More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1044 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1044  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 496 aa  976    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0364384  normal  0.362635 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1825  extracellular solute-binding protein family 5  64.05 
 
 		 502 aa  621  1e-176  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.778707  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1425  extracellular solute-binding protein family 5  62.8 
 
 		 503 aa  616  1e-175  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.4744  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2223  extracellular solute-binding protein family 5  63.71 
 
 		 502 aa  597  1e-169  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4927  extracellular solute-binding protein family 5  65.83 
 
 		 495 aa  581  1e-164  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0283576  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2741  extracellular solute-binding protein  62.96 
 
 		 502 aa  556  1e-157  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000265912 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1284  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  28.79 
 
 		 545 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000669385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0645  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  28.25 
 
 		 524 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0450  extracellular solute-binding protein family 5  28.12 
 
 		 519 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.15126 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0210  extracellular solute-binding protein  28.86 
 
 		 512 aa  152  8.999999999999999e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0873116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.7 
 
 		 520 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3678  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  29.26 
 
 		 525 aa  148  3e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0885273 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  32.69 
 
 		 532 aa  148  3e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04510  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.03 
 
 		 551 aa  145  2e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  27.78 
 
 		 516 aa  140  7e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2532  extracellular solute-binding protein  28.31 
 
 		 535 aa  138  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384928 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5037  extracellular solute-binding protein  28.71 
 
 		 534 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4089  normal  0.963466 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0015  extracellular solute-binding protein family 5  32.26 
 
 		 516 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.406265  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2017  extracellular solute-binding protein  29.5 
 
 		 523 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0245155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  27.29 
 
 		 505 aa  136  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2870  periplasmic dipeptide transport protein  27.45 
 
 		 509 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00619899  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5416  extracellular solute-binding protein  28 
 
 		 534 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.604179 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1571  4-phytase  29.7 
 
 		 510 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.624152  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  27.55 
 
 		 535 aa  134  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0015  extracellular solute-binding protein family 5  29.38 
 
 		 516 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3158  extracellular solute-binding protein  27.59 
 
 		 535 aa  133  6e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0453  4-phytase  27.04 
 
 		 526 aa  133  6.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132073  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  26.91 
 
 		 534 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0723  hypothetical protein  27.58 
 
 		 527 aa  131  3e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.703564  normal  0.46015 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3809  extracellular solute-binding protein family 5  31.91 
 
 		 521 aa  131  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.406271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0145  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.66 
 
 		 521 aa  131  4.0000000000000003e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0722  radical SAM domain-containing protein  26.93 
 
 		 522 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.597639 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0218  extracellular solute-binding protein  27.85 
 
 		 537 aa  128  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.219975  normal  0.837771 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1341  extracellular solute-binding protein  29.11 
 
 		 500 aa  127  7e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  29.45 
 
 		 510 aa  126  7e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1039  extracellular solute-binding protein family 5  31.87 
 
 		 503 aa  125  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.78614  normal  0.0480029 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  26.73 
 
 		 528 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3006  extracellular solute-binding protein  26.26 
 
 		 528 aa  125  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165169  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0028  extracellular solute-binding protein family 5  28.76 
 
 		 520 aa  125  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0183012 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.17 
 
 		 510 aa  125  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2405  extracellular solute-binding protein family 5  29.17 
 
 		 518 aa  124  6e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0360  extracellular solute-binding protein family 5  26.47 
 
 		 506 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1224  extracellular solute-binding protein family 5  27.23 
 
 		 544 aa  120  4.9999999999999996e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0137957 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3383  extracellular solute-binding protein family 5  27.27 
 
 		 533 aa  120  6e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0391  extracellular solute-binding protein  29.22 
 
 		 522 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5411  extracellular solute-binding protein family 5  27.93 
 
 		 506 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.253312  decreased coverage  0.00154474 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7272  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  29.51 
 
 		 528 aa  119  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3706  extracellular solute-binding protein family 5  27.89 
 
 		 533 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51940  extracellular solute-binding protein  29.09 
 
