More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_08460 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_08460  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  100 
 
 		 579 aa  1176    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3275  extracellular solute-binding protein family 5  32.11 
 
 		 570 aa  312  1e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0712739  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1954  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  31.78 
 
 		 567 aa  307  4.0000000000000004e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.754029 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0818  peptide/nickel transport system substrate-binding protein  32.53 
 
 		 568 aa  304  4.0000000000000003e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7096  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  32.95 
 
 		 578 aa  298  2e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3931  extracellular solute-binding protein  33.14 
 
 		 555 aa  282  1e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0539387  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4005  extracellular solute-binding protein  33.14 
 
 		 555 aa  282  1e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3946  extracellular solute-binding protein  33.14 
 
 		 554 aa  278  2e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.436412  normal  0.0739925 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2402  extracellular solute-binding protein family 5  29.58 
 
 		 566 aa  278  2e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.951994 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2258  extracellular solute-binding protein  32.26 
 
 		 558 aa  273  5.000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.152339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11306  periplasmic oligopeptide-binding lipoprotein oppA  32.31 
 
 		 591 aa  268  1e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4433  extracellular solute-binding protein  33.14 
 
 		 550 aa  268  2e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.766057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5593  extracellular solute-binding protein family 5  32.31 
 
 		 567 aa  255  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.38037 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8314  extracellular solute-binding protein family 5  31.24 
 
 		 576 aa  245  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0536  extracellular solute-binding protein family 5  28.82 
 
 		 565 aa  229  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0619  extracellular solute-binding protein family 5  29.51 
 
 		 551 aa  224  4e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4014  extracellular solute-binding protein  26.75 
 
 		 569 aa  158  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1251  extracellular solute-binding protein  26.27 
 
 		 580 aa  157  4e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147859 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1116  extracellular solute-binding protein  25.34 
 
 		 581 aa  155  2e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.749385  normal  0.0404913 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1835  extracellular solute-binding protein  27.9 
 
 		 563 aa  154  5e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00561184  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3805  extracellular solute-binding protein family 5  26.99 
 
 		 590 aa  150  5e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31140  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.23 
 
 		 586 aa  144  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0917  extracellular solute-binding protein family 5  24.63 
 
 		 592 aa  140  7.999999999999999e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.340529 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7779  extracellular solute-binding protein family 5  23.53 
 
 		 597 aa  132  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.354248 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31150  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.68 
 
 		 622 aa  127  5e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0093  extracellular solute-binding protein  27.05 
 
 		 604 aa  120  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0760  extracellular solute-binding protein family 5  26.28 
 
 		 566 aa  114  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.010503  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15570  extracellular solute-binding protein, family 5  24.29 
 
 		 619 aa  113  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0497629  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0872  extracellular solute-binding protein  22.62 
 
 		 541 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00426332  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  24.77 
 
 		 540 aa  110  5e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26210  extracellular solute-binding protein, family 5  23.74 
 
 		 606 aa  108  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.825095  normal  0.282654 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0761  extracellular solute-binding protein family 5  26.43 
 
 		 604 aa  107  8e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.952848  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4314  extracellular solute-binding protein family 5  22.61 
 
 		 606 aa  105  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.986199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0785  extracellular solute-binding protein family 5  22.73 
 
 		 600 aa  105  3e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2657  extracellular solute-binding protein  25.48 
 
 		 617 aa  98.2  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000297428  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3501  extracellular solute-binding protein  25.54 
 
 		 639 aa  97.8  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000268642  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  24.68 
 
 		 559 aa  97.4  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  24.82 
 
 		 565 aa  97.1  9e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0351  nickel ABC transporter, periplasmic nickel- binding protein  25.64 
 
 		 532 aa  96.3  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3330  extracellular solute-binding protein family 5  24.62 
 
 		 614 aa  94.4  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.424693  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  23.3 
 
 		 546 aa  93.6  9e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.93 
 
 		 510 aa  92.4  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1633  putative solute-binding dependent transport lipoprotein  25.56 
 
 		 585 aa  92  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0197  extracellular solute-binding protein  24.42 
 
 		 605 aa  92.8  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.386701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4039  extracellular solute-binding protein  26.49 
 
 		 624 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.668084  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4114  extracellular solute-binding protein  26.49 
 
 		 624 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4315  extracellular solute-binding protein family 5  27.45 
 
