More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5254 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5253  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  93.06 
 
 		 537 aa  1016    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0401744 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1411  extracellular solute-binding protein family 5  78.88 
 
 		 537 aa  882    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5251  putative ABC transporter substrate-binding protein  78.49 
 
 		 517 aa  823    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0400  extracellular solute-binding protein family 5  58.75 
 
 		 525 aa  641    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1226  extracellular solute-binding protein  81.94 
 
 		 536 aa  860    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.560776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1200  extracellular solute-binding protein  77.39 
 
 		 535 aa  847    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2210  extracellular solute-binding protein  60 
 
 		 530 aa  636    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.046819 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4022  extracellular solute-binding protein  79.14 
 
 		 536 aa  869    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00714098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5254  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  100 
 
 		 537 aa  1103    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.534405  normal  0.0632497 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3800  extracellular solute-binding protein  48.49 
 
 		 530 aa  545  1e-154  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.129084 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2002  extracellular solute-binding protein  50.48 
 
 		 527 aa  533  1e-150  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.956925 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0979  extracellular solute-binding protein  43.8 
 
 		 530 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.297745  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1835  extracellular solute-binding protein family 5  42.77 
 
 		 544 aa  434  1e-120  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.274279  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1499  extracellular solute-binding protein  44.03 
 
 		 524 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.779721  normal  0.296474 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5818  extracellular solute-binding protein  43.49 
 
 		 531 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0665054  normal  0.029553 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3927  extracellular solute-binding protein  42.77 
 
 		 533 aa  402  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.180708  normal  0.0370442 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5122  putative ABC transporter periplasmic-binding protein  43.94 
 
 		 534 aa  398  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.259122 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1556  extracellular solute-binding protein family 5  41.83 
 
 		 525 aa  390  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.251844  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1971  extracellular solute-binding protein  39.92 
 
 		 529 aa  389  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.19178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4745  extracellular solute-binding protein  39 
 
 		 533 aa  385  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5806  extracellular solute-binding protein  41.19 
 
 		 530 aa  382  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.068843  normal  0.564208 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4366  extracellular solute-binding protein  42.25 
 
 		 528 aa  384  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4251  extracellular solute-binding protein  42.69 
 
 		 523 aa  381  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.497786  normal  0.0434638 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5088  putative oligopeptide/dipeptide ABC transporter  40.34 
 
 		 527 aa  376  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0437131  normal  0.457948 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4438  extracellular solute-binding protein  39.61 
 
 		 523 aa  367  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3643  twin-arginine translocation pathway signal  39.2 
 
 		 533 aa  366  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.166369  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1867  extracellular solute-binding protein  39.17 
 
 		 527 aa  363  3e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.546614  normal  0.0646948 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3055  extracellular solute-binding protein  39.45 
 
 		 530 aa  361  1e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.169958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3922  extracellular solute-binding protein  36.83 
 
 		 526 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.824445  normal  0.0767976 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5086  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  29.12 
 
 		 517 aa  181  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.243076  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1214  extracellular solute-binding protein family 5  28.97 
 
 		 524 aa  177  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2984  extracellular solute-binding protein  27.01 
 
 		 508 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00198911  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0656  twin-arginine translocation pathway signal  28.6 
 
 		 521 aa  174  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.435676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0934  twin-arginine translocation pathway signal  27.1 
 
 		 537 aa  174  5e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3323  extracellular solute-binding protein  27.61 
 
 		 527 aa  169  9e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.187539 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0985  extracellular solute-binding protein  30.56 
 
 		 511 aa  164  3e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.252461  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6670  extracellular solute-binding protein family 5  27.42 
 
 		 508 aa  163  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.0000010094  normal  0.0327722 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5763  extracellular solute-binding protein family 5  26.8 
 
 		 508 aa  158  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  unclonable  0.000000000235373  normal  0.926009 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1090  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27 
 
 		 514 aa  147  3e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  24.85 
 
 		 512 aa  133  6.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3892  ABC di/oligopeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  27.36 
 
 		 518 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.206545  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4147  extracellular solute-binding protein  27.36 
 
