More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6670 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5086  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  64.55 
 
 		 517 aa  665    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.243076  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6670  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 508 aa  1036    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.0000010094  normal  0.0327722 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5763  extracellular solute-binding protein family 5  96.06 
 
 		 508 aa  990    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  unclonable  0.000000000235373  normal  0.926009 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2984  extracellular solute-binding protein  82.48 
 
 		 508 aa  880    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00198911  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1214  extracellular solute-binding protein family 5  52.25 
 
 		 524 aa  518  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3323  extracellular solute-binding protein  50.39 
 
 		 527 aa  513  1e-144  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.187539 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0934  twin-arginine translocation pathway signal  47.8 
 
 		 537 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0656  twin-arginine translocation pathway signal  48.41 
 
 		 521 aa  492  9.999999999999999e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.435676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4147  extracellular solute-binding protein  34.94 
 
 		 518 aa  254  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3892  ABC di/oligopeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  34.94 
 
 		 518 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.206545  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1090  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  31.31 
 
 		 514 aa  224  2e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0985  extracellular solute-binding protein  30.8 
 
 		 511 aa  207  3e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.252461  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0400  extracellular solute-binding protein family 5  28.9 
 
 		 525 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2210  extracellular solute-binding protein  28.78 
 
 		 530 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.046819 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0979  extracellular solute-binding protein  28.51 
 
 		 530 aa  177  5e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.297745  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6643  extracellular solute-binding protein family 5  30.16 
 
 		 514 aa  177  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.19211 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2436  extracellular solute-binding protein  30.35 
 
 		 514 aa  176  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1835  extracellular solute-binding protein family 5  27.48 
 
 		 544 aa  175  9.999999999999999e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.274279  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1411  extracellular solute-binding protein family 5  27.58 
 
 		 537 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3800  extracellular solute-binding protein  26.89 
 
 		 530 aa  171  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.129084 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1226  extracellular solute-binding protein  28.31 
 
 		 536 aa  170  6e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.560776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5251  putative ABC transporter substrate-binding protein  28.48 
 
 		 517 aa  169  7e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5806  extracellular solute-binding protein  27.25 
 
 		 530 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.068843  normal  0.564208 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4022  extracellular solute-binding protein  28.31 
 
 		 536 aa  168  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00714098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5254  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  27.42 
 
 		 537 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.534405  normal  0.0632497 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1971  extracellular solute-binding protein  26.23 
 
 		 529 aa  167  4e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.19178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1200  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 535 aa  167  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2002  extracellular solute-binding protein  26.81 
 
 		 527 aa  164  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.956925 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5122  putative ABC transporter periplasmic-binding protein  29.18 
 
 		 534 aa  162  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.259122 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5253  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  26.14 
 
 		 537 aa  161  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0401744 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3927  extracellular solute-binding protein  26.78 
 
 		 533 aa  159  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.180708  normal  0.0370442 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5088  putative oligopeptide/dipeptide ABC transporter  27.75 
 
 		 527 aa  155  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0437131  normal  0.457948 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3643  twin-arginine translocation pathway signal  26.39 
 
 		 533 aa  155  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.166369  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1556  extracellular solute-binding protein family 5  28.03 
 
 		 525 aa  155  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.251844  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1867  extracellular solute-binding protein  25.77 
 
 		 527 aa  154  5e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.546614  normal  0.0646948 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1499  extracellular solute-binding protein  28.11 
 
 		 524 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.779721  normal  0.296474 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0139  extracellular solute-binding protein  29.03 
 
 		 520 aa  152  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.382397 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1443  extracellular solute-binding protein  27.94 
 
 		 517 aa  151  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.13157 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3103  extracellular solute-binding protein  29.59 
 
 		 519 aa  150  4e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4726  extracellular solute-binding protein  28.75 
 
 		 529 aa  149  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3003  extracellular solute-binding protein family 5  29.84 
 
 		 516 aa  149  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4438  extracellular solute-binding protein  27.35 
 
 		 523 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5818  extracellular solute-binding protein  25.35 
 
 		 531 aa  146  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0665054  normal  0.029553 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4251  extracellular solute-binding protein  26.6 
 
