More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1438 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_1438  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 554 aa  1125    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.3177  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2201  extracellular solute-binding protein family 5  34.45 
 
 		 567 aa  306  8.000000000000001e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4406  twin-arginine translocation pathway signal  32.62 
 
 		 541 aa  306  9.000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0490152 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4407  twin-arginine translocation pathway signal  32.62 
 
 		 541 aa  304  3.0000000000000004e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.095613 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2388  extracellular solute-binding protein family 5  34.56 
 
 		 583 aa  258  2e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1414  extracellular solute-binding protein family 5  26.09 
 
 		 636 aa  145  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  26.88 
 
 		 546 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0883  extracellular solute-binding protein family 5  26.62 
 
 		 547 aa  121  3.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3996  extracellular solute-binding protein family 5  25.29 
 
 		 563 aa  119  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1244  extracellular solute-binding protein family 5  26.43 
 
 		 588 aa  117  6.9999999999999995e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.863592  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0328  extracellular solute-binding protein family 5  27.18 
 
 		 540 aa  117  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  30.07 
 
 		 538 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5299  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  26.72 
 
 		 556 aa  114  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1045  extracellular solute-binding protein family 5  24.52 
 
 		 607 aa  114  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0876  extracellular solute-binding protein family 5  26.23 
 
 		 559 aa  113  7.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0510  extracellular solute-binding protein  30.15 
 
 		 510 aa  111  3e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0306064  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0785  extracellular solute-binding protein  30.67 
 
 		 512 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0600833  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3566  dipeptide/oligopeptide-binding protein  28.44 
 
 		 562 aa  110  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.672958  normal  0.0864129 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  30.22 
 
 		 532 aa  110  5e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  27.73 
 
 		 520 aa  109  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0133  extracellular solute-binding protein family 5  26 
 
 		 664 aa  108  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2116  hypothetical protein  28.2 
 
 		 510 aa  107  5e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3167  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  26.18 
 
 		 542 aa  107  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1873  extracellular solute-binding protein  27.76 
 
 		 526 aa  107  6e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.021803  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2769  extracellular solute-binding protein  26.71 
 
 		 507 aa  106  9e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12042  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  26.13 
 
 		 540 aa  106  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  24.2 
 
 		 534 aa  106  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0244  extracellular solute-binding protein family 5  28.87 
 
 		 575 aa  105  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.794885  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2798  extracellular solute-binding protein family 5  30.85 
 
 		 557 aa  105  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1224  extracellular solute-binding protein family 5  28.3 
 
 		 544 aa  105  3e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0137957 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  27.86 
 
 		 540 aa  103  6e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0343  extracellular solute-binding protein family 5  26.44 
 
 		 537 aa  103  6e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0477  extracellular solute-binding protein family 5  29.15 
 
 		 573 aa  103  8e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2629  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  28.26 
 
 		 517 aa  103  1e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000968343  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  26.01 
 
 		 542 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  28.82 
 
 		 509 aa  102  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1565  oligopeptide-binding protein, putative  28.57 
 
 		 381 aa  102  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.306093  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  24.11 
 
 		 535 aa  102  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  29.07 
 
 		 523 aa  101  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  25.37 
 
 		 531 aa  101  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.91 
 
 		 538 aa  100  6e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  26.55 
 
 		 509 aa  100  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3082  twin-arginine translocation pathway signal  27.96 
 
 		 535 aa  100  9e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.49552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0794  extracellular solute-binding protein family 5  26.01 
 
 		 1437 aa  100  9e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0894131  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  25.77 
 
 		 495 aa  99.8  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  25.53 
 
 		 505 aa  99.8  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3203  extracellular solute-binding protein family 5  26.09 
 
 		 641 aa  100  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3798  extracellular solute-binding protein family 5  27.13 
 
 		 557 aa  99.4  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7328  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  24.61 
 
 		 517 aa  99  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.399444  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  26.18 
 
 		 539 aa  99  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  27.43 
 
 		 533 aa  98.2  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1671  extracellular solute-binding protein  28.28 
 
