More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0582 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0582  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
645 aa  1290    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0541  extracellular solute-binding protein family 5  40.57 
 
 
632 aa  427  1e-118  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.843572  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0883  extracellular solute-binding protein family 5  31.17 
 
 
547 aa  114  7.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  28.26 
 
 
509 aa  97.8  5e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  26.57 
 
 
532 aa  88.2  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3507  extracellular solute-binding protein family 5  25.91 
 
 
510 aa  86.7  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.224944  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2974  extracellular solute-binding protein family 5  22.6 
 
 
514 aa  85.5  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  22.72 
 
 
516 aa  83.2  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0782  extracellular solute-binding protein  27.55 
 
 
494 aa  83.6  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.319175  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3603  extracellular solute-binding protein  26.24 
 
 
507 aa  83.2  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.721238 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1090  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.06 
 
 
514 aa  82  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0337  extracellular solute-binding protein family 5  25.2 
 
 
521 aa  82  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0210  extracellular solute-binding protein  21.46 
 
 
512 aa  81.6  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0873116  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3630  extracellular solute-binding protein family 5  24.15 
 
 
514 aa  80.9  0.00000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  23.95 
 
 
542 aa  80.9  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1582  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
531 aa  80.5  0.00000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264898  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4859  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.1 
 
 
532 aa  79.3  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1491  extracellular solute-binding protein family 5  22.49 
 
 
514 aa  79.3  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2857  extracellular solute-binding protein  24.86 
 
 
542 aa  79.7  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.791512  normal  0.700488 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3449  extracellular solute-binding protein family 5  26.83 
 
 
515 aa  78.6  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.802426 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1001  twin-arginine translocation pathway signal  24.58 
 
 
542 aa  79  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.483502  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0960  extracellular solute-binding protein family 5  26.32 
 
 
547 aa  77.8  0.0000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2870  periplasmic dipeptide transport protein  27.59 
 
 
509 aa  77.4  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00619899  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3653  extracellular solute-binding protein family 5  24.39 
 
 
513 aa  77.4  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0310608  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0449  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 
520 aa  77.4  0.0000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3003  extracellular solute-binding protein family 5  20.58 
 
 
516 aa  77.4  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6464  putative oligopeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  24.38 
 
 
545 aa  76.6  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.69774 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1638  extracellular solute-binding protein  23.58 
 
 
529 aa  76.6  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.343389  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1551  extracellular solute-binding protein  23.18 
 
 
512 aa  75.9  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1000  glutathione-binding protein GsiB  23.05 
 
 
512 aa  75.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4225  extracellular solute-binding protein  21.67 
 
 
520 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0890  glutathione-binding protein GsiB  23.05 
 
 
512 aa  76.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362875  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0950  glutathione-binding protein GsiB  23.05 
 
 
512 aa  75.5  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  21.55 
 
 
522 aa  75.5  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1837  extracellular solute-binding protein  24.58 
 
 
544 aa  75.5  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0917  glutathione-binding protein GsiB  23.05 
 
 
512 aa  75.5  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  21.34 
 
 
512 aa  75.5  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0979  glutathione-binding protein GsiB  23.05 
 
 
512 aa  75.5  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4591  extracellular solute-binding protein  20.18 
 
 
517 aa  75.5  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0777489  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0187  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.37 
 
 
542 aa  74.7  0.000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2974  extracellular solute-binding protein  26.98 
 
 
530 aa  74.7  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3006  extracellular solute-binding protein  26.34 
 
 
528 aa  74.7  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165169  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1873  extracellular solute-binding protein  24.35 
 
 
526 aa  74.7  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.021803  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5037  extracellular solute-binding protein  27.11 
 
 
534 aa  74.7  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4089  normal  0.963466 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3158  extracellular solute-binding protein  26.44 
 
 
535 aa  74.3  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1324  extracellular solute-binding protein  22.12 
 
 
512 aa  74.3  0.000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.725738 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  22.49 
 
 
520 aa  73.9  0.000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00797  predicted peptide transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  22.46 
 
 
493 aa  73.6  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.719474  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2812  extracellular solute-binding protein family 5  22.16 
 