 		 603 aa  92.4  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0499363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4268  extracellular solute-binding protein  26.49 
 
 		 624 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1273  extracellular solute-binding protein family 5  22.59 
 
 		 593 aa  92  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2164  extracellular solute-binding protein  25.56 
 
 		 599 aa  91.7  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.10806 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1837  extracellular solute-binding protein family 5  23.31 
 
 		 532 aa  90.9  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.350378  normal  0.136519 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3039  4-phytase  24.49 
 
 		 518 aa  90.5  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0937  extracellular solute-binding protein  26.09 
 
 		 586 aa  89.4  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2161  extracellular solute-binding protein family 5  23.09 
 
 		 532 aa  89.4  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.283164 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4539  extracellular solute-binding protein  25.73 
 
 		 608 aa  88.6  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  24.12 
 
 		 576 aa  87.4  6e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0510  extracellular solute-binding protein  24.52 
 
 		 510 aa  87  8e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0306064  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.57 
 
 		 566 aa  87  8e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.70881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5299  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  22.37 
 
 		 556 aa  86.3  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1518  peptide ABC transporter, peptide-binding protein  23.87 
 
 		 538 aa  86.7  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000374669  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7203  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  21.78 
 
 		 581 aa  86.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.120174  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0132  extracellular solute-binding protein  25.54 
 
 		 532 aa  86.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  22.43 
 
 		 539 aa  86.7  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0244  extracellular solute-binding protein family 5  26.74 
 
 		 575 aa  85.5  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.794885  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5080  oligopeptide-binding protein OppA  23.92 
 
 		 575 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2798  extracellular solute-binding protein family 5  25.5 
 
 		 557 aa  86.3  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0208  extracellular solute-binding protein  23.31 
 
 		 575 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0245  oligopeptide-binding protein OppA  23.92 
 
 		 575 aa  85.1  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0551474  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0205  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  22.76 
 
 		 575 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0566  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  20.81 
 
 		 593 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0469  extracellular solute-binding protein family 5  24.96 
 
 		 554 aa  84.7  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.208856 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0631  extracellular solute-binding protein family 5  28.53 
 
 		 631 aa  84.3  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00116155  normal  0.250691 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  20.87 
 
 		 551 aa  83.6  0.000000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0724  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  21.38 
 
 		 593 aa  83.6  0.000000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  24.27 
 
 		 523 aa  82.8  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4764  extracellular solute-binding protein  23.82 
 
 		 539 aa  83.2  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1797  extracellular solute-binding protein family 5  25.52 
 
 		 551 aa  83.6  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.645119  normal  0.0256709 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4535  extracellular solute-binding protein family 5  23.75 
 
 		 567 aa  83.2  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0391  extracellular solute-binding protein  26.9 
 
 		 522 aa  83.2  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  23.41 
 
 		 538 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2032  ABC transporter, periplasmic binding protein  28.82 
 
 		 524 aa  82.4  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662418  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2258  extracellular solute-binding protein family 5  24.86 
 
 		 591 aa  82.4  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000752385  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3973  extracellular solute-binding protein family 5  24.41 
 
 		 549 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0320  extracellular solute-binding protein  24.19 
 
 		 556 aa  82  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.144423 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11191  lipoprotein lpqW  28.33 
 
 		 635 aa  82  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4290  extracellular solute-binding protein  24.38 
 
 		 530 aa  82  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00787986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1578  extracellular solute-binding protein  25.95 
 
 		 595 aa  81.3  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.259952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2944  extracellular solute-binding protein family 5  24.26 
 
 		 587 aa  81.3  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0305195 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0106  extracellular solute-binding protein family 5  23.78 
 
 		 533 aa  80.9  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0909337  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0947  extracellular solute-binding protein family 5  24.69 
 
 		 622 aa  80.5  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2405  extracellular solute-binding protein family 5  26.57 
 
 		 518 aa  80.5  0.00000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0785  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  21.17 
 
 		 593 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0623  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  20.79 
 
 		 593 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0713  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  20.79 
 
 		 593 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00303874 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0656  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  20.79 
 
 		 593 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2767  extracellular solute-binding protein  25.64 
 
 		 555 aa  79.7  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.26917  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  23.01 
 
 		 509 aa  80.1  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0570  extracellular solute-binding protein  21.39 
 
 		 591 aa  79.7  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  24.25 
 
 		 538 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  22.58 
 
 		 508 aa  78.2  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>