More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1240 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1240  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 544 aa  1105    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.602045  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2161  extracellular solute-binding protein family 5  41.19 
 
 		 532 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.283164 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1837  extracellular solute-binding protein family 5  40.99 
 
 		 532 aa  364  2e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.350378  normal  0.136519 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2335  extracellular solute-binding protein  38.92 
 
 		 531 aa  360  4e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.913035  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2006  transport binding transmembrane protein  40.04 
 
 		 528 aa  351  2e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2496  extracellular solute-binding protein  38.49 
 
 		 538 aa  346  6e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0292957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3006  extracellular solute-binding protein  35.66 
 
 		 528 aa  345  1e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165169  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3383  extracellular solute-binding protein family 5  36.67 
 
 		 533 aa  343  4e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0044  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  37.13 
 
 		 530 aa  342  2e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1886  periplasmic dipeptide transport protein precursor  38.37 
 
 		 525 aa  341  2e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.105927  normal  0.91526 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3158  extracellular solute-binding protein  35.37 
 
 		 535 aa  340  5.9999999999999996e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0817  extracellular solute-binding protein  37.57 
 
 		 549 aa  338  1.9999999999999998e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3706  extracellular solute-binding protein family 5  36.71 
 
 		 533 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2087  extracellular solute-binding protein family 5  37.68 
 
 		 522 aa  337  5e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159106  normal  0.621098 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1764  extracellular solute-binding protein family 5  36.58 
 
 		 526 aa  336  7.999999999999999e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2532  extracellular solute-binding protein  36.51 
 
 		 535 aa  332  1e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384928 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2870  periplasmic dipeptide transport protein  34.97 
 
 		 509 aa  330  3e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00619899  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6297  extracellular solute-binding protein family 5  37.55 
 
 		 537 aa  327  3e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.346111  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0015  extracellular solute-binding protein family 5  36.6 
 
 		 516 aa  324  2e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3881  extracellular solute-binding protein  37.43 
 
 		 515 aa  323  5e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.441306  normal  0.0413131 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1440  extracellular solute-binding protein family 5  35.86 
 
 		 514 aa  323  6e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0015  extracellular solute-binding protein family 5  36.16 
 
 		 516 aa  320  5e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.406265  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2814  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  35.53 
 
 		 521 aa  310  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.1277  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2619  extracellular solute-binding protein family 5  35.45 
 
 		 512 aa  307  3e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.181451  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2542  extracellular solute-binding protein  35.13 
 
 		 521 aa  306  9.000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0150221  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4690  extracellular solute-binding protein family 5  33.84 
 
 		 524 aa  295  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5416  extracellular solute-binding protein  34.14 
 
 		 534 aa  268  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.604179 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5037  extracellular solute-binding protein  34.36 
 
 		 534 aa  265  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4089  normal  0.963466 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3541  extracellular solute-binding protein family 5  31.94 
 
 		 528 aa  257  4e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4139  extracellular solute-binding protein  31.94 
 
 		 528 aa  257  4e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.414652 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0936  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 526 aa  256  1.0000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4792  extracellular solute-binding protein  31.36 
 
 		 528 aa  244  3e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1091  extracellular solute-binding protein family 5  30.74 
 
 		 528 aa  238  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.264739  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3551  extracellular solute-binding protein family 5  32.8 
 
 		 531 aa  236  8e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.186732  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1303  extracellular solute-binding protein  31.33 
 
 		 544 aa  231  3e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.949785 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2113  extracellular solute-binding protein  30.46 
 
 		 527 aa  229  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142361  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1815  extracellular solute-binding protein  33.59 
 
 		 532 aa  229  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0663  extracellular solute-binding protein family 5  31.95 
 
 		 526 aa  228  3e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.373149  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1686  extracellular solute-binding protein  29.82 
 
 		 514 aa  226  1e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.898408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0685  extracellular solute-binding protein  31.76 
 
 		 526 aa  226  1e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0429103 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1097  putative binding-dependent transport protein (periplasmic)  30.6 
 
 		 528 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0666  extracellular solute-binding protein family 5  33.81 
 
 		 523 aa  220  5e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.404568  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0688  extracellular solute-binding protein  33.81 
 
 		 523 aa  220  6e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.110035  normal  0.066295 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1240  extracellular solute-binding protein  34.11 
 
 		 530 aa  218  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2857  putative oligopeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  29.29 
 
 		 532 aa  218  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.207734 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0255  extracellular solute-binding protein  31.38 
 
