More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3756 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4012  extracellular solute-binding protein family 5  96.94 
 
 		 523 aa  1057    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7272  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  82.54 
 
 		 528 aa  914    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1451  ABC peptide/nickel/opine transporter, periplasmic substrate-binding protein  72.55 
 
 		 524 aa  794    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.482227  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3756  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 540 aa  1117    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0607711 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0100  extracellular solute-binding protein  72.55 
 
 		 524 aa  794    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.080172 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4051  extracellular solute-binding protein family 5  99.43 
 
 		 523 aa  1075    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.957525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2590  putative ABC transporter, substrate-binding protein  81.52 
 
 		 526 aa  899    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.174207 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1250  extracellular solute-binding protein family 5  31.62 
 
 		 550 aa  203  5e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.405882  normal  0.0838621 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4426  extracellular solute-binding protein  26.73 
 
 		 520 aa  140  6e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4052  extracellular solute-binding protein  26.27 
 
 		 520 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3571  extracellular solute-binding protein  26.27 
 
 		 520 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57508  normal  0.258108 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  27.34 
 
 		 505 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4109  extracellular solute-binding protein family 5  27.46 
 
 		 513 aa  133  6.999999999999999e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344383  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4225  extracellular solute-binding protein  26.52 
 
 		 520 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1113  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein, putative  27.84 
 
 		 520 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.322522  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3353  extracellular solute-binding protein  25.9 
 
 		 520 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.587262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4203  extracellular solute-binding protein  25.9 
 
 		 520 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237738  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4163  extracellular solute-binding protein  25.9 
 
 		 520 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0633493  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4398  extracellular solute-binding protein family 5  27.27 
 
 		 513 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0482953  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1359  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  26.83 
 
 		 520 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.442837  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0975  putative dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  26.83 
 
 		 520 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.124849  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0324  putative ABC transporter substrate-binding protein  26.83 
 
 		 520 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1768  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  26.83 
 
 		 520 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.852283  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1853  putative binding protein YliB  26.83 
 
 		 520 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0402  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  26.83 
 
 		 520 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0238  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  26.83 
 
 		 520 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2795  extracellular solute-binding protein family 5  29.53 
 
 		 499 aa  131  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.730452 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  28.41 
 
 		 528 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1506  extracellular solute-binding protein  27.39 
 
 		 501 aa  130  8.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0306373  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3971  extracellular solute-binding protein family 5  26.3 
 
 		 518 aa  129  9.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7328  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  27.73 
 
 		 517 aa  130  9.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.399444  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1926  extracellular solute-binding protein  28.49 
 
 		 518 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.293523  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1867  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC periplasmic ligand-binding protein  26.01 
 
 		 520 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.30378  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0722  radical SAM domain-containing protein  27.95 
 
 		 522 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.597639 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  29.19 
 
 		 521 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  29.19 
 
 		 521 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  29.19 
 
 		 521 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  29.19 
 
 		 521 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3907  extracellular solute-binding protein family 5  26.09 
 
 		 535 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3431  extracellular solute-binding protein  25.19 
 
 		 531 aa  127  6e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000878954 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3950  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  26.97 
 
 		 526 aa  127  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  28.83 
 
 		 521 aa  127  7e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3842  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  26.97 
 
 		 526 aa  127  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3906  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  26.97 
 
 		 526 aa  127  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.938997 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3863  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  26.38 
 
 		 535 aa  125  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1288  extracellular solute-binding protein  27.46 
 
 		 492 aa  125  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213997  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03395  dipeptide transporter  26.38 
 
 		 535 aa  125  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0168  4-phytase  26.38 
 
 		 535 aa  125  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4037  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  26.38 
 
 		 535 aa  125  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0077  extracellular solute-binding protein family 5  29.63 
 
 		 501 aa  125  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0171  4-phytase  26.38 
 
 		 535 aa  125  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03346  hypothetical protein  26.38 
 
