More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0883 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_0883  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
547 aa  1105    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  29.17 
 
 
521 aa  146  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  28.79 
 
 
521 aa  144  5e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  28.79 
 
 
521 aa  144  5e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  28.79 
 
 
521 aa  144  5e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  28.79 
 
 
521 aa  144  5e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  31.21 
 
 
532 aa  135  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1438  extracellular solute-binding protein family 5  26.99 
 
 
554 aa  133  6.999999999999999e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.3177  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2201  extracellular solute-binding protein family 5  25.51 
 
 
567 aa  130  8.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5016  extracellular solute-binding protein family 5  33.69 
 
 
475 aa  128  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.131281 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13240  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  29.58 
 
 
504 aa  126  8.000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0803154  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  30.64 
 
 
508 aa  125  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  29.62 
 
 
502 aa  124  6e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2576  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  32.18 
 
 
506 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0541  extracellular solute-binding protein family 5  30.17 
 
 
632 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.843572  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0494  extracellular solute-binding protein family 5  32 
 
 
536 aa  121  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.080678  normal  0.301708 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2267  extracellular solute-binding protein  31.42 
 
 
506 aa  121  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.18358  normal  0.347756 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0450  extracellular solute-binding protein family 5  29.52 
 
 
519 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.15126 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  27.65 
 
 
534 aa  120  6e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1414  extracellular solute-binding protein family 5  28.47 
 
 
636 aa  120  7.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3603  extracellular solute-binding protein  31.76 
 
 
507 aa  120  9e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.721238 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  29.13 
 
 
544 aa  119  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5018  extracellular solute-binding protein family 5  31.34 
 
 
526 aa  119  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0327585 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1582  extracellular solute-binding protein  29.11 
 
 
531 aa  118  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264898  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  27.8 
 
 
535 aa  118  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2006  transport binding transmembrane protein  28.37 
 
 
528 aa  117  5e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0217  extracellular solute-binding protein family 5  29.52 
 
 
588 aa  116  1.0000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.745298  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0611  extracellular solute-binding protein family 5  25.54 
 
 
527 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1658  extracellular solute-binding protein  30.07 
 
 
516 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.710594  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3635  extracellular solute-binding protein  27.87 
 
 
515 aa  114  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.014259  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0748  extracellular solute-binding protein  29.09 
 
 
535 aa  114  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4082  extracellular solute-binding protein  30.74 
 
 
526 aa  114  5e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.484283  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1873  extracellular solute-binding protein  28.75 
 
 
526 aa  114  6e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.021803  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0582  extracellular solute-binding protein family 5  31.17 
 
 
645 aa  113  7.000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1671  extracellular solute-binding protein  29.86 
 
 
538 aa  113  9e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.901467 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0745  extracellular solute-binding protein  28.1 
 
 
534 aa  113  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0750  extracellular solute-binding protein  28.36 
 
 
535 aa  112  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2405  extracellular solute-binding protein family 5  31.23 
 
 
518 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1284  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  27.82 
 
 
545 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000669385  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  27.65 
 
 
520 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0626  extracellular solute-binding protein  26.39 
 
 
510 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.797506  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  29.5 
 
 
505 aa  112  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1000  glutathione-binding protein GsiB  25.42 
 
 
512 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0950  glutathione-binding protein GsiB  25.42 
 
 
512 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0979  glutathione-binding protein GsiB  25.42 
 
 
512 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0146  extracellular solute-binding protein family 5  26.96 
 
 
513 aa  111  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.377896  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5594  extracellular solute-binding protein  29.11 
 
 
535 aa  111  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459863  normal  0.392289 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0917  glutathione-binding protein GsiB  25.42 
 
 
512 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3103  extracellular solute-binding protein  27.62 
 
 
519 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3969  extracellular solute-binding protein  29.78 
 
 
532 aa  110  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3231  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  29.78 
 
 
532 aa  110  5e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.704667  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0890  glutathione-binding protein GsiB  25.42 
 
