More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1451 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7272  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  72.17 
 
 		 528 aa  801    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4051  extracellular solute-binding protein family 5  72.55 
 
 		 523 aa  798    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.957525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4012  extracellular solute-binding protein family 5  72.74 
 
 		 523 aa  804    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1451  ABC peptide/nickel/opine transporter, periplasmic substrate-binding protein  100 
 
 		 524 aa  1084    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.482227  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2590  putative ABC transporter, substrate-binding protein  71.29 
 
 		 526 aa  789    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.174207 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3756  extracellular solute-binding protein  72.74 
 
 		 540 aa  802    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0607711 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0100  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 524 aa  1084    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.080172 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1250  extracellular solute-binding protein family 5  35.06 
 
 		 550 aa  234  2.0000000000000002e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.405882  normal  0.0838621 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13240  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.87 
 
 		 504 aa  154  5e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0803154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  30.46 
 
 		 510 aa  150  4e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4109  extracellular solute-binding protein family 5  28.1 
 
 		 513 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344383  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  29.43 
 
 		 510 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4398  extracellular solute-binding protein family 5  28.32 
 
 		 513 aa  141  3e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0482953  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2769  extracellular solute-binding protein  29.26 
 
 		 507 aa  139  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12042  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5016  extracellular solute-binding protein family 5  29.49 
 
 		 475 aa  139  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.131281 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  26.73 
 
 		 505 aa  138  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3431  extracellular solute-binding protein  25.13 
 
 		 531 aa  137  6.0000000000000005e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000878954 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3971  extracellular solute-binding protein family 5  28.04 
 
 		 518 aa  136  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  27.47 
 
 		 546 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  28.31 
 
 		 523 aa  135  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  28.25 
 
 		 528 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  26.23 
 
 		 512 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3678  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.76 
 
 		 525 aa  134  5e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0885273 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  25.89 
 
 		 532 aa  134  5e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  28.09 
 
 		 510 aa  134  5e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  25.87 
 
 		 541 aa  133  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2795  extracellular solute-binding protein family 5  29.68 
 
 		 499 aa  133  6.999999999999999e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.730452 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7328  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  28.83 
 
 		 517 aa  133  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.399444  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  26.76 
 
 		 515 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2006  transport binding transmembrane protein  31.27 
 
 		 528 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  28.6 
 
 		 521 aa  130  6e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  28.7 
 
 		 521 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  28.7 
 
 		 521 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  28.7 
 
 		 521 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  28.7 
 
 		 521 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  28.4 
 
 		 540 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  26.16 
 
 		 502 aa  129  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0044  extracellular solute-binding protein family 5  25.22 
 
 		 535 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5070  extracellular solute-binding protein  30.25 
 
 		 495 aa  128  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.27843  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3907  extracellular solute-binding protein family 5  25.82 
 
 		 535 aa  127  5e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  27.09 
 
 		 512 aa  127  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  27.09 
 
 		 512 aa  127  5e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  27.09 
 
 		 512 aa  127  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4455  extracellular solute-binding protein  26.56 
 
 		 509 aa  127  6e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.661138  hitchhiker  0.000234808 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0184  extracellular solute-binding protein family 5  27.14 
 
 		 518 aa  127  6e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0244  extracellular solute-binding protein family 5  26.32 
 
 		 575 aa  127  7e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.794885  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0049  extracellular solute-binding protein family 5  25.22 
 
 		 535 aa  125  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.46848  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  27.97 
 
 		 511 aa  125  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0722  radical SAM domain-containing protein  28.07 
 
 		 522 aa  126  1e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.597639 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  27.64 
 
 		 516 aa  125  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2335  extracellular solute-binding protein  30.87 
 
 		 531 aa  125  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.913035  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0139  extracellular solute-binding protein  27.52 
 
 		 520 aa  125  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.382397 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3863  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  26.26 
 
 		 535 aa  125  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4225  extracellular solute-binding protein  27.57 
 
 		 520 aa  125  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1288  extracellular solute-binding protein  28.33 
 
 		 492 aa  124  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213997  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.53 
 
 		 520 aa  124  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2161  extracellular solute-binding protein family 5  30.46 
 
 		 532 aa  124  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.283164 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03395  dipeptide transporter  26.04 
 
 		 535 aa  124  5e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0168  4-phytase  26.04 
 
 		 535 aa  124  5e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03346  hypothetical protein  26.04 
 
 		 535 aa  124  5e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1837  extracellular solute-binding protein family 5  30.46 
 
 		 532 aa  124  5e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.350378  normal  0.136519 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3744  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  26.04 
 
 		 535 aa  124  5e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4037  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  26.04 
 
 		 535 aa  124  5e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0171  4-phytase  26.04 
 
 		 535 aa  124  5e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4912  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  26.04 
 
 		 535 aa  124  5e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  30.42 
 
 		 509 aa  124  6e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3353  extracellular solute-binding protein  25.15 
 
 		 520 aa  123  7e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.587262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1867  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC periplasmic ligand-binding protein  25.78 
 
 		 520 aa  123  8e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.30378  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4203  extracellular solute-binding protein  25.15 
 
 		 520 aa  123  8e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237738  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4163  extracellular solute-binding protein  25.15 
 
 		 520 aa  123  8e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0633493  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  30 
 
 		 505 aa  123  9e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3804  extracellular solute-binding protein  26.43 
 
 		 509 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00625229  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0146  extracellular solute-binding protein family 5  27.65 
 
 		 513 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.377896  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0418  extracellular solute-binding protein family 5  24.95 
 
 		 622 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3103  extracellular solute-binding protein  27.46 
 
 		 519 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4098  extracellular solute-binding protein family 5  24.83 
 
 		 535 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4052  extracellular solute-binding protein  26.15 
 
 		 520 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3571  extracellular solute-binding protein  26.27 
 
 		 520 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57508  normal  0.258108 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  30.42 
 
 		 509 aa  121  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0459  extracellular solute-binding protein  27.98 
 
 		 504 aa  121  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.435025  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0114  extracellular solute-binding protein  27.49 
 
 		 530 aa  121  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5344  extracellular solute-binding protein family 5  29.36 
 
 		 506 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.297716  normal  0.516905 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  29.41 
 
 		 520 aa  121  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2496  extracellular solute-binding protein  30.59 
 
 		 538 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0292957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3950  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  26.15 
 
 		 526 aa  121  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3906  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  26.15 
 
 		 526 aa  121  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.938997 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3842  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  26.15 
 
 		 526 aa  121  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4010  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  26.15 
 
 		 526 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2678  extracellular solute-binding protein  28.07 
 
 		 500 aa  120  6e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00233729  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4392  extracellular solute-binding protein  27.58 
 
 		 521 aa  120  6e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0077  extracellular solute-binding protein family 5  29.44 
 
 		 501 aa  120  6e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3507  extracellular solute-binding protein family 5  28.23 
 
 		 510 aa  120  7e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.224944  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1752  extracellular solute-binding protein family 5  27.33 
 
 		 582 aa  120  7e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  28.53 
 
 		 532 aa  120  7.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4426  extracellular solute-binding protein  25.48 
 
 		 520 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3603  extracellular solute-binding protein  29.25 
 
 		 507 aa  120  7.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.721238 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1658  extracellular solute-binding protein  26.1 
 
 		 516 aa  120  7.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.710594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  26.59 
 
 		 505 aa  120  7.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2237  extracellular solute-binding protein  25.9 
 
 		 550 aa  120  7.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0138  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 		 535 aa  119  9e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>