More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1250 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1250  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 550 aa  1121    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.405882  normal  0.0838621 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1451  ABC peptide/nickel/opine transporter, periplasmic substrate-binding protein  35.06 
 
 		 524 aa  234  3e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.482227  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0100  extracellular solute-binding protein  35.06 
 
 		 524 aa  234  3e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.080172 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3756  extracellular solute-binding protein  31.62 
 
 		 540 aa  203  6e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0607711 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7272  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  30.85 
 
 		 528 aa  201  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  30.85 
 
 		 532 aa  202  1.9999999999999998e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4051  extracellular solute-binding protein family 5  31.42 
 
 		 523 aa  200  5e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.957525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4012  extracellular solute-binding protein family 5  31.01 
 
 		 523 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2590  putative ABC transporter, substrate-binding protein  29.88 
 
 		 526 aa  197  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.174207 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  27.06 
 
 		 534 aa  160  7e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  24.76 
 
 		 521 aa  158  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  24.76 
 
 		 521 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.76 
 
 		 521 aa  157  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  24.76 
 
 		 521 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  24.76 
 
 		 521 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3713  putative ABC transporter (substrate binding component)  29.57 
 
 		 516 aa  156  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  29.16 
 
 		 510 aa  154  4e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  25.68 
 
 		 495 aa  153  7e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  28.3 
 
 		 516 aa  151  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  28.27 
 
 		 505 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  27.94 
 
 		 509 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  25.79 
 
 		 535 aa  147  5e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0888  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  25.7 
 
 		 512 aa  147  6e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  27.45 
 
 		 502 aa  146  8.000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13240  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.85 
 
 		 504 aa  146  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0803154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0901  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  25.7 
 
 		 512 aa  145  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0981  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  25.7 
 
 		 512 aa  145  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2518  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  25.7 
 
 		 512 aa  145  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0890  glutathione-binding protein GsiB  25.58 
 
 		 512 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362875  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  25.7 
 
 		 512 aa  145  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2812  extracellular solute-binding protein family 5  25.7 
 
 		 512 aa  145  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.431185  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00814  hypothetical protein  25.7 
 
 		 512 aa  145  3e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.840204  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  28.3 
 
 		 510 aa  144  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2814  extracellular solute-binding protein  25.5 
 
 		 512 aa  144  5e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.993061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1000  glutathione-binding protein GsiB  25.37 
 
 		 512 aa  144  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0917  glutathione-binding protein GsiB  25.37 
 
 		 512 aa  144  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0979  glutathione-binding protein GsiB  25.37 
 
 		 512 aa  144  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0950  glutathione-binding protein GsiB  25.37 
 
 		 512 aa  144  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3130  extracellular solute-binding protein family 5  24.68 
 
 		 520 aa  143  8e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.777715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  29.12 
 
 		 512 aa  143  8e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  29.12 
 
 		 512 aa  143  8e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  29.12 
 
 		 512 aa  143  8e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00797  predicted peptide transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  25.79 
 
 		 493 aa  143  9e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.719474  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0015  extracellular solute-binding protein family 5  32.14 
 
 		 516 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2375  twin-arginine translocation pathway signal  27.82 
 
 		 514 aa  142  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3006  extracellular solute-binding protein  29.33 
 
 		 528 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165169  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  25.33 
 
 		 532 aa  142  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0015  extracellular solute-binding protein family 5  29.7 
 
 		 516 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.406265  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  26.07 
 
 		 520 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5067  extracellular solute-binding protein  29.43 
 
 		 495 aa  141  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.68424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2974  extracellular solute-binding protein family 5  25.54 
 
 		 514 aa  140  4.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1313  extracellular solute-binding protein  28.34 
 
 		 493 aa  140  6e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4426  extracellular solute-binding protein  25.7 
 
 		 520 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3525  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  27.92 
 
 		 535 aa  139  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0836  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  24.68 
 
 		 520 aa  139  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.385717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  28.48 
 
 		 511 aa  138  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3169  extracellular solute-binding protein  27.72 
 
 		 535 aa  139  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.116403 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1253  extracellular solute-binding protein family 5  25.17 
 
 		 517 aa  138  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.245274  normal  0.49371 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1440  extracellular solute-binding protein family 5  27.9 
 
 		 514 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1324  extracellular solute-binding protein  25.85 
 
 		 512 aa  138  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.725738 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1319  extracellular solute-binding protein family 5  24.94 
 
 		 521 aa  137  5e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0396363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  30.06 
 
 		 519 aa  137  6.0000000000000005e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3158  extracellular solute-binding protein  28.61 
 
 		 535 aa  136  9e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3653  extracellular solute-binding protein family 5  28.64 
 
 		 513 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0310608  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1658  extracellular solute-binding protein  26.91 
 
 		 516 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.710594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  29.16 
 
 		 531 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1189  extracellular solute-binding protein family 5  26.29 
 
 		 497 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2843  extracellular solute-binding protein  28.51 
 
 		 535 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.430895 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2974  extracellular solute-binding protein  28.41 
 
 		 530 aa  134  5e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  28.27 
 
 		 528 aa  134  5e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0146  extracellular solute-binding protein family 5  27.78 
 
 		 513 aa  133  6e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.377896  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  27.14 
 
 		 512 aa  133  6.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4398  extracellular solute-binding protein family 5  28.04 
 
 		 513 aa  133  7.999999999999999e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0482953  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3971  extracellular solute-binding protein family 5  28.15 
 
 		 518 aa  133  9e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0750  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  27.78 
 
 		 559 aa  133  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0146598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4455  extracellular solute-binding protein  25.46 
 
 		 509 aa  133  9e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.661138  hitchhiker  0.000234808 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  27.8 
 
 		 515 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4225  extracellular solute-binding protein  24.74 
 
 		 520 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1506  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 		 501 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0306373  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3881  extracellular solute-binding protein  27.47 
 
 		 515 aa  132  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.441306  normal  0.0413131 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4109  extracellular solute-binding protein family 5  27.81 
 
 		 513 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344383  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4203  extracellular solute-binding protein  25.32 
 
 		 520 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237738  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1491  extracellular solute-binding protein family 5  24.85 
 
 		 514 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3571  extracellular solute-binding protein  25.59 
 
 		 520 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57508  normal  0.258108 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4163  extracellular solute-binding protein  25.32 
 
 		 520 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0633493  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1380  substate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  24.12 
 
 		 517 aa  131  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.630202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0494  extracellular solute-binding protein family 5  26.91 
 
 		 536 aa  131  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.080678  normal  0.301708 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4052  extracellular solute-binding protein  25.59 
 
 		 520 aa  131  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544759  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2619  extracellular solute-binding protein family 5  29.65 
 
 		 512 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.181451  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3353  extracellular solute-binding protein  25.11 
 
 		 520 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.587262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  27.68 
 
 		 510 aa  130  6e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4591  extracellular solute-binding protein  28.03 
 
 		 517 aa  130  8.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0777489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0074  twin-arginine translocation pathway signal  30.23 
 
 		 514 aa  130  8.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0403886  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  24.95 
 
 		 541 aa  130  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2113  extracellular solute-binding protein  27.8 
 
 		 527 aa  129  9.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142361  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0611  extracellular solute-binding protein family 5  25.33 
 
 		 527 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0391  extracellular solute-binding protein  28.12 
 
 		 522 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1867  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC periplasmic ligand-binding protein  24.26 
 
 		 520 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.30378  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  26.17 
 
 		 505 aa  129  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0139  extracellular solute-binding protein  27.32 
 
 		 520 aa  129  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.382397 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>