More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4726 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012792  Vapar_5947  extracellular solute-binding protein family 5  67.89 
 
 
521 aa  710    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.281116  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1443  extracellular solute-binding protein  76.69 
 
 
517 aa  816    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.13157 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4726  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
529 aa  1094    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6643  extracellular solute-binding protein family 5  47.67 
 
 
514 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.19211 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2436  extracellular solute-binding protein  47.15 
 
 
514 aa  484  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  29.17 
 
 
510 aa  168  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0563  extracellular solute-binding protein  25.63 
 
 
536 aa  160  5e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0406443  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  28.73 
 
 
510 aa  160  5e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.03 
 
 
538 aa  159  9e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3892  ABC di/oligopeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  28.19 
 
 
518 aa  159  9e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.206545  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4147  extracellular solute-binding protein  28.19 
 
 
518 aa  159  9e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  26.26 
 
 
538 aa  158  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  26.45 
 
 
534 aa  157  4e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  29.13 
 
 
515 aa  157  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3221  extracellular solute-binding protein  26.7 
 
 
517 aa  156  9e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102229  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4615  4-phytase  27.93 
 
 
502 aa  155  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  26.88 
 
 
524 aa  155  1e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  25.42 
 
 
546 aa  155  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  27.14 
 
 
534 aa  153  8e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  25.55 
 
 
540 aa  150  6e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2571  extracellular solute-binding protein family 5  26.34 
 
 
529 aa  150  6e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13754  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  27.57 
 
 
505 aa  149  9e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3174  dipeptide ABC transporter substrate-binding protein  27.57 
 
 
523 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  27.16 
 
 
505 aa  149  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1090  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.8 
 
 
514 aa  149  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1565  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  26.96 
 
 
534 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  25.29 
 
 
533 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2585  putative ABC transporter, substrate binding subunit  28.06 
 
 
520 aa  146  8.000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0598963 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  25.2 
 
 
535 aa  145  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5641  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  27.06 
 
 
508 aa  145  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0114  extracellular solute-binding protein  26.04 
 
 
530 aa  145  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3133  twin-arginine translocation pathway signal  26.1 
 
 
529 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 
539 aa  145  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6670  extracellular solute-binding protein family 5  28.75 
 
 
508 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.0000010094  normal  0.0327722 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3982  extracellular solute-binding protein  25.15 
 
 
503 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  25.41 
 
 
532 aa  144  4e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5763  extracellular solute-binding protein family 5  28.54 
 
 
508 aa  144  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  unclonable  0.000000000235373  normal  0.926009 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3248  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  25.35 
 
 
503 aa  144  4e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336639  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  26.32 
 
 
512 aa  144  6e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  27.59 
 
 
512 aa  144  6e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  27.59 
 
 
512 aa  144  6e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  27.59 
 
 
512 aa  144  6e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  26.27 
 
 
541 aa  143  9e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0140  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.18 
 
 
534 aa  143  9e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259377  normal  0.633025 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6371  extracellular solute-binding protein family 5  26.84 
 
 
504 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0139  extracellular solute-binding protein  28.85 
 
 
502 aa  141  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.184027  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  24.95 
 
 
524 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2984  extracellular solute-binding protein  27.67 
 
 
508 aa  140  6e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00198911  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5086  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  26.73 
 
 
517 aa  140  7e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.243076  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6191  extracellular solute-binding protein family 5  27.05 
 
 
504 aa  140  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172417  normal  0.779113 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  25.45 
 
 
565 aa  139  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  27.41 
 
 
510 aa  138  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  27.19 
 
 
544 aa  137  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4211  extracellular solute-binding protein  24.9 
 
 
504 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0744589  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  25.85 
 
 
540 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1012  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.37 
 
 
492 aa  135  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622148  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0180  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.28 
 
 
529 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0954  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.37 
 
 
479 aa  135  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  25.74 
 
 
542 aa  135  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58420  putative binding protein component of ABC dipeptid  26.8 
 
 
533 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.851894  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1288  extracellular solute-binding protein  27.65 
 
 
492 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213997  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5138  putative periplasmic peptide-binding protein ABC transporter  25.52 
 
 
495 aa  134  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0462348 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  24.7 
 
 
532 aa  135  3e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0161  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.05 
 
 
529 aa  134  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.485134  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5235  extracellular solute-binding protein family 5  25.43 
 
 
522 aa  134  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0177  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.09 
 
 
529 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.584873  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0816  extracellular solute-binding protein family 5  29.37 
 
 
496 aa  134  5e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0887  extracellular solute-binding protein  29.37 
 
 
496 aa  134  5e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.545524  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  26.8 
 
 
502 aa  134  6e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0810  extracellular solute-binding protein  25.74 
 
 
489 aa  134  6e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3490  extracellular solute-binding protein  24.61 
 
 
529 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0985  extracellular solute-binding protein  27.48 
 
 
511 aa  133  7.999999999999999e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.252461  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  26.76 
 
 
544 aa  133  7.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  25.3 
 
 
528 aa  133  7.999999999999999e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3243  extracellular solute-binding protein  24.95 
 
 
509 aa  133  7.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.649697  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0979  glutathione-binding protein GsiB  27.41 
 
 
512 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0950  glutathione-binding protein GsiB  27.41 
 
 
512 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2913  extracellular solute-binding protein family 5  26.99 
 
 
533 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.037834  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0757  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  24.81 
 
 
538 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0917  glutathione-binding protein GsiB  27.41 
 
 
512 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  26.75 
 
 
523 aa  132  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5116  ABC transporter periplasmic binding protein  26.4 
 
 
531 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1000  glutathione-binding protein GsiB  27.41 
 
 
512 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  26.49 
 
 
544 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  28.13 
 
 
511 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0587  extracellular solute-binding protein family 5  24.52 
 
 
534 aa  132  2.0000000000000002e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1313  extracellular solute-binding protein  24.95 
 
 
493 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0890  glutathione-binding protein GsiB  27.41 
 
 
512 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362875  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0111  extracellular solute-binding protein family 5  24.04 
 
 
517 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0190  extracellular solute-binding protein  24.18 
 
 
533 aa  131  3e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  23.75 
 
 
551 aa  131  3e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4491  extracellular solute-binding protein family 5  26.6 
 
 
509 aa  131  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3619  extracellular solute-binding protein  28.65 
 
 
495 aa  131  4.0000000000000003e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.43082  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4534  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  23.9 
 
 
504 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2375  twin-arginine translocation pathway signal  26.1 
 
 
514 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6472  putative oligopeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  28.8 
 
 
495 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.149439  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3852  extracellular solute-binding protein  26.9 
 
 
521 aa  130  5.0000000000000004e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0773863  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0753  extracellular solute-binding protein  26.22 
 
 
490 aa  130  6e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139724  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  26.64 
 
 
519 aa  130  6e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3888  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  24.8 
 
 
550 aa  130  7.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.799639  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>