More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2590 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4051  extracellular solute-binding protein family 5  81.52 
 
 		 523 aa  904    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.957525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1451  ABC peptide/nickel/opine transporter, periplasmic substrate-binding protein  71.29 
 
 		 524 aa  786    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.482227  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2590  putative ABC transporter, substrate-binding protein  100 
 
 		 526 aa  1095    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.174207 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7272  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  85.04 
 
 		 528 aa  934    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4012  extracellular solute-binding protein family 5  82.29 
 
 		 523 aa  913    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0100  extracellular solute-binding protein  71.29 
 
 		 524 aa  786    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.080172 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3756  extracellular solute-binding protein  81.71 
 
 		 540 aa  907    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0607711 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1250  extracellular solute-binding protein family 5  29.88 
 
 		 550 aa  197  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.405882  normal  0.0838621 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13240  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.24 
 
 		 504 aa  136  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0803154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0722  radical SAM domain-containing protein  28.41 
 
 		 522 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.597639 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  27.84 
 
 		 528 aa  135  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  27.94 
 
 		 541 aa  134  5e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  26.17 
 
 		 505 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3571  extracellular solute-binding protein  26.07 
 
 		 520 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57508  normal  0.258108 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4052  extracellular solute-binding protein  26.07 
 
 		 520 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1867  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC periplasmic ligand-binding protein  26.94 
 
 		 520 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.30378  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5016  extracellular solute-binding protein family 5  26.97 
 
 		 475 aa  128  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.131281 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4426  extracellular solute-binding protein  27.5 
 
 		 520 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  25.55 
 
 		 532 aa  127  4.0000000000000003e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4225  extracellular solute-binding protein  27.22 
 
 		 520 aa  127  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1113  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein, putative  27.74 
 
 		 520 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.322522  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  26.74 
 
 		 540 aa  125  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2795  extracellular solute-binding protein family 5  28.28 
 
 		 499 aa  125  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.730452 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4109  extracellular solute-binding protein family 5  28.22 
 
 		 513 aa  125  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344383  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  25.32 
 
 		 495 aa  124  4e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0975  putative dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  26.76 
 
 		 520 aa  124  5e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.124849  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1359  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  26.76 
 
 		 520 aa  124  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.442837  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0324  putative ABC transporter substrate-binding protein  26.76 
 
 		 520 aa  124  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1768  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  26.76 
 
 		 520 aa  124  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.852283  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0494  extracellular solute-binding protein family 5  26.78 
 
 		 536 aa  124  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.080678  normal  0.301708 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1853  putative binding protein YliB  26.76 
 
 		 520 aa  124  5e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0402  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  26.76 
 
 		 520 aa  124  5e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3353  extracellular solute-binding protein  25.24 
 
 		 520 aa  124  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.587262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0238  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  26.76 
 
 		 520 aa  124  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3603  extracellular solute-binding protein  29.59 
 
 		 507 aa  124  6e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.721238 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4398  extracellular solute-binding protein family 5  27.79 
 
 		 513 aa  123  8e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0482953  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3630  extracellular solute-binding protein family 5  30.31 
 
 		 514 aa  123  9e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  26.53 
 
 		 505 aa  123  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0111  extracellular solute-binding protein family 5  26.19 
 
 		 517 aa  122  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  27.46 
 
 		 546 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  24.58 
 
 		 510 aa  123  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0044  extracellular solute-binding protein family 5  26.02 
 
 		 535 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4203  extracellular solute-binding protein  25.05 
 
 		 520 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237738  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4163  extracellular solute-binding protein  25.05 
 
 		 520 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0633493  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2335  extracellular solute-binding protein  30.23 
 
 		 531 aa  121  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.913035  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  24.58 
 
 		 510 aa  121  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7328  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  27.6 
 
 		 517 aa  121  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.399444  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0836  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  27.2 
 
 		 520 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.385717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  29.58 
 
 		 539 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0146  extracellular solute-binding protein family 5  27.97 
 
 		 513 aa  120  7e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.377896  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  28.27 
 
 		 524 aa  120  7.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3653  extracellular solute-binding protein family 5  26.92 
 
 		 513 aa  120  9e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0310608  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3158  extracellular solute-binding protein  26.5 
 
 		 535 aa  120  9e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2006  transport binding transmembrane protein  30.47 
 
 		 528 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0723  hypothetical protein  27.27 
 
 		 527 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.703564  normal  0.46015 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0049  extracellular solute-binding protein family 5  25.57 
 
 		 535 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.46848  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3678  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.79 
 
 		 525 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0885273 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0077  extracellular solute-binding protein family 5  27.74 
 
 		 501 aa  118  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3103  extracellular solute-binding protein  27.03 
 
 		 519 aa  118  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0139  extracellular solute-binding protein  26.12 
 
 		 520 aa  118  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.382397 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5344  extracellular solute-binding protein family 5  29.5 
 
 		 506 aa  118  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.297716  normal  0.516905 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3130  extracellular solute-binding protein family 5  26.09 
 
 		 520 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.777715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0184  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 		 535 aa  117  5e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.507506 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3971  extracellular solute-binding protein family 5  26.23 
 
 		 518 aa  117  5e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1506  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 501 aa  117  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0306373  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3907  extracellular solute-binding protein family 5  25.62 
 
 		 535 aa  117  6e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1926  extracellular solute-binding protein  26.46 
 
 		 518 aa  117  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.293523  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3507  extracellular solute-binding protein family 5  29.75 
 
 		 510 aa  117  6e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.224944  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1605  extracellular solute-binding protein  27.43 
 
 		 595 aa  117  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1837  extracellular solute-binding protein family 5  29.97 
 
 		 532 aa  117  6e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.350378  normal  0.136519 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2161  extracellular solute-binding protein family 5  29.97 
 
 		 532 aa  116  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.283164 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  24.59 
 
 		 502 aa  116  8.999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2870  periplasmic dipeptide transport protein  28.95 
 
 		 509 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00619899  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5018  extracellular solute-binding protein family 5  27.25 
 
 		 526 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0327585 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2356  extracellular solute-binding protein  28.18 
 
 		 529 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.458822  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  24.42 
 
 		 515 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1224  extracellular solute-binding protein family 5  26.39 
 
 		 544 aa  115  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0137957 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03395  dipeptide transporter  24.6 
 
 		 535 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0168  4-phytase  24.6 
 
 		 535 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3863  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  24.6 
 
 		 535 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4037  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  24.6 
 
 		 535 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03346  hypothetical protein  24.6 
 
 		 535 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5070  extracellular solute-binding protein  29.39 
 
 		 495 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.27843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0171  4-phytase  24.6 
 
 		 535 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4912  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  24.6 
 
 		 535 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5411  extracellular solute-binding protein family 5  29 
 
 		 506 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.253312  decreased coverage  0.00154474 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4098  extracellular solute-binding protein family 5  25.57 
 
 		 535 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3744  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  24.6 
 
 		 535 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0114  extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 		 530 aa  115  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  28.5 
 
 		 565 aa  115  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  27.05 
 
 		 521 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  25.06 
 
 		 516 aa  114  4.0000000000000004e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1380  substate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  25.71 
 
 		 517 aa  114  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.630202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  27.92 
 
 		 538 aa  114  5e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3003  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 		 516 aa  114  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  27.05 
 
 		 521 aa  114  6e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.05 
 
 		 521 aa  114  6e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  27.05 
 
 		 521 aa  114  6e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  27.05 
 
 		 521 aa  114  6e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3842  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  24.66 
 
 		 526 aa  113  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>