 		 538 aa  97.8  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.901467 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0398  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  30.63 
 
 		 527 aa  97.8  5e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0387  extracellular solute-binding protein family 5  26.43 
 
 		 503 aa  97.4  5e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000219856  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0005  extracellular solute-binding protein family 5  24.8 
 
 		 599 aa  97.4  6e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.369822  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3863  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  24.57 
 
 		 535 aa  97.4  6e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3039  4-phytase  28.21 
 
 		 518 aa  97.4  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03395  dipeptide transporter  24.57 
 
 		 535 aa  97.1  7e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0168  4-phytase  24.57 
 
 		 535 aa  97.1  7e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4912  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  24.57 
 
 		 535 aa  97.1  7e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0171  4-phytase  24.57 
 
 		 535 aa  97.1  7e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3103  extracellular solute-binding protein  23.03 
 
 		 519 aa  97.1  7e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3744  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  24.57 
 
 		 535 aa  97.1  7e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03346  hypothetical protein  24.57 
 
 		 535 aa  97.1  7e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4037  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  24.57 
 
 		 535 aa  97.1  7e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7212  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  25.75 
 
 		 531 aa  97.1  7e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3666  extracellular solute-binding protein family 5  28.62 
 
 		 563 aa  97.1  8e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  26.05 
 
 		 502 aa  96.7  9e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1270  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.08 
 
 		 542 aa  96.7  1e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.593504  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  25.81 
 
 		 520 aa  96.3  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4109  extracellular solute-binding protein family 5  24.39 
 
 		 513 aa  96.3  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344383  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  26.56 
 
 		 565 aa  96.3  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1596  extracellular solute-binding protein family 5  28.03 
 
 		 572 aa  95.5  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0368881  unclonable  7.93881e-23 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  27.21 
 
 		 524 aa  95.5  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  22.77 
 
 		 524 aa  95.5  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4290  extracellular solute-binding protein  26.51 
 
 		 530 aa  95.5  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00787986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3969  extracellular solute-binding protein  26.5 
 
 		 532 aa  95.1  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3231  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  26.5 
 
 		 532 aa  95.1  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.704667  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4398  extracellular solute-binding protein family 5  24.09 
 
 		 513 aa  94.7  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0482953  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  26.06 
 
 		 534 aa  94.7  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1494  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.35 
 
 		 543 aa  94.4  5e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0931394  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2056  periplasmic dipeptide transport protein precursor  25.83 
 
 		 532 aa  94.4  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.184376  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4147  extracellular solute-binding protein  25.46 
 
 		 518 aa  94.4  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3892  ABC di/oligopeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  25.46 
 
 		 518 aa  94.4  5e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.206545  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0449  extracellular solute-binding protein  25.23 
 
 		 520 aa  94.4  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0067  extracellular solute-binding protein  26.71 
 
 		 542 aa  94.4  6e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1284  extracellular solute-binding protein  28.35 
 
 		 543 aa  94  7e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0844  extracellular solute-binding protein  25.76 
 
 		 531 aa  93.6  9e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3431  extracellular solute-binding protein  24.41 
 
 		 531 aa  93.6  9e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000878954 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00493  ABC-type dipeptide transporter periplasmic component  25.68 
 
 		 519 aa  93.2  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1288  extracellular solute-binding protein  27.8 
 
 		 492 aa  92.8  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213997  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0132  extracellular solute-binding protein  24.51 
 
 		 532 aa  93.2  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1652  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  23.88 
 
 		 511 aa  92.8  1e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.2387  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2377  extracellular solute-binding protein  25.07 
 
 		 552 aa  92.4  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000449683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2356  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 		 529 aa  92  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.458822  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1860  extracellular solute-binding protein family 5  27.8 
 
 		 544 aa  92  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.44883  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2065  extracellular solute-binding protein family 5  26.58 
 
 		 543 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4082  extracellular solute-binding protein  26.91 
 
 		 526 aa  92  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.484283  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  26.62 
 
 		 576 aa  92  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3950  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  24.07 
 
 		 526 aa  92  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>