 
512 aa  110  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362875  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0453  4-phytase  28.28 
 
 
526 aa  110  6e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132073  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  30 
 
 
509 aa  109  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05920  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  30.82 
 
 
507 aa  109  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0728022 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1837  extracellular solute-binding protein family 5  26.6 
 
 
532 aa  109  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.350378  normal  0.136519 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2161  extracellular solute-binding protein family 5  26.6 
 
 
532 aa  109  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.283164 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3243  extracellular solute-binding protein  27.47 
 
 
509 aa  109  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.649697  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5411  extracellular solute-binding protein family 5  27.62 
 
 
506 aa  109  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.253312  decreased coverage  0.00154474 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2335  extracellular solute-binding protein  26.5 
 
 
531 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.913035  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1491  extracellular solute-binding protein family 5  25.41 
 
 
514 aa  108  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4406  twin-arginine translocation pathway signal  21.98 
 
 
541 aa  108  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0490152 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3003  extracellular solute-binding protein family 5  27.46 
 
 
516 aa  108  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5006  extracellular solute-binding protein family 5  27.63 
 
 
536 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.264167 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1922  putative ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  28.04 
 
 
535 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.92103  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2619  extracellular solute-binding protein family 5  29.15 
 
 
512 aa  108  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.181451  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  28.81 
 
 
528 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4109  extracellular solute-binding protein family 5  25.34 
 
 
513 aa  108  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344383  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3699  extracellular solute-binding protein  28.28 
 
 
527 aa  108  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5304  extracellular solute-binding protein family 5  27.63 
 
 
536 aa  108  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.85757 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3479  extracellular solute-binding protein  25.67 
 
 
546 aa  108  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.116614  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2974  extracellular solute-binding protein family 5  26.22 
 
 
514 aa  107  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0337  extracellular solute-binding protein family 5  27.97 
 
 
521 aa  107  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1288  extracellular solute-binding protein  29.86 
 
 
492 aa  107  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213997  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6105  extracellular solute-binding protein family 5  24.4 
 
 
518 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000312198  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  28.16 
 
 
532 aa  107  5e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  29.41 
 
 
516 aa  107  6e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  25.09 
 
 
495 aa  107  6e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  28.53 
 
 
565 aa  107  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0810  extracellular solute-binding protein  29.24 
 
 
489 aa  107  6e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1189  extracellular solute-binding protein family 5  28.29 
 
 
497 aa  107  7e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4398  extracellular solute-binding protein family 5  25.34 
 
 
513 aa  107  8e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0482953  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5344  extracellular solute-binding protein family 5  27.27 
 
 
506 aa  106  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.297716  normal  0.516905 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1495  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  27.84 
 
 
538 aa  106  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.045715  hitchhiker  0.00127227 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  25.51 
 
 
516 aa  106  9e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0111  extracellular solute-binding protein family 5  26.23 
 
 
517 aa  106  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  31.11 
 
 
542 aa  106  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4734  extracellular solute-binding protein  29.41 
 
 
521 aa  106  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.676308  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18790  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.79 
 
 
540 aa  105  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00232176  normal  0.206883 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3760  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein NikA  27.4 
 
 
524 aa  105  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  24.76 
 
 
512 aa  105  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6591  extracellular solute-binding protein  29.45 
 
 
540 aa  105  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.476219 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5289  ABC transporter  25.73 
 
 
517 aa  105  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0912186  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4859  putative ABC transporter, substrate-binding protein  29.79 
 
 
532 aa  105  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4591  extracellular solute-binding protein  27.34 
 
 
517 aa  105  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0777489  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1012  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.51 
 
 
492 aa  105  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622148  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  27.07 
 
 
541 aa  104  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6090  extracellular solute-binding protein family 5  27.84 
 
 
538 aa  105  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194048  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0244  extracellular solute-binding protein family 5  29.23 
 
 
575 aa  104  3e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.794885  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3971  extracellular solute-binding protein family 5  25.6 
 
 
518 aa  104  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>