14 
 
 		 547 aa  88.6  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.255435  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  25.91 
 
 		 544 aa  88.6  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1032  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  23.14 
 
 		 544 aa  88.2  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000591223  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1145  extracellular solute-binding protein family 5  24.85 
 
 		 622 aa  87.8  5e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0845067  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  25.33 
 
 		 546 aa  87.8  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5080  oligopeptide-binding protein OppA  20.6 
 
 		 575 aa  87.4  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0245  oligopeptide-binding protein OppA  20.6 
 
 		 575 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0551474  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  23.91 
 
 		 538 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  23.31 
 
 		 551 aa  86.3  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  24.3 
 
 		 539 aa  85.9  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  29.61 
 
 		 531 aa  84.7  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2032  ABC transporter, periplasmic binding protein  23.88 
 
 		 524 aa  84  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662418  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.14 
 
 		 538 aa  83.6  0.000000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12220  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.82 
 
 		 550 aa  83.6  0.000000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  24.71 
 
 		 544 aa  83.6  0.000000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3760  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein NikA  22.45 
 
 		 524 aa  83.6  0.000000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0939  extracellular solute-binding protein family 5  28.7 
 
 		 532 aa  83.2  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3496  extracellular solute-binding protein  25.4 
 
 		 590 aa  83.2  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2033  nickel ABC transporter, periplasmic nickel- binding protein  25.66 
 
 		 530 aa  83.2  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19910  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  24.5 
 
 		 589 aa  83.2  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000984023  hitchhiker  0.000242655 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2595  extracellular solute-binding protein family 5  24.61 
 
 		 589 aa  83.2  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.118312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  26.91 
 
 		 565 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0266  extracellular solute-binding protein family 5  20.52 
 
 		 575 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1012  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.87 
 
 		 492 aa  82.4  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622148  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1266  extracellular solute-binding protein  26.59 
 
 		 546 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.335203  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2375  twin-arginine translocation pathway signal  27.42 
 
 		 514 aa  82  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4611  extracellular solute-binding protein family 5  24.89 
 
 		 553 aa  82.8  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.596915 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6565  extracellular solute-binding protein  26.59 
 
 		 546 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0953437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0954  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.87 
 
 		 479 aa  82  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  24.54 
 
 		 509 aa  82  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1288  extracellular solute-binding protein  27.87 
 
 		 492 aa  81.6  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213997  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0351  nickel ABC transporter, periplasmic nickel- binding protein  19.22 
 
 		 532 aa  81.6  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6171  4-phytase  26.4 
 
 		 546 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.194184 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0804  nickel ABC transporter, nickel-binding protein, putative  23.08 
 
 		 526 aa  81.3  0.00000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0754  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  23.08 
 
 		 526 aa  81.3  0.00000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5370  extracellular solute-binding protein family 5  23.67 
 
 		 629 aa  81.3  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358498 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>