 		 518 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  27.95 
 
 		 510 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  25.58 
 
 		 510 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  27.34 
 
 		 516 aa  127  6e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  28.53 
 
 		 505 aa  127  7e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  26.39 
 
 		 515 aa  124  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4491  extracellular solute-binding protein family 5  27.63 
 
 		 509 aa  124  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4201  extracellular solute-binding protein family 5  30.47 
 
 		 508 aa  124  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  28.17 
 
 		 523 aa  122  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3016  extracellular solute-binding protein family 5  26.04 
 
 		 545 aa  123  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0244604  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5138  putative periplasmic peptide-binding protein ABC transporter  31.66 
 
 		 495 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0462348 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5641  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  29.52 
 
 		 508 aa  122  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2795  extracellular solute-binding protein family 5  29.66 
 
 		 499 aa  122  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.730452 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.37 
 
 		 510 aa  120  6e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2226  extracellular solute-binding protein family 5  28.41 
 
 		 507 aa  120  6e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0969064 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3248  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  25.65 
 
 		 503 aa  120  7e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336639  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3982  extracellular solute-binding protein  25.65 
 
 		 503 aa  120  7e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2436  extracellular solute-binding protein  27.88 
 
 		 514 aa  120  7.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0890  glutathione-binding protein GsiB  26.05 
 
 		 512 aa  120  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362875  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1000  glutathione-binding protein GsiB  26.2 
 
 		 512 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0917  glutathione-binding protein GsiB  26.05 
 
 		 512 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1324  extracellular solute-binding protein  27.02 
 
 		 512 aa  118  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.725738 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0979  glutathione-binding protein GsiB  26.05 
 
 		 512 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2000  extracellular solute-binding protein  26.9 
 
 		 550 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0950  glutathione-binding protein GsiB  26.05 
 
 		 512 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0563  extracellular solute-binding protein  25.69 
 
 		 536 aa  117  6.9999999999999995e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0406443  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  31.16 
 
 		 511 aa  117  6.9999999999999995e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1551  extracellular solute-binding protein  29.16 
 
 		 512 aa  116  7.999999999999999e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0888  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  25.68 
 
 		 512 aa  116  8.999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6643  extracellular solute-binding protein family 5  27.35 
 
 		 514 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.19211 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1380  substate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  28.44 
 
 		 517 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.630202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 		 522 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  24.54 
 
 		 495 aa  115  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  26.56 
 
 		 519 aa  115  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3243  extracellular solute-binding protein  28.13 
 
 		 509 aa  114  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.649697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1443  extracellular solute-binding protein  24.81 
 
 		 517 aa  114  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.13157 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7328  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  27.48 
 
 		 517 aa  114  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.399444  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2961  extracellular solute-binding protein  25.05 
 
 		 541 aa  115  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3028  twin-arginine translocation pathway signal  29.71 
 
 		 562 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000374916  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2814  extracellular solute-binding protein  25.48 
 
 		 512 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.993061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2913  extracellular solute-binding protein family 5  25.99 
 
 		 533 aa  114  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.037834  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2585  putative ABC transporter, substrate binding subunit  29.17 
 
 		 520 aa  113  9e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598963 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0981  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  25.29 
 
 		 512 aa  113  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2518  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  25.29 
 
 		 512 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0901  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  25.29 
 
 		 512 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  26.36 
 
 		 502 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1253  extracellular solute-binding protein family 5  28.2 
 
 		 517 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.245274  normal  0.49371 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6191  extracellular solute-binding protein family 5  25.48 
 
 		 504 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172417  normal  0.779113 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4285  extracellular solute-binding protein  27.79 
 
 		 530 aa  112  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.261799  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  25.48 
 
 		 512 aa  113  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1319  extracellular solute-binding protein family 5  28.2 
 
 		 521 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0396363  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2812  extracellular solute-binding protein family 5  25.29 
 
 		 512 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.431185  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00814  hypothetical protein  25.29 
 
 		 512 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.840204  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6371  extracellular solute-binding protein family 5  25.67 
 
 		 504 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1313  extracellular solute-binding protein  29.33 
 
 		 493 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  25.83 
 
 		 520 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2382  peptide ABC transporter  26.08 
 
 		 560 aa  111  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2974  extracellular solute-binding protein family 5  26.64 
 
 		 514 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  24.76 
 
 		 535 aa  110  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>