More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0400 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1411  extracellular solute-binding protein family 5  58.91 
 
 		 537 aa  652    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5254  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  58.75 
 
 		 537 aa  641    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.534405  normal  0.0632497 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0400  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 525 aa  1082    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5253  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  61.57 
 
 		 537 aa  646    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0401744 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2210  extracellular solute-binding protein  90.74 
 
 		 530 aa  974    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.046819 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1226  extracellular solute-binding protein  59.84 
 
 		 536 aa  631  1e-180  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.560776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4022  extracellular solute-binding protein  59.64 
 
 		 536 aa  633  1e-180  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00714098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1200  extracellular solute-binding protein  58.53 
 
 		 535 aa  619  1e-176  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5251  putative ABC transporter substrate-binding protein  56.69 
 
 		 517 aa  580  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2002  extracellular solute-binding protein  48.46 
 
 		 527 aa  491  9.999999999999999e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.956925 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0979  extracellular solute-binding protein  48.6 
 
 		 530 aa  483  1e-135  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.297745  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1835  extracellular solute-binding protein family 5  47.69 
 
 		 544 aa  479  1e-134  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.274279  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3800  extracellular solute-binding protein  45.27 
 
 		 530 aa  468  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.129084 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1971  extracellular solute-binding protein  45.88 
 
 		 529 aa  463  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.19178  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1556  extracellular solute-binding protein family 5  45.82 
 
 		 525 aa  430  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.251844  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5088  putative oligopeptide/dipeptide ABC transporter  44.32 
 
 		 527 aa  429  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0437131  normal  0.457948 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1499  extracellular solute-binding protein  43.47 
 
 		 524 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.779721  normal  0.296474 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5818  extracellular solute-binding protein  44.6 
 
 		 531 aa  412  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0665054  normal  0.029553 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5122  putative ABC transporter periplasmic-binding protein  44.2 
 
 		 534 aa  413  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.259122 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5806  extracellular solute-binding protein  42.57 
 
 		 530 aa  402  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.068843  normal  0.564208 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1867  extracellular solute-binding protein  42.63 
 
 		 527 aa  402  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.546614  normal  0.0646948 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4745  extracellular solute-binding protein  42.86 
 
 		 533 aa  402  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3927  extracellular solute-binding protein  41.1 
 
 		 533 aa  396  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.180708  normal  0.0370442 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4251  extracellular solute-binding protein  43.51 
 
 		 523 aa  389  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.497786  normal  0.0434638 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3643  twin-arginine translocation pathway signal  40.49 
 
 		 533 aa  391  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.166369  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4366  extracellular solute-binding protein  41.67 
 
 		 528 aa  384  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3055  extracellular solute-binding protein  41.3 
 
 		 530 aa  375  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.169958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3922  extracellular solute-binding protein  38.97 
 
 		 526 aa  372  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.824445  normal  0.0767976 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4438  extracellular solute-binding protein  41.62 
 
 		 523 aa  367  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5086  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  30.3 
 
 		 517 aa  211  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.243076  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2984  extracellular solute-binding protein  28.08 
 
 		 508 aa  191  4e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00198911  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6670  extracellular solute-binding protein family 5  28.9 
 
 		 508 aa  181  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.0000010094  normal  0.0327722 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5763  extracellular solute-binding protein family 5  28.32 
 
 		 508 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  unclonable  0.000000000235373  normal  0.926009 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0934  twin-arginine translocation pathway signal  27.98 
 
 		 537 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1214  extracellular solute-binding protein family 5  27.63 
 
 		 524 aa  164  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0656  twin-arginine translocation pathway signal  28.06 
 
 		 521 aa  161  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.435676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3323  extracellular solute-binding protein  26.9 
 
 		 527 aa  157  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.187539 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0985  extracellular solute-binding protein  29.96 
 
 		 511 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.252461  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4147  extracellular solute-binding protein  29.71 
 
 		 518 aa  152  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3892  ABC di/oligopeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  29.57 
 
 		 518 aa  151  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.206545  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  28.71 
 
 		 505 aa  134  5e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  27.08 
 
 		 516 aa  132  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1000  glutathione-binding protein GsiB  27.94 
 
 		 512 aa  131  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0979  glutathione-binding protein GsiB  27.71 
 
 		 512 aa  129  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0917  glutathione-binding protein GsiB  27.71 
 
