More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5018 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5018  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
526 aa  1069    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0327585 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0494  extracellular solute-binding protein family 5  52.26 
 
 
536 aa  542  1e-153  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.080678  normal  0.301708 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5016  extracellular solute-binding protein family 5  54.39 
 
 
475 aa  523  1e-147  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.131281 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4615  4-phytase  29.42 
 
 
502 aa  144  4e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  26.71 
 
 
505 aa  139  8.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  29.42 
 
 
516 aa  139  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13240  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.14 
 
 
504 aa  139  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0803154  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3006  extracellular solute-binding protein  25.55 
 
 
528 aa  139  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165169  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2375  twin-arginine translocation pathway signal  30.85 
 
 
514 aa  136  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  30.59 
 
 
505 aa  136  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1039  extracellular solute-binding protein family 5  28.28 
 
 
503 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.78614  normal  0.0480029 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  28.54 
 
 
515 aa  134  5e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  26.52 
 
 
510 aa  133  6.999999999999999e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3678  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.47 
 
 
525 aa  133  9e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0885273 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0074  twin-arginine translocation pathway signal  27.32 
 
 
514 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0403886  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0111  extracellular solute-binding protein family 5  26.54 
 
 
517 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2653  extracellular solute-binding protein  28.11 
 
 
517 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0051152  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  30.2 
 
 
512 aa  131  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  30.2 
 
 
512 aa  131  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  30.2 
 
 
512 aa  131  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3158  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
535 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1189  extracellular solute-binding protein family 5  30.28 
 
 
497 aa  130  6e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  26.49 
 
 
540 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2870  periplasmic dipeptide transport protein  26.42 
 
 
509 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00619899  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  27.85 
 
 
510 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  31.28 
 
 
510 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.65 
 
 
520 aa  126  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2564  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.14 
 
 
542 aa  126  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0172077  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4051  extracellular solute-binding protein family 5  27.12 
 
 
523 aa  125  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.957525  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4012  extracellular solute-binding protein family 5  27.12 
 
 
523 aa  124  4e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0255  extracellular solute-binding protein  30.4 
 
 
531 aa  124  4e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.146115  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2073  extracellular solute-binding protein  28.93 
 
 
517 aa  124  5e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.610417  normal  0.462432 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0626  extracellular solute-binding protein  26.59 
 
 
510 aa  123  7e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.797506  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3756  extracellular solute-binding protein  26.84 
 
 
540 aa  123  8e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0607711 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18790  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  30.15 
 
 
540 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00232176  normal  0.206883 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6010  extracellular solute-binding protein family 5  27.76 
 
 
527 aa  122  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1829  extracellular solute-binding protein family 5  28.02 
 
 
520 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0722  radical SAM domain-containing protein  27.76 
 
 
522 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.597639 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1933  extracellular solute-binding protein family 5  28.03 
 
 
505 aa  120  4.9999999999999996e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.22177  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2542  extracellular solute-binding protein  27.43 
 
 
521 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0150221  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1250  extracellular solute-binding protein family 5  28.16 
 
 
550 aa  120  4.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.405882  normal  0.0838621 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  25.76 
 
 
534 aa  120  6e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4398  extracellular solute-binding protein family 5  27.76 
 
 
513 aa  120  7e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0482953  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  24.94 
 
 
521 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0883  extracellular solute-binding protein family 5  30.83 
 
 
547 aa  119  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1837  extracellular solute-binding protein family 5  27.61 
 
 
532 aa  118  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.350378  normal  0.136519 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2161  extracellular solute-binding protein family 5  27.61 
 
 
532 aa  118  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.283164 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16230  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.82 
 
 
516 aa  118  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.884302  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4109  extracellular solute-binding protein family 5  27.2 
 
 
513 aa  118  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344383  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0146  extracellular solute-binding protein family 5  29.26 
 
 
513 aa  118  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.377896  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1303  extracellular solute-binding protein  27.54 
 
 
544 aa  118  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.949785 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  26.43 
 
 
532 aa  117  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7272  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.9 
 
 
528 aa  117  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  24.7 
 
 
521 aa  117  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.7 
 
 
521 aa  117  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  24.7 
 
 
521 aa  117  5e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  24.7 
 
 
521 aa  117  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1240  extracellular solute-binding protein  27.62 
 
 
544 aa  117  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.602045  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  26.86 
 
 
520 aa  117  6e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2590  putative ABC transporter, substrate-binding protein  27.84 
 
 
526 aa  117  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.174207 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1961  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  27.66 
 
 
513 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.386989 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  28.97 
 
 
519 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0723  hypothetical protein  26.58 
 
 
527 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.703564  normal  0.46015 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  25.32 
 
 
502 aa  116  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0275  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide/dipeptide-binding protein  24.22 
 
 
595 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2799  extracellular solute-binding protein  25.44 
 
 
520 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.741108 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1344  extracellular solute-binding protein  28.68 
 
 
506 aa  114  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.088373  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1686  extracellular solute-binding protein  25.74 
 
 
514 aa  114  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.898408  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  28.21 
 
 
511 aa  115  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0449  extracellular solute-binding protein  28.19 
 
 
520 aa  114  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1091  extracellular solute-binding protein family 5  26.77 
 
 
528 aa  114  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.264739  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0139  extracellular solute-binding protein  27.91 
 
 
520 aa  114  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.382397 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2496  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 
538 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0292957  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2814  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.43 
 
 
521 aa  114  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.1277  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1451  ABC peptide/nickel/opine transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.25 
 
 
524 aa  114  5e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.482227  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0100  extracellular solute-binding protein  28.25 
 
 
524 aa  114  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.080172 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3541  extracellular solute-binding protein family 5  26.08 
 
 
528 aa  114  5e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4139  extracellular solute-binding protein  26.08 
 
 
528 aa  114  5e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.414652 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  26.81 
 
 
515 aa  114  5e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3248  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  30.61 
 
 
503 aa  114  6e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336639  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  26.25 
 
 
534 aa  114  6e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0748  extracellular solute-binding protein  27.34 
 
 
535 aa  113  8.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0645  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  28.15 
 
 
524 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3982  extracellular solute-binding protein  30.34 
 
 
503 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0611  extracellular solute-binding protein family 5  26.46 
 
 
527 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  28.57 
 
 
495 aa  112  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3971  extracellular solute-binding protein family 5  28 
 
 
518 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2006  transport binding transmembrane protein  26.46 
 
 
528 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0249  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.77 
 
 
545 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  26.49 
 
 
533 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05920  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.05 
 
 
507 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0728022 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0422  extracellular solute-binding protein family 5  29.51 
 
 
517 aa  112  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.941021 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5067  extracellular solute-binding protein  27.73 
 
 
495 aa  111  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.68424  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1361  extracellular solute-binding protein family 5  24.52 
 
 
516 aa  111  3e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000166548  normal  0.279813 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2974  extracellular solute-binding protein  28.99 
 
 
530 aa  111  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0044  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  27.18 
 
 
530 aa  111  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  22.88 
 
 
522 aa  111  4.0000000000000004e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00493  ABC-type dipeptide transporter periplasmic component  26.67 
 
 
519 aa  111  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1666  extracellular solute-binding protein  29.63 
 
 
501 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3103  extracellular solute-binding protein  28.99 
 
 
519 aa  110  6e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>