More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_04510 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_04510  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  100 
 
 
551 aa  1133    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23612  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0337  extracellular solute-binding protein family 5  31.24 
 
 
521 aa  238  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0723  hypothetical protein  29 
 
 
527 aa  216  9.999999999999999e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.703564  normal  0.46015 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0645  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  30.91 
 
 
524 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0450  extracellular solute-binding protein family 5  30.94 
 
 
519 aa  210  4e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.15126 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1284  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  31.84 
 
 
545 aa  208  2e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000669385  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0722  radical SAM domain-containing protein  29.26 
 
 
522 aa  188  2e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.597639 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3678  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.56 
 
 
525 aa  187  6e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0885273 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0210  extracellular solute-binding protein  28.54 
 
 
512 aa  182  1e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0873116  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  29.52 
 
 
516 aa  179  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27 
 
 
520 aa  177  5e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0218  extracellular solute-binding protein  27.63 
 
 
537 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.219975  normal  0.837771 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0370  extracellular solute-binding protein  26.48 
 
 
497 aa  172  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.735975  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0221  extracellular solute-binding protein  24.21 
 
 
470 aa  153  5.9999999999999996e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0227  extracellular solute-binding protein  24.21 
 
 
470 aa  153  5.9999999999999996e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2595  putative extracellular solute-binding protein  27.29 
 
 
507 aa  153  7e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00975919 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1994  ABC transporter, substrate-binding protein  23.56 
 
 
491 aa  153  7e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0391  extracellular solute-binding protein  27.75 
 
 
522 aa  151  3e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1571  4-phytase  27.57 
 
 
510 aa  144  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.624152  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  27.75 
 
 
532 aa  143  7e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3809  extracellular solute-binding protein family 5  27.82 
 
 
521 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.406271  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1044  extracellular solute-binding protein family 5  28.6 
 
 
496 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0364384  normal  0.362635 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2405  extracellular solute-binding protein family 5  26.82 
 
 
518 aa  138  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0365  extracellular solute-binding protein family 5  28.1 
 
 
517 aa  139  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  23.88 
 
 
521 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  23.65 
 
 
521 aa  134  5e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  23.65 
 
 
521 aa  134  5e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.65 
 
 
521 aa  134  5e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  23.65 
 
 
521 aa  134  5e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  25.29 
 
 
509 aa  134  6e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  25.62 
 
 
508 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  25.69 
 
 
516 aa  132  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  24.66 
 
 
520 aa  131  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  27.63 
 
 
531 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  27.13 
 
 
515 aa  130  6e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.1 
 
 
510 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0939  extracellular solute-binding protein family 5  28.03 
 
 
532 aa  129  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1341  extracellular solute-binding protein  28.14 
 
 
500 aa  127  6e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  26.49 
 
 
534 aa  127  7e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  26.51 
 
 
505 aa  125  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04010  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.45 
 
 
548 aa  125  2e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.115797  normal  0.0514058 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2648  extracellular solute-binding protein  26.02 
 
 
524 aa  125  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3973  extracellular solute-binding protein family 5  30.41 
 
 
549 aa  125  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  26.44 
 
 
528 aa  124  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  25.4 
 
 
528 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0542  extracellular solute-binding protein family 5  26.82 
 
 
537 aa  121  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.578152 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  25.65 
 
 
515 aa  120  6e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  25.05 
 
 
512 aa  119  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1825  extracellular solute-binding protein family 5  26.6 
 
 
502 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.778707  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2619  extracellular solute-binding protein family 5  25.87 
 
 
512 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.181451  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2017  extracellular solute-binding protein  25.11 
 
 
523 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0245155  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5619  extracellular solute-binding protein  28.1 
 
 
526 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4089  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  25.81 
 
 
510 aa  114  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  25.51 
 
 
535 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  24.94 
 
 
510 aa  114  5e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  25.05 
 
 
559 aa  114  5e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  31.01 
 
 
505 aa  113  7.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1506  extracellular solute-binding protein  23.92 
 
 
501 aa  113  8.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0306373  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  26.83 
 
 
544 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  26.05 
 
 
540 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1321  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  26.88 
 
 
513 aa  113  1.0000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000477414  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4859  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.57 
 
 
532 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0563  extracellular solute-binding protein  26.65 
 
 
536 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0406443  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2069  extracellular solute-binding protein family 5  28.26 
 
 
518 aa  112  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2032  ABC transporter, periplasmic binding protein  24.07 
 
 
524 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662418  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4203  extracellular solute-binding protein  23.48 
 
 
520 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237738  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4163  extracellular solute-binding protein  23.48 
 
 
520 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0633493  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0145  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.51 
 
 
521 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  23.88 
 
 
512 aa  111  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  23.88 
 
 
512 aa  111  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3130  extracellular solute-binding protein family 5  24.6 
 
 
520 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.777715  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  23.88 
 
 
512 aa  111  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3353  extracellular solute-binding protein  23.25 
 
 
520 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.587262  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1440  extracellular solute-binding protein family 5  23.23 
 
 
514 aa  110  5e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3968  extracellular solute-binding protein  26.77 
 
 
537 aa  110  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.252184  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1425  extracellular solute-binding protein family 5  25.46 
 
 
503 aa  110  9.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.4744  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1450  peptide ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.79 
 
 
511 aa  110  1e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000430411  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  25.58 
 
 
519 aa  109  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0273  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  24.84 
 
 
525 aa  109  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  25.81 
 
 
509 aa  109  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4052  extracellular solute-binding protein  23.48 
 
 
520 aa  109  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544759  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  24.89 
 
 
505 aa  108  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0836  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  24.6 
 
 
520 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.385717  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3571  extracellular solute-binding protein  23.48 
 
 
520 aa  109  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57508  normal  0.258108 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2741  extracellular solute-binding protein  26.68 
 
 
502 aa  108  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000265912 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0786  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  26.54 
 
 
537 aa  108  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.527095  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0473  nickel ABC transporter, solute-binding protein  24.4 
 
 
538 aa  108  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1113  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein, putative  25.17 
 
 
520 aa  107  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.322522  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  22.78 
 
 
512 aa  107  5e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3971  extracellular solute-binding protein family 5  24.01 
 
 
518 aa  107  5e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.34 
 
 
538 aa  107  6e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1605  extracellular solute-binding protein  26.84 
 
 
595 aa  107  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0888  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  22.56 
 
 
512 aa  107  7e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1000  glutathione-binding protein GsiB  22.78 
 
 
512 aa  107  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0753  extracellular solute-binding protein  24.89 
 
 
490 aa  107  8e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139724  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0890  glutathione-binding protein GsiB  22.78 
 
 
512 aa  107  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362875  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0950  glutathione-binding protein GsiB  22.56 
 
 
512 aa  106  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  22.7 
 
 
565 aa  106  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0917  glutathione-binding protein GsiB  22.56 
 
 
512 aa  106  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0979  glutathione-binding protein GsiB  22.56 
 
 
512 aa  106  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>