More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6643 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012858  Rleg_6643  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
514 aa  1061    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.19211 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2436  extracellular solute-binding protein  86.83 
 
 
514 aa  916    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1443  extracellular solute-binding protein  50 
 
 
517 aa  516  1.0000000000000001e-145  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.13157 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4726  extracellular solute-binding protein  47.67 
 
 
529 aa  506  9.999999999999999e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5947  extracellular solute-binding protein family 5  48.26 
 
 
521 aa  498  1e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.281116  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2984  extracellular solute-binding protein  31.23 
 
 
508 aa  191  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00198911  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  29.71 
 
 
510 aa  182  1e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6670  extracellular solute-binding protein family 5  30.16 
 
 
508 aa  174  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.0000010094  normal  0.0327722 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5763  extracellular solute-binding protein family 5  29.76 
 
 
508 aa  170  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  unclonable  0.000000000235373  normal  0.926009 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4147  extracellular solute-binding protein  28.31 
 
 
518 aa  164  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3892  ABC di/oligopeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  28.31 
 
 
518 aa  164  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.206545  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0563  extracellular solute-binding protein  27.22 
 
 
536 aa  159  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0406443  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1313  extracellular solute-binding protein  28.11 
 
 
493 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  28.03 
 
 
515 aa  156  7e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1288  extracellular solute-binding protein  29.45 
 
 
492 aa  156  7e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213997  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1012  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.25 
 
 
492 aa  155  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622148  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5086  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  28.6 
 
 
517 aa  155  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.243076  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  27.55 
 
 
510 aa  155  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4615  4-phytase  28.35 
 
 
502 aa  154  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0077  extracellular solute-binding protein family 5  31.1 
 
 
501 aa  153  5.9999999999999996e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0954  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.63 
 
 
479 aa  152  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5235  extracellular solute-binding protein family 5  28.63 
 
 
522 aa  152  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0426  extracellular solute-binding protein  28.63 
 
 
522 aa  152  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.133353  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  27.45 
 
 
512 aa  151  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  27.45 
 
 
512 aa  151  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  27.45 
 
 
512 aa  151  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  28.25 
 
 
505 aa  150  4e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  27.49 
 
 
505 aa  150  5e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5641  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  27.31 
 
 
508 aa  150  6e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  28.19 
 
 
520 aa  150  7e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4491  extracellular solute-binding protein family 5  26.5 
 
 
509 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  27.22 
 
 
546 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6191  extracellular solute-binding protein family 5  28.4 
 
 
504 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172417  normal  0.779113 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3982  extracellular solute-binding protein  27.7 
 
 
503 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2798  extracellular solute-binding protein family 5  26.75 
 
 
557 aa  147  6e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3248  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  27.7 
 
 
503 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336639  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4201  extracellular solute-binding protein family 5  26.91 
 
 
508 aa  146  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  28.03 
 
 
502 aa  145  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5067  extracellular solute-binding protein  25.35 
 
 
495 aa  144  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.68424  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2795  extracellular solute-binding protein family 5  28.54 
 
 
499 aa  143  7e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.730452 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  27.17 
 
 
523 aa  142  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  27.6 
 
 
516 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3174  dipeptide ABC transporter substrate-binding protein  31.87 
 
 
523 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0810  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 
489 aa  141  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6371  extracellular solute-binding protein family 5  27.46 
 
 
504 aa  141  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1214  extracellular solute-binding protein family 5  27.48 
 
 
524 aa  140  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0803  extracellular solute-binding protein  27.49 
 
 
529 aa  140  7e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000165149  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1507  extracellular solute-binding protein family 5  27.72 
 
 
516 aa  139  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.221484  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1000  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.57 
 
 
529 aa  138  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0858  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  26.46 
 
 
528 aa  138  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000478589  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  26.21 
 
 
512 aa  139  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0807  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.41 
 
 
528 aa  138  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000107652  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0908  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  26.46 
 
 
528 aa  138  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000813115  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0996  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.41 
 
 
528 aa  139  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.41324e-61 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  31 
 
 
532 aa  137  5e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4534  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  27.67 
 
 
504 aa  137  5e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5070  extracellular solute-binding protein  25.05 
 
 
495 aa  137  7.000000000000001e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.27843  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  27.14 
 
 
532 aa  136  9e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2375  twin-arginine translocation pathway signal  27.42 
 
 
514 aa  136  9e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0161  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.52 
 
 
529 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.485134  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0671  extracellular solute-binding protein  27.93 
 
 
534 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  28.14 
 
 
520 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0985  extracellular solute-binding protein  26.91 
 
 
511 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.252461  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1556  extracellular solute-binding protein family 5  26.82 
 
 
525 aa  134  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.251844  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4831  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  27.16 
 
 
527 aa  134  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.153883  normal  0.947205 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1797  extracellular solute-binding protein family 5  25.05 
 
 
551 aa  133  6e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.645119  normal  0.0256709 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  27.2 
 
 
528 aa  134  6e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1658  extracellular solute-binding protein  30.17 
 
 
516 aa  133  6e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.710594  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4211  extracellular solute-binding protein  27.67 
 
 
504 aa  133  7.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0744589  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3842  extracellular solute-binding protein  26.62 
 
 
568 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0450891  normal  0.108057 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  26.42 
 
 
519 aa  132  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0822  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.76 
 
 
528 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0945  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.76 
 
 
528 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00751792  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7558  putative dipeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  26.34 
 
 
515 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0782  extracellular solute-binding protein  23.59 
 
 
494 aa  132  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.319175  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  26.8 
 
 
544 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2769  extracellular solute-binding protein  26.77 
 
 
507 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12042  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4386  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.76 
 
 
529 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.775513  hitchhiker  3.14637e-22 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5289  ABC transporter  28.57 
 
 
517 aa  132  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0912186  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1090  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.68 
 
 
514 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  26.06 
 
 
541 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0212  extracellular solute-binding protein  29.57 
 
 
538 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0260102  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1189  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 
525 aa  132  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0440454  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1506  extracellular solute-binding protein  25.54 
 
 
501 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0306373  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1253  extracellular solute-binding protein family 5  27.41 
 
 
517 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.245274  normal  0.49371 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  26.36 
 
 
510 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3852  extracellular solute-binding protein  27.17 
 
 
521 aa  131  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0773863  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1380  substate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  26.91 
 
 
517 aa  131  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.630202  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  25.65 
 
 
521 aa  131  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1319  extracellular solute-binding protein family 5  27.41 
 
 
521 aa  131  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0396363  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3842  extracellular solute-binding protein family 5  25.51 
 
 
535 aa  131  3e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.298652  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3275  hypothetical protein  29.2 
 
 
540 aa  131  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.349389  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0067  extracellular solute-binding protein family 5  24.69 
 
 
532 aa  131  3e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  30.85 
 
 
534 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3255  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  29.2 
 
 
540 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.433609  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7212  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  25.89 
 
 
531 aa  131  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  24.25 
 
 
522 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  27.23 
 
 
512 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  26.55 
 
 
528 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  26.1 
 
 
544 aa  131  4.0000000000000003e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>