More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1244 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1244  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
588 aa  1188    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.863592  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3203  extracellular solute-binding protein family 5  41.92 
 
 
641 aa  449  1e-125  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1045  extracellular solute-binding protein family 5  38.3 
 
 
607 aa  401  9.999999999999999e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0876  extracellular solute-binding protein family 5  39 
 
 
559 aa  395  1e-109  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0005  extracellular solute-binding protein family 5  38.27 
 
 
599 aa  355  1e-96  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.369822  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3201  extracellular solute-binding protein family 5  35.6 
 
 
638 aa  352  2e-95  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0133  extracellular solute-binding protein family 5  45.55 
 
 
664 aa  316  7e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2201  extracellular solute-binding protein family 5  23.89 
 
 
567 aa  133  6.999999999999999e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4406  twin-arginine translocation pathway signal  24.82 
 
 
541 aa  130  9.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0490152 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4407  twin-arginine translocation pathway signal  24.23 
 
 
541 aa  121  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.095613 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2388  extracellular solute-binding protein family 5  27.06 
 
 
583 aa  121  3.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1438  extracellular solute-binding protein family 5  25.88 
 
 
554 aa  115  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.3177  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3167  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  27.75 
 
 
542 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1414  extracellular solute-binding protein family 5  28.14 
 
 
636 aa  105  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 
526 aa  104  5e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  31.23 
 
 
509 aa  104  6e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0132  extracellular solute-binding protein  26.5 
 
 
532 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1000  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  31.48 
 
 
529 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0822  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  31.51 
 
 
528 aa  99.8  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  28.33 
 
 
532 aa  99.4  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0996  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  31.48 
 
 
528 aa  99.4  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.41324e-61 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0858  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  31.48 
 
 
528 aa  99.4  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000478589  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0807  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  31.48 
 
 
528 aa  99.4  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000107652  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0908  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  31.48 
 
 
528 aa  99.4  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000813115  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4386  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  31.29 
 
 
529 aa  97.4  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.775513  hitchhiker  3.14637e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0945  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  31.29 
 
 
528 aa  97.1  8e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00751792  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0566  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.57 
 
 
593 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0803  extracellular solute-binding protein  30.33 
 
 
529 aa  96.3  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000165149  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1553  extracellular solute-binding protein  26.53 
 
 
559 aa  95.9  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.208561  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  26.4 
 
 
551 aa  95.1  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0724  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.29 
 
 
593 aa  94.7  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0106  extracellular solute-binding protein family 5  28.21 
 
 
533 aa  94.7  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0909337  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0266  extracellular solute-binding protein family 5  25.54 
 
 
575 aa  95.1  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1545  extracellular solute-binding protein  30.56 
 
 
557 aa  94.4  5e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.2137  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0262  extracellular solute-binding protein family 5  29.97 
 
 
587 aa  94  7e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.578222  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2745  extracellular solute-binding protein  27.61 
 
 
551 aa  93.2  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  28.31 
 
 
542 aa  92.8  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1595  extracellular solute-binding protein  30.56 
 
 
557 aa  92.8  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0133917  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6559  extracellular solute-binding protein family 5  26.63 
 
 
536 aa  92  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67626  normal  0.403463 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0785  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.43 
 
 
593 aa  91.7  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0570  extracellular solute-binding protein  23.89 
 
 
591 aa  91.3  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5780  extracellular solute-binding protein family 5  28.12 
 
 
548 aa  90.5  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0222518  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1592  extracellular solute-binding protein  27.43 
 
 
560 aa  90.5  8e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.382923  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4285  extracellular solute-binding protein  27.15 
 
 
530 aa  90.5  8e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.261799  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0623  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  23.43 
 
 
593 aa  90.1  9e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0656  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  23.43 
 
 
593 aa  90.1  9e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0208  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 
575 aa  90.5  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0713  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.43 
 
 
593 aa  90.1  9e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00303874 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0218  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  24.85 
 
 
559 aa  89.7  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0231  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  24.85 
 