 
512 aa  73.6  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.431185  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  22.66 
 
 
538 aa  73.6  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  22.46 
 
 
512 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1867  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC periplasmic ligand-binding protein  20.12 
 
 
520 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.30378  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00814  hypothetical protein  22.16 
 
 
512 aa  73.6  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.840204  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0901  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  22.16 
 
 
512 aa  72.8  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4491  extracellular solute-binding protein family 5  22.22 
 
 
509 aa  72.8  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0391  extracellular solute-binding protein  22.18 
 
 
522 aa  73.2  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0910  extracellular solute-binding protein  21.83 
 
 
555 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.463169  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  25.62 
 
 
505 aa  72.4  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0716  peptide/oligopeptide/nickel ABC transporter substrate-binding protein  26.11 
 
 
541 aa  73.2  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0244  extracellular solute-binding protein family 5  25.95 
 
 
575 aa  73.2  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.794885  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2518  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  22.16 
 
 
512 aa  72.4  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0221  extracellular solute-binding protein  21.95 
 
 
470 aa  72  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5416  extracellular solute-binding protein  26.74 
 
 
534 aa  72  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.604179 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4426  extracellular solute-binding protein  19.57 
 
 
520 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3635  extracellular solute-binding protein  24.3 
 
 
515 aa  72.4  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.014259  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0227  extracellular solute-binding protein  21.95 
 
 
470 aa  72  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0981  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  22.16 
 
 
512 aa  72.4  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  22.75 
 
 
510 aa  72  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2547  extracellular solute-binding protein  26.54 
 
 
534 aa  72.4  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220611  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0044  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  24.72 
 
 
530 aa  71.6  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2814  extracellular solute-binding protein  22.16 
 
 
512 aa  71.6  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.993061  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2619  extracellular solute-binding protein family 5  24.45 
 
 
512 aa  71.6  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.181451  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.51 
 
 
520 aa  71.6  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0139  extracellular solute-binding protein  19.42 
 
 
520 aa  71.6  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.382397 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4734  extracellular solute-binding protein  24.8 
 
 
521 aa  71.6  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.676308  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3852  extracellular solute-binding protein  22.37 
 
 
521 aa  71.6  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0773863  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0888  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  22.16 
 
 
512 aa  71.6  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2542  extracellular solute-binding protein  23.51 
 
 
521 aa  71.2  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0150221  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00493  ABC-type dipeptide transporter periplasmic component  22.78 
 
 
519 aa  71.2  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0608  extracellular solute-binding protein family 5  17.58 
 
 
549 aa  71.2  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.995783  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2335  extracellular solute-binding protein  23.28 
 
 
531 aa  71.2  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.913035  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  23.16 
 
 
515 aa  70.9  0.00000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0252  extracellular solute-binding protein family 5  26.55 
 
 
546 aa  71.2  0.00000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001974  peptide ABC transporter peptide-binding protein  23.17 
 
 
517 aa  71.2  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1660  extracellular solute-binding protein family 5  27.07 
 
 
539 aa  71.2  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.40005  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4381  extracellular solute-binding protein  21.9 
 
 
510 aa  71.2  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.582693  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2585  putative ABC transporter, substrate binding subunit  25.42 
 
 
520 aa  71.2  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0598963 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  21.75 
 
 
565 aa  70.9  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5067  extracellular solute-binding protein  25.16 
 
 
495 aa  70.9  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.68424  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0645  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  27.8 
 
 
524 aa  70.5  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0562  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  23.75 
 
 
518 aa  70.5  0.00000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  21.28 
 
 
538 aa  70.5  0.00000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0623  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  22.34 
 
 
593 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0400  extracellular solute-binding protein family 5  23.87 
 
 
525 aa  70.5  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  22.91 
 
 
541 aa  70.1  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0656  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  22.34 
 
 
593 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3706  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 
533 aa  70.1  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0713  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  22.34 
 
 
593 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00303874 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0722  radical SAM domain-containing protein  25.31 
 
 
522 aa  70.5  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.597639 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2496  extracellular solute-binding protein  25.38 
 
 
538 aa  70.1  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0292957  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>