More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3323 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0934  twin-arginine translocation pathway signal  72.46 
 
 		 537 aa  790    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0656  twin-arginine translocation pathway signal  75.63 
 
 		 521 aa  796    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.435676  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1214  extracellular solute-binding protein family 5  91.97 
 
 		 524 aa  947    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3323  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 527 aa  1083    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.187539 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6670  extracellular solute-binding protein family 5  50.39 
 
 		 508 aa  513  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.0000010094  normal  0.0327722 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2984  extracellular solute-binding protein  49.8 
 
 		 508 aa  506  9.999999999999999e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00198911  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5763  extracellular solute-binding protein family 5  50 
 
 		 508 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  unclonable  0.000000000235373  normal  0.926009 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5086  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  48.05 
 
 		 517 aa  490  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.243076  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4147  extracellular solute-binding protein  31.98 
 
 		 518 aa  206  8e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3892  ABC di/oligopeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  31.98 
 
 		 518 aa  206  8e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.206545  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1090  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.87 
 
 		 514 aa  194  4e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0985  extracellular solute-binding protein  30.14 
 
 		 511 aa  191  4e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.252461  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2002  extracellular solute-binding protein  28.63 
 
 		 527 aa  191  4e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.956925 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3800  extracellular solute-binding protein  26.71 
 
 		 530 aa  187  5e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.129084 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5088  putative oligopeptide/dipeptide ABC transporter  30.4 
 
 		 527 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0437131  normal  0.457948 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1835  extracellular solute-binding protein family 5  27.72 
 
 		 544 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.274279  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1411  extracellular solute-binding protein family 5  28.54 
 
 		 537 aa  179  9e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5254  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  27.61 
 
 		 537 aa  179  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.534405  normal  0.0632497 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1556  extracellular solute-binding protein family 5  28.83 
 
 		 525 aa  179  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.251844  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5253  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  28.28 
 
 		 537 aa  179  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0401744 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0979  extracellular solute-binding protein  28.43 
 
 		 530 aa  176  7e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.297745  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1226  extracellular solute-binding protein  29.72 
 
 		 536 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.560776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1867  extracellular solute-binding protein  27.29 
 
 		 527 aa  175  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.546614  normal  0.0646948 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3643  twin-arginine translocation pathway signal  27.63 
 
 		 533 aa  173  6.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.166369  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5251  putative ABC transporter substrate-binding protein  28.48 
 
 		 517 aa  172  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4022  extracellular solute-binding protein  28.51 
 
 		 536 aa  170  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00714098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0400  extracellular solute-binding protein family 5  26.9 
 
 		 525 aa  168  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1200  extracellular solute-binding protein  28.54 
 
 		 535 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1971  extracellular solute-binding protein  26.86 
 
 		 529 aa  163  8.000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.19178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3927  extracellular solute-binding protein  28.06 
 
 		 533 aa  162  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.180708  normal  0.0370442 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2210  extracellular solute-binding protein  26.6 
 
 		 530 aa  161  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.046819 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1499  extracellular solute-binding protein  25.84 
 
 		 524 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.779721  normal  0.296474 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4366  extracellular solute-binding protein  26.7 
 
 		 528 aa  148  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5806  extracellular solute-binding protein  25.81 
 
 		 530 aa  147  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.068843  normal  0.564208 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5122  putative ABC transporter periplasmic-binding protein  26.6 
 
 		 534 aa  146  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.259122 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5818  extracellular solute-binding protein  26.23 
 
 		 531 aa  145  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0665054  normal  0.029553 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  27.51 
 
 		 512 aa  143  7e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  27.51 
 
 		 512 aa  143  7e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  27.51 
 
 		 512 aa  143  7e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5947  extracellular solute-binding protein family 5  27.58 
 
 		 521 aa  141  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.281116  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4251  extracellular solute-binding protein  28.4 
 
 		 523 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.497786  normal  0.0434638 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  29.26 
 
 		 505 aa  140  6e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2436  extracellular solute-binding protein  26.39 
 
 		 514 aa  139  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1443  extracellular solute-binding protein  24.45 
 