 		 512 aa  129  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0950  glutathione-binding protein GsiB  27.71 
 
 		 512 aa  129  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7328  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  27.09 
 
 		 517 aa  129  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.399444  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1090  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.46 
 
 		 514 aa  128  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0890  glutathione-binding protein GsiB  27.48 
 
 		 512 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362875  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4109  extracellular solute-binding protein family 5  27.29 
 
 		 513 aa  126  9e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344383  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4398  extracellular solute-binding protein family 5  27.29 
 
 		 513 aa  125  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0482953  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  24.7 
 
 		 510 aa  125  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  27.67 
 
 		 519 aa  125  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  26.27 
 
 		 515 aa  124  4e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1658  extracellular solute-binding protein  27.89 
 
 		 516 aa  124  4e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.710594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2974  extracellular solute-binding protein family 5  26.74 
 
 		 514 aa  124  4e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3003  extracellular solute-binding protein family 5  28.13 
 
 		 516 aa  124  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  27.02 
 
 		 512 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1324  extracellular solute-binding protein  25.94 
 
 		 512 aa  122  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.725738 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0782  extracellular solute-binding protein  24.79 
 
 		 494 aa  122  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.319175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0888  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  26.23 
 
 		 512 aa  121  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1491  extracellular solute-binding protein family 5  26.81 
 
 		 514 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  25.17 
 
 		 512 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  27.11 
 
 		 522 aa  120  6e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0981  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  26.01 
 
 		 512 aa  120  7e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0901  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  26.01 
 
 		 512 aa  120  7e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2518  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  26.01 
 
 		 512 aa  120  7e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1380  substate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  25.25 
 
 		 517 aa  120  9e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.630202  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2812  extracellular solute-binding protein family 5  26.01 
 
 		 512 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.431185  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00814  hypothetical protein  26.01 
 
 		 512 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.840204  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3267  extracellular solute-binding protein family 5  24.42 
 
 		 534 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.485271  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3243  extracellular solute-binding protein  27.75 
 
 		 509 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.649697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  25.68 
 
 		 520 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0111  extracellular solute-binding protein family 5  26.33 
 
 		 517 aa  119  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1253  extracellular solute-binding protein family 5  24.85 
 
 		 517 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.245274  normal  0.49371 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1319  extracellular solute-binding protein family 5  24.85 
 
 		 521 aa  118  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0396363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  28.27 
 
 		 495 aa  118  3e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6643  extracellular solute-binding protein family 5  28.34 
 
 		 514 aa  118  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.19211 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2814  extracellular solute-binding protein  26.01 
 
 		 512 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.993061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2701  extracellular solute-binding protein  24.11 
 
 		 534 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3028  twin-arginine translocation pathway signal  28.33 
 
 		 562 aa  117  5e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000374916  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1797  extracellular solute-binding protein family 5  26.24 
 
 		 551 aa  117  5e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.645119  normal  0.0256709 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  29.66 
 
 		 535 aa  117  6e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16230  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  23.36 
 
 		 516 aa  116  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.884302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4052  extracellular solute-binding protein  26.45 
 
 		 520 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3982  extracellular solute-binding protein  25.96 
 
 		 503 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4859  putative ABC transporter, substrate-binding protein  28.51 
 
 		 532 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3248  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  25.96 
 
 		 503 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336639  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1867  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC periplasmic ligand-binding protein  27.11 
 
 		 520 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.30378  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4615  4-phytase  27.09 
 
 		 502 aa  114  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3571  extracellular solute-binding protein  26.45 
 
 		 520 aa  115  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57508  normal  0.258108 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1313  extracellular solute-binding protein  30.14 
 
 		 493 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7212  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  29.12 
 
 		 531 aa  114  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  24.81 
 
 		 509 aa  114  6e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  28.37 
 
 		 528 aa  114  6e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1926  extracellular solute-binding protein  26.42 
 
 		 518 aa  113  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.293523  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4203  extracellular solute-binding protein  25.16 
 
 		 520 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237738  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4163  extracellular solute-binding protein  25.16 
 
 		 520 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0633493  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4591  extracellular solute-binding protein  26.48 
 
 		 517 aa  113  8.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0777489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0074  twin-arginine translocation pathway signal  25.1 
 
 		 514 aa  113  9e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0403886  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>