More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5411 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_5344  extracellular solute-binding protein family 5  96.64 
 
 		 506 aa  1017    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.297716  normal  0.516905 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5411  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 506 aa  1047    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.253312  decreased coverage  0.00154474 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3985  extracellular solute-binding protein  51.12 
 
 		 499 aa  492  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4029  extracellular solute-binding protein  46.35 
 
 		 502 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5080  extracellular solute-binding protein  47.64 
 
 		 502 aa  435  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0526207  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5398  extracellular solute-binding protein family 5  43.37 
 
 		 506 aa  405  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0028  extracellular solute-binding protein family 5  38.52 
 
 		 520 aa  356  5.999999999999999e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0183012 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1024  extracellular solute-binding protein  36.04 
 
 		 524 aa  341  1e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.216522 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4444  extracellular solute-binding protein  33.26 
 
 		 517 aa  255  2.0000000000000002e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.300506  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1949  extracellular solute-binding protein  35.28 
 
 		 506 aa  236  7e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.806443  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1950  extracellular solute-binding protein  33.26 
 
 		 506 aa  224  3e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.412794  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5070  extracellular solute-binding protein  29.64 
 
 		 495 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.27843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5067  extracellular solute-binding protein  28.87 
 
 		 495 aa  192  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.68424  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1764  extracellular solute-binding protein family 5  31.14 
 
 		 526 aa  179  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2087  extracellular solute-binding protein family 5  32.04 
 
 		 522 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159106  normal  0.621098 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2006  transport binding transmembrane protein  33.15 
 
 		 528 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0015  extracellular solute-binding protein family 5  31.7 
 
 		 516 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  28.54 
 
 		 505 aa  164  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2335  extracellular solute-binding protein  31.18 
 
 		 531 aa  162  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.913035  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5416  extracellular solute-binding protein  28.49 
 
 		 534 aa  162  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.604179 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  28 
 
 		 524 aa  161  2e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0015  extracellular solute-binding protein family 5  30.3 
 
 		 516 aa  161  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.406265  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1886  periplasmic dipeptide transport protein precursor  27.79 
 
 		 525 aa  160  5e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.105927  normal  0.91526 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0817  extracellular solute-binding protein  27.85 
 
 		 549 aa  160  7e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5037  extracellular solute-binding protein  28.11 
 
 		 534 aa  159  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4089  normal  0.963466 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2161  extracellular solute-binding protein family 5  31.83 
 
 		 532 aa  157  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.283164 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3383  extracellular solute-binding protein family 5  29.79 
 
 		 533 aa  157  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1837  extracellular solute-binding protein family 5  31.55 
 
 		 532 aa  157  4e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.350378  normal  0.136519 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3706  extracellular solute-binding protein family 5  28.9 
 
 		 533 aa  153  7e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  26.48 
 
 		 521 aa  152  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  28.44 
 
 		 534 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2496  extracellular solute-binding protein  29.22 
 
 		 538 aa  152  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0292957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1288  extracellular solute-binding protein  29.86 
 
 		 492 aa  152  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213997  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2542  extracellular solute-binding protein  28.51 
 
 		 521 aa  151  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0150221  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  26.27 
 
 		 521 aa  150  4e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.27 
 
 		 521 aa  150  4e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  26.27 
 
 		 521 aa  150  4e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  26.27 
 
 		 521 aa  150  4e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1012  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.73 
 
 		 492 aa  147  3e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622148  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5641  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  31.11 
 
 		 508 aa  147  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  26.95 
 
 		 535 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3221  extracellular solute-binding protein  27.93 
 
 		 517 aa  145  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102229  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2814  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.29 
 
 		 521 aa  144  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.1277  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0044  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  27.91 
 
 		 530 aa  144  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1651  extracellular solute-binding protein  29.81 
 
 		 516 aa  144  5e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0954  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.84 
 
 		 479 aa  143  7e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  29.17 
 
 		 520 aa  143  7e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7558  putative dipeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  28.11 
 