 		 523 aa  145  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.497786  normal  0.0434638 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5947  extracellular solute-binding protein family 5  28.39 
 
 		 521 aa  144  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.281116  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5235  extracellular solute-binding protein family 5  27.49 
 
 		 522 aa  144  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7328  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  30 
 
 		 517 aa  144  5e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.399444  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  29.06 
 
 		 505 aa  142  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4745  extracellular solute-binding protein  24.19 
 
 		 533 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4591  extracellular solute-binding protein  29.12 
 
 		 517 aa  139  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0777489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4366  extracellular solute-binding protein  27.67 
 
 		 528 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4426  extracellular solute-binding protein  27.92 
 
 		 520 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4203  extracellular solute-binding protein  28.35 
 
 		 520 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237738  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4163  extracellular solute-binding protein  28.35 
 
 		 520 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0633493  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3353  extracellular solute-binding protein  28.15 
 
 		 520 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.587262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1224  extracellular solute-binding protein family 5  29.5 
 
 		 544 aa  134  3.9999999999999996e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0137957 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1867  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC periplasmic ligand-binding protein  28.42 
 
 		 520 aa  133  6e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.30378  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  28.88 
 
 		 544 aa  133  9e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  25.98 
 
 		 502 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1651  extracellular solute-binding protein  28.51 
 
 		 516 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0426  extracellular solute-binding protein  26.9 
 
 		 522 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.133353  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1380  substate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  27.74 
 
 		 517 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.630202  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0263  extracellular solute-binding protein family 5  26.36 
 
 		 516 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0801202  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4052  extracellular solute-binding protein  27.84 
 
 		 520 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1113  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein, putative  29.34 
 
 		 520 aa  131  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.322522  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7558  putative dipeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  26.57 
 
 		 515 aa  131  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1253  extracellular solute-binding protein family 5  27.31 
 
 		 517 aa  131  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.245274  normal  0.49371 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3922  extracellular solute-binding protein  26.18 
 
 		 526 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.824445  normal  0.0767976 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4225  extracellular solute-binding protein  28.63 
 
 		 520 aa  130  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1658  extracellular solute-binding protein  33.67 
 
 		 516 aa  130  7.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.710594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0238  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  28.99 
 
 		 520 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0975  putative dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  28.99 
 
 		 520 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.124849  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0324  putative ABC transporter substrate-binding protein  28.99 
 
 		 520 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1359  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  28.99 
 
 		 520 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.442837  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1853  putative binding protein YliB  28.99 
 
 		 520 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1768  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  28.99 
 
 		 520 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.852283  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3571  extracellular solute-binding protein  27.63 
 
 		 520 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57508  normal  0.258108 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0402  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  28.99 
 
 		 520 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1507  extracellular solute-binding protein family 5  28.07 
 
 		 516 aa  127  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.221484  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3055  extracellular solute-binding protein  26.33 
 
 		 530 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.169958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1319  extracellular solute-binding protein family 5  27.1 
 
 		 521 aa  127  7e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0396363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1926  extracellular solute-binding protein  29.15 
 
 		 518 aa  126  9e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.293523  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  27.02 
 
 		 520 aa  125  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0836  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  27.24 
 
 		 520 aa  125  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.385717  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.08 
 
 		 538 aa  124  4e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3490  extracellular solute-binding protein  27.77 
 
 		 529 aa  124  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1313  extracellular solute-binding protein  27.6 
 
 		 493 aa  123  8e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3130  extracellular solute-binding protein family 5  26.84 
 
 		 520 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.777715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  25.77 
 
 		 509 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  29.67 
 
 		 520 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  26.1 
 
 		 531 aa  120  7e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  24.69 
 
 		 495 aa  120  7.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  24.05 
 
 		 521 aa  120  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0671  extracellular solute-binding protein  27.43 
 
 		 534 aa  119  9e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  24.05 
 
 		 521 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.05 
 
 		 521 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  24.05 
 
 		 521 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  24.05 
 
 		 521 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1408  extracellular solute-binding protein  28.22 
 
 		 518 aa  119  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00741999  normal  0.0556416 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00814  hypothetical protein  27.8 
 
 		 512 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.840204  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>