 		 531 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.146115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4426  extracellular solute-binding protein  32.14 
 
 		 556 aa  214  2.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.169116  normal  0.480332 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1300  extracellular solute-binding protein  29.12 
 
 		 526 aa  212  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.901266 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4474  extracellular solute-binding protein  29.08 
 
 		 538 aa  213  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.225694 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0872  extracellular solute-binding protein family 5  30.25 
 
 		 527 aa  209  9e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.625735 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2564  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.87 
 
 		 542 aa  206  8e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0172077  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1873  extracellular solute-binding protein  29.57 
 
 		 526 aa  205  2e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.021803  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1361  extracellular solute-binding protein family 5  28.95 
 
 		 516 aa  204  4e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000166548  normal  0.279813 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1189  extracellular solute-binding protein family 5  29.62 
 
 		 497 aa  204  4e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1792  extracellular solute-binding protein family 5  29.43 
 
 		 514 aa  201  3e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0136295  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1829  extracellular solute-binding protein family 5  29.49 
 
 		 520 aa  197  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7194  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  30.47 
 
 		 528 aa  196  7e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169026  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0449  extracellular solute-binding protein  29.08 
 
 		 520 aa  196  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0877  4-phytase  31.53 
 
 		 460 aa  195  2e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.612179 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3144  extracellular solute-binding protein  29.88 
 
 		 526 aa  193  6e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.000116165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0562  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  28.57 
 
 		 518 aa  191  2.9999999999999997e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0095  transport protein, extracellular solute-binding protein  29.14 
 
 		 517 aa  190  5.999999999999999e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0865281  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2819  extracellular solute-binding protein  29.58 
 
 		 529 aa  188  2e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000112764  normal  0.172306 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3143  extracellular solute-binding protein  29.3 
 
 		 524 aa  183  7e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0573017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0275  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide/dipeptide-binding protein  26.61 
 
 		 595 aa  182  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2799  extracellular solute-binding protein  27.36 
 
 		 520 aa  182  1e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.741108 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001974  peptide ABC transporter peptide-binding protein  28.16 
 
 		 517 aa  181  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00493  ABC-type dipeptide transporter periplasmic component  29.25 
 
 		 519 aa  181  4e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  28.6 
 
 		 505 aa  177  5e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2474  extracellular solute-binding protein  30.57 
 
 		 525 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2822  extracellular solute-binding protein  27.38 
 
 		 517 aa  174  2.9999999999999996e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.687608  normal  0.0566169 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  27.7 
 
 		 521 aa  173  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5070  extracellular solute-binding protein  29.66 
 
 		 495 aa  172  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.27843  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  27.5 
 
 		 521 aa  172  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.5 
 
 		 521 aa  172  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  27.5 
 
 		 521 aa  172  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  27.5 
 
 		 521 aa  172  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0423  extracellular solute-binding protein  27.97 
 
 		 527 aa  167  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.204725  normal  0.294412 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2790  extracellular solute-binding protein family 5  25.76 
 
 		 527 aa  166  6.9999999999999995e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  27.84 
 
 		 495 aa  162  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0422  extracellular solute-binding protein  28.73 
 
 		 527 aa  162  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.147362  normal  0.173861 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  29.05 
 
 		 516 aa  160  8e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1803  extracellular solute-binding protein family 5  25.09 
 
 		 499 aa  159  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0045678  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5796  extracellular solute-binding protein  26.78 
 
 		 526 aa  158  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00815808  hitchhiker  0.00391201 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  27.12 
 
 		 534 aa  157  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  30.77 
 
 		 531 aa  157  6e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  27.34 
 
 		 516 aa  151  3e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  25.23 
 
 		 535 aa  151  4e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5794  extracellular solute-binding protein  26.22 
 
 		 520 aa  150  7e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000436692  decreased coverage  0.000177852 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  27.59 
 
 		 512 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  29.53 
 
 		 505 aa  149  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  27.59 
 
 		 512 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  30.21 
 
 		 510 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  27.59 
 
 		 512 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5067  extracellular solute-binding protein  26.72 
 
 		 495 aa  148  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.68424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5641  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  27.83 
 
 		 508 aa  147  6e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2850  putative ABC transporter substrate-binding protein  28.27 
 
 		 490 aa  146  9e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.938621  normal  0.738445 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  26.11 
 
 		 532 aa  144  3e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  29.09 
 
 		 544 aa  143  8e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.56 
 
 		 510 aa  143  8e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>