 		 515 aa  143  7e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  26.26 
 
 		 532 aa  143  9e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1803  extracellular solute-binding protein family 5  26.36 
 
 		 499 aa  142  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0045678  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.96 
 
 		 520 aa  140  6e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4392  extracellular solute-binding protein  25.72 
 
 		 521 aa  140  7.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4455  extracellular solute-binding protein  28.01 
 
 		 509 aa  139  8.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.661138  hitchhiker  0.000234808 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3678  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.58 
 
 		 525 aa  139  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0885273 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6297  extracellular solute-binding protein family 5  30.26 
 
 		 537 aa  139  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.346111  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4491  extracellular solute-binding protein family 5  26.64 
 
 		 509 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0845  extracellular solute-binding protein  28.96 
 
 		 532 aa  139  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  29.63 
 
 		 528 aa  138  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2739  extracellular solute-binding protein family 5  25.75 
 
 		 541 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.941667  normal  0.188577 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  27.53 
 
 		 510 aa  138  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1604  extracellular solute-binding protein  25.75 
 
 		 525 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1638  extracellular solute-binding protein  25.75 
 
 		 525 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.547791 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  29.76 
 
 		 531 aa  137  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2552  extracellular solute-binding protein  25.65 
 
 		 541 aa  137  4e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0329561 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2650  acetate kinase  25.65 
 
 		 541 aa  137  5e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.76691 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4098  extracellular solute-binding protein family 5  29.5 
 
 		 535 aa  137  6.0000000000000005e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19540  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.44 
 
 		 567 aa  136  7.000000000000001e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.394832  normal  0.058637 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03395  dipeptide transporter  29.72 
 
 		 535 aa  136  8e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0168  4-phytase  29.72 
 
 		 535 aa  136  8e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03346  hypothetical protein  29.72 
 
 		 535 aa  136  8e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0171  4-phytase  29.72 
 
 		 535 aa  136  8e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4037  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  29.72 
 
 		 535 aa  136  8e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4912  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  29.72 
 
 		 535 aa  136  8e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3744  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  29.72 
 
 		 535 aa  136  8e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0138  extracellular solute-binding protein  27.67 
 
 		 535 aa  136  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1284  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  27.5 
 
 		 545 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000669385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1615  extracellular solute-binding protein  25.75 
 
 		 541 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.577375  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.96 
 
 		 510 aa  135  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3158  extracellular solute-binding protein  28.61 
 
 		 535 aa  136  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5116  ABC transporter periplasmic binding protein  31.02 
 
 		 531 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1440  extracellular solute-binding protein family 5  26.94 
 
 		 514 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  27.89 
 
 		 511 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3804  extracellular solute-binding protein  27.63 
 
 		 509 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00625229  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  27.07 
 
 		 565 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2484  extracellular solute-binding protein  25.22 
 
 		 541 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0213722 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  26.86 
 
 		 516 aa  134  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3863  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  29.44 
 
 		 535 aa  134  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4056  periplasmic dipeptide transport protein  27.44 
 
 		 535 aa  135  3e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0088  4-phytase  27.44 
 
 		 535 aa  135  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.534677  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58420  putative binding protein component of ABC dipeptid  30.77 
 
 		 533 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.851894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4075  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  27.44 
 
 		 535 aa  135  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3881  extracellular solute-binding protein  27.51 
 
 		 515 aa  134  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.441306  normal  0.0413131 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3006  extracellular solute-binding protein  28.9 
 
 		 528 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165169  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1313  extracellular solute-binding protein  26.91 
 
 		 493 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2532  extracellular solute-binding protein  27.98 
 
 		 535 aa  134  5e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384928 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0044  extracellular solute-binding protein family 5  28.37 
 
 		 535 aa  134  6e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2056  periplasmic dipeptide transport protein precursor  28.66 
 
 		 532 aa  134  6e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.184376  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3907  extracellular solute-binding protein family 5  28.98 
 
 		 535 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4682  extracellular solute-binding protein family 5  33.43 
 
 		 532 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0049  extracellular solute-binding protein family 5  28.14 
 
 		 535 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.46848  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>