 		 517 aa  139  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.13157 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6643  extracellular solute-binding protein family 5  25.85 
 
 		 514 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.19211 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4726  extracellular solute-binding protein  25.38 
 
 		 529 aa  137  5e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3922  extracellular solute-binding protein  27.23 
 
 		 526 aa  136  7.000000000000001e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.824445  normal  0.0767976 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  25.98 
 
 		 515 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4438  extracellular solute-binding protein  25.69 
 
 		 523 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0145  extracellular solute-binding protein family 5  26.1 
 
 		 552 aa  130  6e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.602191 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  26.64 
 
 		 520 aa  129  9.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3055  extracellular solute-binding protein  25.31 
 
 		 530 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.169958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  27.54 
 
 		 528 aa  127  6e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4745  extracellular solute-binding protein  24.67 
 
 		 533 aa  124  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  29.36 
 
 		 502 aa  123  6e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  26.51 
 
 		 509 aa  123  7e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0810  extracellular solute-binding protein  28.51 
 
 		 489 aa  122  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0782  extracellular solute-binding protein  27.08 
 
 		 494 aa  121  3.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.319175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4426  extracellular solute-binding protein  27.99 
 
 		 520 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5235  extracellular solute-binding protein family 5  27.04 
 
 		 522 aa  121  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  24.95 
 
 		 510 aa  120  7e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  25.59 
 
 		 510 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3103  extracellular solute-binding protein  26.43 
 
 		 519 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1313  extracellular solute-binding protein  28.08 
 
 		 493 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  28.39 
 
 		 534 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  25.32 
 
 		 495 aa  118  3e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0803  extracellular solute-binding protein  25.61 
 
 		 529 aa  117  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000165149  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0146  extracellular solute-binding protein family 5  26.39 
 
 		 513 aa  117  5e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.377896  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  23.95 
 
 		 516 aa  117  5e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  26.27 
 
 		 523 aa  117  6e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0263  extracellular solute-binding protein family 5  25.1 
 
 		 516 aa  117  6e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0801202  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1000  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.8 
 
 		 529 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0858  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  25.56 
 
 		 528 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000478589  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  25.38 
 
 		 532 aa  116  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0908  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  25.56 
 
 		 528 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000813115  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4225  extracellular solute-binding protein  26.86 
 
 		 520 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1224  extracellular solute-binding protein family 5  25.5 
 
 		 544 aa  116  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0137957 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  26.07 
 
 		 535 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0807  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.8 
 
 		 528 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000107652  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4386  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.35 
 
 		 529 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.775513  hitchhiker  3.14637e-22 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3971  extracellular solute-binding protein family 5  24.95 
 
 		 518 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0996  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.8 
 
 		 528 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.41324e-61 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0945  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.35 
 
 		 528 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00751792  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0426  extracellular solute-binding protein  26.35 
 
 		 522 aa  115  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.133353  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0822  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.15 
 
 		 528 aa  114  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0387  extracellular solute-binding protein family 5  27.6 
 
 		 503 aa  114  5e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000219856  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4109  extracellular solute-binding protein family 5  25.75 
 
 		 513 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344383  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3842  extracellular solute-binding protein  25.2 
 
 		 568 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0450891  normal  0.108057 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5357  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  26.24 
 
 		 502 aa  112  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0991682  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2885  extracellular solute-binding protein  25.33 
 
 		 528 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.128734  normal  0.843476 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4534  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  28.36 
 
 		 504 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0139  extracellular solute-binding protein  27.32 
 
 		 520 aa  111  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.382397 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0095  transport protein, extracellular solute-binding protein  25.5 
 
 		 517 aa  111  4.0000000000000004e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0865281  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1651  extracellular solute-binding protein  26.69 
 
 		 516 aa  110  5e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0836  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  24.76 
 
 		 520 aa  110  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.385717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1507  extracellular solute-binding protein family 5  24.89 
 
 		 516 aa  110  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.221484  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7194  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  27.42 
 
 		 528 aa  110  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169026  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2012  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  25.3 
 
 		 545 aa  110  7.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4398  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 		 513 aa  109  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0482953  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  25.26 
 
 		 511 aa  109  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.226847 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>