 		 535 aa  125  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4010  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  26.74 
 
 		 526 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0044  extracellular solute-binding protein family 5  25.96 
 
 		 535 aa  125  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  25.42 
 
 		 532 aa  125  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4912  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  26.38 
 
 		 535 aa  125  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3744  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  26.38 
 
 		 535 aa  125  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  27.51 
 
 		 546 aa  124  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3828  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  26.74 
 
 		 526 aa  125  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.808847  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0146  extracellular solute-binding protein family 5  26.9 
 
 		 513 aa  124  4e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.377896  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3653  extracellular solute-binding protein family 5  27.31 
 
 		 513 aa  124  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0310608  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  27.79 
 
 		 540 aa  124  6e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  26.56 
 
 		 541 aa  123  7e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5018  extracellular solute-binding protein family 5  26.84 
 
 		 526 aa  123  7e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0327585 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  27.14 
 
 		 505 aa  123  8e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1012  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.76 
 
 		 492 aa  122  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622148  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3103  extracellular solute-binding protein  27.74 
 
 		 519 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0954  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.76 
 
 		 479 aa  123  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  25.05 
 
 		 495 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0184  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 		 535 aa  122  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.507506 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0049  extracellular solute-binding protein family 5  26.17 
 
 		 535 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.46848  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1324  extracellular solute-binding protein  26.65 
 
 		 512 aa  122  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.725738 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5016  extracellular solute-binding protein family 5  27.25 
 
 		 475 aa  122  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.131281 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1837  extracellular solute-binding protein family 5  30.75 
 
 		 532 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.350378  normal  0.136519 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13240  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  24.57 
 
 		 504 aa  121  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0803154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4075  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  26.4 
 
 		 535 aa  121  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3678  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.94 
 
 		 525 aa  121  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0885273 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0836  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  25.47 
 
 		 520 aa  121  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.385717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2161  extracellular solute-binding protein family 5  30.75 
 
 		 532 aa  121  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.283164 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4056  periplasmic dipeptide transport protein  26.4 
 
 		 535 aa  121  3e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0088  4-phytase  26.4 
 
 		 535 aa  121  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.534677  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0139  extracellular solute-binding protein  26.16 
 
 		 520 aa  121  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.382397 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4381  extracellular solute-binding protein  27.25 
 
 		 510 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.582693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0114  extracellular solute-binding protein  26.94 
 
 		 530 aa  120  4.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  26.07 
 
 		 502 aa  120  6e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2769  extracellular solute-binding protein  28.02 
 
 		 507 aa  120  6e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12042  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3630  extracellular solute-binding protein family 5  29.18 
 
 		 514 aa  120  6e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  26.82 
 
 		 524 aa  120  6e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3130  extracellular solute-binding protein family 5  24.9 
 
 		 520 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.777715  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5344  extracellular solute-binding protein family 5  30.28 
 
 		 506 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.297716  normal  0.516905 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1408  extracellular solute-binding protein  26.74 
 
 		 518 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00741999  normal  0.0556416 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2974  extracellular solute-binding protein  26.93 
 
 		 530 aa  118  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4098  extracellular solute-binding protein family 5  25.28 
 
 		 535 aa  118  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.06 
 
 		 510 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3507  extracellular solute-binding protein family 5  29.18 
 
 		 510 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.224944  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0138  extracellular solute-binding protein  26.07 
 
 		 535 aa  117  5e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1253  extracellular solute-binding protein family 5  26.96 
 
 		 517 aa  117  5e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.245274  normal  0.49371 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2335  extracellular solute-binding protein  29.72 
 
 		 531 aa  117  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.913035  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0921  extracellular solute-binding protein  26.48 
 
 		 536 aa  117  6e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.776476  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2411  extracellular solute-binding protein family 5  25.46 
 
 		 531 aa  117  6.9999999999999995e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.334082  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>