More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_0221 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_0227  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
470 aa  955    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0221  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
470 aa  955    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1994  ABC transporter, substrate-binding protein  57.94 
 
 
491 aa  561  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0337  extracellular solute-binding protein family 5  31.88 
 
 
521 aa  216  7e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  24.72 
 
 
532 aa  164  3e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3678  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.52 
 
 
525 aa  158  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0885273 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1284  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  27.06 
 
 
545 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000669385  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.99 
 
 
520 aa  157  6e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04510  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  24.21 
 
 
551 aa  153  5e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23612  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0645  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  26.62 
 
 
524 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0210  extracellular solute-binding protein  26.11 
 
 
512 aa  150  5e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0873116  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0450  extracellular solute-binding protein family 5  26.3 
 
 
519 aa  149  9e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.15126 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0723  hypothetical protein  25.94 
 
 
527 aa  147  3e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.703564  normal  0.46015 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  27.7 
 
 
516 aa  145  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0722  radical SAM domain-containing protein  25.95 
 
 
522 aa  139  7e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.597639 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2678  extracellular solute-binding protein  25.96 
 
 
500 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00233729  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0218  extracellular solute-binding protein  25.39 
 
 
537 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.219975  normal  0.837771 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18790  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.2 
 
 
540 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00232176  normal  0.206883 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0753  extracellular solute-binding protein  25.11 
 
 
490 aa  131  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139724  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1873  extracellular solute-binding protein  26.55 
 
 
526 aa  131  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.021803  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0370  extracellular solute-binding protein  25.9 
 
 
497 aa  129  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.735975  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1652  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.67 
 
 
511 aa  129  1.0000000000000001e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.2387  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  25.82 
 
 
512 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0888  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  25.61 
 
 
512 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1571  4-phytase  23.57 
 
 
510 aa  127  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.624152  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2518  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  25.61 
 
 
512 aa  127  5e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0901  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  25.61 
 
 
512 aa  127  5e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0981  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  25.61 
 
 
512 aa  127  5e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00797  predicted peptide transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  25.61 
 
 
493 aa  127  6e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.719474  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2812  extracellular solute-binding protein family 5  25.61 
 
 
512 aa  127  6e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.431185  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00814  hypothetical protein  25.61 
 
 
512 aa  127  6e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.840204  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2032  ABC transporter, periplasmic binding protein  24.73 
 
 
524 aa  126  9e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662418  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  27.11 
 
 
495 aa  125  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2405  extracellular solute-binding protein family 5  23.39 
 
 
518 aa  125  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2814  extracellular solute-binding protein  25.41 
 
 
512 aa  124  5e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.993061  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3971  extracellular solute-binding protein family 5  24.78 
 
 
518 aa  123  9e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2626  extracellular solute-binding protein family 5  24.49 
 
 
503 aa  122  9e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.253128  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0145  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.27 
 
 
521 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0146  extracellular solute-binding protein family 5  24.95 
 
 
513 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.377896  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  23.62 
 
 
520 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4398  extracellular solute-binding protein family 5  23.98 
 
 
513 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0482953  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1000  glutathione-binding protein GsiB  24.44 
 
 
512 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0748  extracellular solute-binding protein  25.5 
 
 
535 aa  120  7e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0950  glutathione-binding protein GsiB  24.24 
 
 
512 aa  120  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0917  glutathione-binding protein GsiB  24.24 
 
 
512 aa  120  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0979  glutathione-binding protein GsiB  24.24 
 
 
512 aa  120  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1902  extracellular solute-binding protein family 5  24.55 
 
 
501 aa  119  7.999999999999999e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000145643  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0329  extracellular solute-binding protein  26.36 
 
 
531 aa  119  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  0.0616043 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0890  glutathione-binding protein GsiB  24.24 
 
 
512 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362875  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0067  extracellular solute-binding protein  26.78 
 
 
542 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0111  extracellular solute-binding protein family 5  25.06 
 
 
517 aa  117  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2595  putative extracellular solute-binding protein  23.03 
 
 
507 aa  117  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00975919 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1324  extracellular solute-binding protein  24.95 
 
 
512 aa  118  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.725738 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1044  extracellular solute-binding protein family 5  24.81 
 
 
496 aa  117  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0364384  normal  0.362635 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4052  extracellular solute-binding protein  22.69 
 
 
520 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544759  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4109  extracellular solute-binding protein family 5  23.22 
 
 
513 aa  117  5e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344383  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3571  extracellular solute-binding protein  22.69 
 
 
520 aa  117  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57508  normal  0.258108 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0750  extracellular solute-binding protein  25.06 
 
 
535 aa  117  5e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0094  extracellular solute-binding protein  23.25 
 
 
498 aa  116  8.999999999999998e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  22.96 
 
 
509 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3706  extracellular solute-binding protein family 5  23.11 
 
 
533 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  24.55 
 
 
519 aa  115  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2087  extracellular solute-binding protein family 5  26.62 
 
 
522 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159106  normal  0.621098 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  23.37 
 
 
521 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  25.9 
 
 
535 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  26.01 
 
 
528 aa  113  9e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  23.57 
 
 
576 aa  113  9e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  23.15 
 
 
521 aa  113  9e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.15 
 
 
521 aa  113  9e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  23.15 
 
 
521 aa  113  9e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  23.15 
 
 
521 aa  113  9e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0449  extracellular solute-binding protein  25.83 
 
 
520 aa  113  9e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0044  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  22.95 
 
 
530 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0745  extracellular solute-binding protein  25.85 
 
 
534 aa  112  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1491  extracellular solute-binding protein family 5  24.9 
 
 
514 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7214  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  27.07 
 
 
532 aa  113  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4426  extracellular solute-binding protein  22.25 
 
 
520 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3383  extracellular solute-binding protein family 5  23.33 
 
 
533 aa  111  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4285  extracellular solute-binding protein  23.78 
 
 
530 aa  111  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.261799  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1764  extracellular solute-binding protein family 5  26.42 
 
 
526 aa  111  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4203  extracellular solute-binding protein  21.81 
 
 
520 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237738  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4163  extracellular solute-binding protein  21.81 
 
 
520 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0633493  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  23.23 
 
 
505 aa  110  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3809  extracellular solute-binding protein family 5  23.65 
 
 
521 aa  110  8.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.406271  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0391  extracellular solute-binding protein  23.85 
 
 
522 aa  110  8.000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3353  extracellular solute-binding protein  21.81 
 
 
520 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.587262  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2974  extracellular solute-binding protein family 5  23.82 
 
 
514 aa  109  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0184  extracellular solute-binding protein family 5  23.32 
 
 
518 aa  109  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  20.81 
 
 
531 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2335  extracellular solute-binding protein  24.34 
 
 
531 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.913035  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  24.02 
 
 
502 aa  108  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4491  extracellular solute-binding protein family 5  24.42 
 
 
509 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1551  extracellular solute-binding protein  22.95 
 
 
512 aa  107  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3881  extracellular solute-binding protein  26.55 
 
 
515 aa  107  5e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.441306  normal  0.0413131 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1982  extracellular solute-binding protein  24.84 
 
 
508 aa  107  6e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.204968  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2850  putative ABC transporter substrate-binding protein  23.74 
 
 
490 aa  107  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.938621  normal  0.738445 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  26.37 
 
 
505 aa  107  7e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1224  extracellular solute-binding protein family 5  24.36 
 
 
544 aa  107  7e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0137957 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3969  extracellular solute-binding protein  25.73 
 
 
532 aa  106  8e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3231  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  25.73 
 
 
532 aa  106  8e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.704667  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>