 		 510 aa  119  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000130332  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5344  extracellular solute-binding protein family 5  27.27 
 
 		 506 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.297716  normal  0.516905 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0221  extracellular solute-binding protein  24.81 
 
 		 470 aa  117  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0227  extracellular solute-binding protein  24.81 
 
 		 470 aa  117  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  29.56 
 
 		 523 aa  117  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  30.92 
 
 		 532 aa  118  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5398  extracellular solute-binding protein family 5  28.07 
 
 		 506 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3881  extracellular solute-binding protein  28.48 
 
 		 515 aa  116  8.999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.441306  normal  0.0413131 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0750  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  28.97 
 
 		 559 aa  116  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0146598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0370  extracellular solute-binding protein  26.36 
 
 		 497 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.735975  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4444  extracellular solute-binding protein  28.07 
 
 		 517 aa  114  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.300506  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  27.99 
 
 		 511 aa  113  7.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  28.16 
 
 		 512 aa  113  8.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2619  extracellular solute-binding protein family 5  28.28 
 
 		 512 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.181451  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1994  ABC transporter, substrate-binding protein  23.99 
 
 		 491 aa  112  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1097  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein, putative  26.47 
 
 		 518 aa  112  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  27.94 
 
 		 502 aa  112  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0044  extracellular solute-binding protein family 5  26.51 
 
 		 535 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5121  extracellular solute-binding protein family 5  29.68 
 
 		 522 aa  110  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0049  extracellular solute-binding protein family 5  26.51 
 
 		 535 aa  110  5e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.46848  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0888  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  25 
 
 		 512 aa  110  5e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0981  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  25 
 
 		 512 aa  110  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2518  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  25 
 
 		 512 aa  110  5e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  27.1 
 
 		 516 aa  110  6e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2814  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 512 aa  110  6e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.993061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3863  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  25.06 
 
 		 535 aa  110  6e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03395  dipeptide transporter  25.06 
 
 		 535 aa  110  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0168  4-phytase  25.06 
 
 		 535 aa  110  7.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0171  4-phytase  25.06 
 
 		 535 aa  110  7.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03346  hypothetical protein  25.06 
 
 		 535 aa  110  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  25 
 
 		 512 aa  110  7.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3744  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  25.06 
 
 		 535 aa  110  7.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4037  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  25.06 
 
 		 535 aa  110  7.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1324  extracellular solute-binding protein  24.71 
 
 		 512 aa  110  8.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.725738 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2812  extracellular solute-binding protein family 5  24.77 
 
 		 512 aa  109  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.431185  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4912  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  24.83 
 
 		 535 aa  109  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00814  hypothetical protein  24.77 
 
 		 512 aa  109  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.840204  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00797  predicted peptide transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  24.77 
 
 		 493 aa  108  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.719474  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3907  extracellular solute-binding protein family 5  26.58 
 
 		 535 aa  108  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5083  4-phytase  27.88 
 
 		 495 aa  108  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.116329 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0901  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  24.77 
 
 		 512 aa  108  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0658  extracellular solute-binding protein family 5  26.86 
 
 		 577 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1000  glutathione-binding protein GsiB  25.17 
 
 		 512 aa  108  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18790  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.81 
 
 		 540 aa  107  4e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00232176  normal  0.206883 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0950  glutathione-binding protein GsiB  25.17 
 
 		 512 aa  107  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1219  extracellular solute-binding protein  28.14 
 
 		 531 aa  107  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0111682 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0917  glutathione-binding protein GsiB  25.17 
 
 		 512 aa  107  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0114  extracellular solute-binding protein  26.24 
 
 		 530 aa  107  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0979  glutathione-binding protein GsiB  25.17 
 
 		 512 aa  107  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0890  glutathione-binding protein GsiB  25.17 
 
 		 512 aa  107  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362875  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2006  transport binding transmembrane protein  26.44 
 
 		 528 aa  107  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2056  periplasmic dipeptide transport protein precursor  27.37 
 
 		 532 aa  107  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.184376  normal  0.721299 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>