 
555 aa  89.7  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6684  extracellular solute-binding protein family 5  27.49 
 
 
548 aa  90.1  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.692475 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0794  extracellular solute-binding protein family 5  24.24 
 
 
1437 aa  89.7  1e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0894131  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0241  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.84 
 
 
575 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.85 
 
 
575 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.019765  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2547  extracellular solute-binding protein  27.97 
 
 
534 aa  89.4  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220611  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0146  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.65 
 
 
539 aa  89  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0265  oligopeptide-binding protein OppA  23.43 
 
 
566 aa  89  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5671  extracellular solute-binding protein  27.22 
 
 
531 aa  89.4  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.880059  normal  0.0905991 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3968  extracellular solute-binding protein  27.66 
 
 
537 aa  89  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.252184  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0786  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  27.03 
 
 
537 aa  88.6  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.527095  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1361  extracellular solute-binding protein family 5  26.24 
 
 
516 aa  88.6  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000166548  normal  0.279813 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  27.38 
 
 
540 aa  88.6  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0933  extracellular solute-binding protein family 5  27.62 
 
 
561 aa  88.6  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6144  extracellular solute-binding protein family 5  26.44 
 
 
533 aa  88.6  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.5133  hitchhiker  0.00348679 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0247  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein, putative  23.43 
 
 
567 aa  87.8  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.460021  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0248  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein, putative  24.54 
 
 
575 aa  87.8  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5138  putative periplasmic peptide-binding protein ABC transporter  27.85 
 
 
495 aa  87.4  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0462348 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0551  extracellular solute-binding protein  24.43 
 
 
591 aa  87.4  6e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1832  extracellular solute-binding protein family 5  27.86 
 
 
587 aa  87.8  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.315611  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4061  extracellular solute-binding protein  28.41 
 
 
529 aa  87.4  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.707761  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0205  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.15 
 
 
575 aa  87  8e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.74 
 
 
538 aa  87  9e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  25.65 
 
 
559 aa  86.7  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0219  extracellular solute-binding protein  25.15 
 
 
575 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0207  extracellular solute-binding protein  23.71 
 
 
567 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  26.18 
 
 
546 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  27.45 
 
 
516 aa  85.9  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4764  extracellular solute-binding protein  27.43 
 
 
539 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0245  oligopeptide-binding protein OppA  24.92 
 
 
575 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0551474  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3196  extracellular solute-binding protein family 5  26.11 
 
 
600 aa  85.1  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000171923  unclonable  0.0000000000413572 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  27.93 
 
 
538 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  26.73 
 
 
540 aa  85.5  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3400  extracellular solute-binding protein family 5  27.83 
 
 
567 aa  85.5  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.110204  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00493  ABC-type dipeptide transporter periplasmic component  26.01 
 
 
519 aa  84.7  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  25.21 
 
 
533 aa  85.1  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5080  oligopeptide-binding protein OppA  24.62 
 
 
575 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4290  extracellular solute-binding protein  26.65 
 
 
530 aa  84.3  0.000000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00787986  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7456  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.5 
 
 
563 aa  84  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.388989 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001974  peptide ABC transporter peptide-binding protein  26.32 
 
 
517 aa  84.3  0.000000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0343  extracellular solute-binding protein family 5  23.5 
 
 
537 aa  84  0.000000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0882  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  26.18 
 
 
539 aa  84  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  26.54 
 
 
508 aa  84  0.000000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2767  extracellular solute-binding protein  26.78 
 
 
555 aa  84  0.000000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.26917  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4682  extracellular solute-binding protein family 5  25.85 
 
 
532 aa  83.6  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0910  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, periplasmic components  27.12 
 
 
572 aa  83.2  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  27.82 
 
 
539 aa  82.8  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  28.13 
 
 
510 aa  83.6  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4474  extracellular solute-binding protein  27.34 
 
 
529 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0385001  normal  0.989495 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1288  extracellular solute-binding protein  27.8 
 
 
492 aa  82  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213997  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0564  extracellular solute-binding protein  25.53 
 
 
607 aa  82.4  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000010438  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>