More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5016 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5016  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
475 aa  951    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.131281 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0494  extracellular solute-binding protein family 5  59.31 
 
 
536 aa  570  1e-161  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.080678  normal  0.301708 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5018  extracellular solute-binding protein family 5  54.39 
 
 
526 aa  524  1e-147  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0327585 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  27.43 
 
 
505 aa  145  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2870  periplasmic dipeptide transport protein  28.07 
 
 
509 aa  144  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00619899  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3006  extracellular solute-binding protein  26.68 
 
 
528 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165169  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13240  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.74 
 
 
504 aa  141  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0803154  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0074  twin-arginine translocation pathway signal  27.96 
 
 
514 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0403886  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  29.95 
 
 
505 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0111  extracellular solute-binding protein family 5  27.35 
 
 
517 aa  141  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1451  ABC peptide/nickel/opine transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.49 
 
 
524 aa  139  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.482227  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0100  extracellular solute-binding protein  29.49 
 
 
524 aa  139  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.080172 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3158  extracellular solute-binding protein  26.8 
 
 
535 aa  138  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4615  4-phytase  28.54 
 
 
502 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2006  transport binding transmembrane protein  30.03 
 
 
528 aa  136  7.000000000000001e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18790  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  29.57 
 
 
540 aa  135  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00232176  normal  0.206883 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  28.48 
 
 
519 aa  135  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1837  extracellular solute-binding protein family 5  29.27 
 
 
532 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.350378  normal  0.136519 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2161  extracellular solute-binding protein family 5  29.53 
 
 
532 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.283164 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  28.29 
 
 
532 aa  134  5e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0146  extracellular solute-binding protein family 5  33.05 
 
 
513 aa  133  6.999999999999999e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.377896  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3566  dipeptide/oligopeptide-binding protein  29.74 
 
 
562 aa  133  7.999999999999999e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.672958  normal  0.0864129 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  29.53 
 
 
510 aa  132  9e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2375  twin-arginine translocation pathway signal  27.78 
 
 
514 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3971  extracellular solute-binding protein family 5  28.6 
 
 
518 aa  131  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  28.95 
 
 
515 aa  131  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0484  extracellular solute-binding protein  23.88 
 
 
523 aa  130  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.036637  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0883  extracellular solute-binding protein family 5  33.69 
 
 
547 aa  128  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2590  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.97 
 
 
526 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.174207 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3804  extracellular solute-binding protein  25.96 
 
 
509 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00625229  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4398  extracellular solute-binding protein family 5  28.61 
 
 
513 aa  127  6e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0482953  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1829  extracellular solute-binding protein family 5  26.4 
 
 
520 aa  127  6e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2564  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.61 
 
 
542 aa  127  6e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0172077  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  26.47 
 
 
512 aa  125  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1803  extracellular solute-binding protein family 5  28.39 
 
 
499 aa  126  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0045678  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7272  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.81 
 
 
528 aa  125  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2974  extracellular solute-binding protein  30.66 
 
 
530 aa  125  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  27.77 
 
 
510 aa  125  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3678  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.7 
 
 
525 aa  124  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0885273 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0782  extracellular solute-binding protein  29.82 
 
 
494 aa  124  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.319175  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  28.95 
 
 
520 aa  124  3e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4109  extracellular solute-binding protein family 5  28.35 
 
 
513 aa  124  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344383  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  30.83 
 
 
516 aa  124  4e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0210  extracellular solute-binding protein  24.89 
 
 
512 aa  124  5e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0873116  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1240  extracellular solute-binding protein  28.21 
 
 
544 aa  123  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.602045  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1189  extracellular solute-binding protein family 5  30.17 
 
 
497 aa  123  6e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5070  extracellular solute-binding protein  28.77 
 
 
495 aa  123  9e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.27843  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  28.72 
 
 
495 aa  123  9e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4012  extracellular solute-binding protein family 5  27.53 
 
 
523 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1039  extracellular solute-binding protein family 5  31.3 
 
 
503 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.78614  normal  0.0480029 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  26.63 
 
 
524 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3985  extracellular solute-binding protein  27.53 
 
 
499 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3756  extracellular solute-binding protein  27.25 
 
 
540 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0607711 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0722  radical SAM domain-containing protein  26.67 
 
 
522 aa  121  3e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.597639 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0255  extracellular solute-binding protein  30.08 
 
 
531 aa  121  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.146115  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1886  periplasmic dipeptide transport protein precursor  29.23 
 
 
525 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.105927  normal  0.91526 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2532  extracellular solute-binding protein  25.11 
 
 
535 aa  120  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00384928 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00493  ABC-type dipeptide transporter periplasmic component  29.65 
 
 
519 aa  120  3.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  27.9 
 
 
512 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  27.9 
 
 
512 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  27.9 
 
 
512 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001974  peptide ABC transporter peptide-binding protein  30.22 
 
 
517 aa  120  4.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0275  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide/dipeptide-binding protein  25.17 
 
 
595 aa  120  6e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3653  extracellular solute-binding protein family 5  29.6 
 
 
513 aa  120  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0310608  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4051  extracellular solute-binding protein family 5  25.28 
 
 
523 aa  120  7e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.957525  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6297  extracellular solute-binding protein family 5  28.44 
 
 
537 aa  120  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.346111  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0626  extracellular solute-binding protein  23.67 
 
 
510 aa  120  7e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.797506  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0844  extracellular solute-binding protein  28.83 
 
 
531 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1686  extracellular solute-binding protein  27.53 
 
 
514 aa  119  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.898408  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1961  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  29.12 
 
 
513 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.386989 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4225  extracellular solute-binding protein  27.67 
 
 
520 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  30.6 
 
 
544 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2653  extracellular solute-binding protein  30.68 
 
 
517 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0051152  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0645  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  27.43 
 
 
524 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1873  extracellular solute-binding protein  28.79 
 
 
526 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.021803  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  26.86 
 
 
508 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3174  dipeptide ABC transporter substrate-binding protein  27.53 
 
 
523 aa  117  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0095  transport protein, extracellular solute-binding protein  28.29 
 
 
517 aa  118  3e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0865281  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2497  extracellular solute-binding protein family 5  27.88 
 
 
528 aa  117  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0778602 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.39 
 
 
510 aa  117  5e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3383  extracellular solute-binding protein family 5  27.27 
 
 
533 aa  117  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1361  extracellular solute-binding protein family 5  28.5 
 
 
516 aa  117  5e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000166548  normal  0.279813 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1440  extracellular solute-binding protein family 5  28.16 
 
 
514 aa  117  5e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  28.18 
 
 
528 aa  117  6e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  28.42 
 
 
511 aa  117  6.9999999999999995e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2113  extracellular solute-binding protein  28.5 
 
 
527 aa  116  6.9999999999999995e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142361  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2335  extracellular solute-binding protein  26.3 
 
 
531 aa  116  8.999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.913035  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3706  extracellular solute-binding protein family 5  27.78 
 
 
533 aa  116  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4455  extracellular solute-binding protein  24.84 
 
 
509 aa  116  8.999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.661138  hitchhiker  0.000234808 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  22.75 
 
 
521 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  27.32 
 
 
532 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
528 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3507  extracellular solute-binding protein family 5  28.3 
 
 
510 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.224944  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0044  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  28.28 
 
 
530 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  22.43 
 
 
521 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  22.43 
 
 
521 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  22.43 
 
 
521 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3243  extracellular solute-binding protein  28.77 
 
 
509 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.649697  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  26.28 
 
 
515 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  22.43 
 
 
521 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>