More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3055 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3055  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 530 aa  1061    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.169958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3922  extracellular solute-binding protein  77.46 
 
 		 526 aa  810    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.824445  normal  0.0767976 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5818  extracellular solute-binding protein  50.09 
 
 		 531 aa  511  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0665054  normal  0.029553 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4251  extracellular solute-binding protein  53.27 
 
 		 523 aa  512  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.497786  normal  0.0434638 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5806  extracellular solute-binding protein  52.27 
 
 		 530 aa  510  1e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.068843  normal  0.564208 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4745  extracellular solute-binding protein  47.86 
 
 		 533 aa  480  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4438  extracellular solute-binding protein  48.51 
 
 		 523 aa  437  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5122  putative ABC transporter periplasmic-binding protein  45.31 
 
 		 534 aa  429  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.259122 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1971  extracellular solute-binding protein  44.92 
 
 		 529 aa  422  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.19178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3927  extracellular solute-binding protein  43.36 
 
 		 533 aa  412  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.180708  normal  0.0370442 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4366  extracellular solute-binding protein  41.73 
 
 		 528 aa  396  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1411  extracellular solute-binding protein family 5  40.08 
 
 		 537 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0400  extracellular solute-binding protein family 5  40.38 
 
 		 525 aa  385  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2210  extracellular solute-binding protein  41.92 
 
 		 530 aa  379  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.046819 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5253  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  39.58 
 
 		 537 aa  378  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0401744 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5254  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  39.31 
 
 		 537 aa  377  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.534405  normal  0.0632497 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1226  extracellular solute-binding protein  40.43 
 
 		 536 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.560776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4022  extracellular solute-binding protein  39.92 
 
 		 536 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00714098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5251  putative ABC transporter substrate-binding protein  39.72 
 
 		 517 aa  368  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1200  extracellular solute-binding protein  40 
 
 		 535 aa  365  1e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1867  extracellular solute-binding protein  38.84 
 
 		 527 aa  347  3e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.546614  normal  0.0646948 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5088  putative oligopeptide/dipeptide ABC transporter  39.74 
 
 		 527 aa  338  9.999999999999999e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0437131  normal  0.457948 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1556  extracellular solute-binding protein family 5  40 
 
 		 525 aa  337  3.9999999999999995e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.251844  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3800  extracellular solute-binding protein  38.67 
 
 		 530 aa  337  3.9999999999999995e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.129084 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0979  extracellular solute-binding protein  38.15 
 
 		 530 aa  330  3e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.297745  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1499  extracellular solute-binding protein  37.1 
 
 		 524 aa  326  8.000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.779721  normal  0.296474 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2002  extracellular solute-binding protein  37.55 
 
 		 527 aa  317  4e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.956925 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1835  extracellular solute-binding protein family 5  36.04 
 
 		 544 aa  311  2.9999999999999997e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.274279  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3643  twin-arginine translocation pathway signal  36.07 
 
 		 533 aa  306  5.0000000000000004e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.166369  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3892  ABC di/oligopeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  30.48 
 
 		 518 aa  154  5e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.206545  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4147  extracellular solute-binding protein  30.18 
 
 		 518 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0985  extracellular solute-binding protein  29.05 
 
 		 511 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.252461  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1214  extracellular solute-binding protein family 5  26.87 
 
 		 524 aa  141  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0934  twin-arginine translocation pathway signal  24.41 
 
 		 537 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2984  extracellular solute-binding protein  25.15 
 
 		 508 aa  134  5e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00198911  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0656  twin-arginine translocation pathway signal  26.1 
 
 		 521 aa  132  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.435676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  29.14 
 
 		 505 aa  130  6e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3323  extracellular solute-binding protein  25.46 
 
 		 527 aa  129  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.187539 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6670  extracellular solute-binding protein family 5  26.33 
 
 		 508 aa  127  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.0000010094  normal  0.0327722 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5763  extracellular solute-binding protein family 5  26.12 
 
 		 508 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  unclonable  0.000000000235373  normal  0.926009 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5086  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  24.9 
 
 		 517 aa  125  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.243076  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1090  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.1 
 
 		 514 aa  116  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.53 
 
 		 510 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  27.69 
 
 		 510 aa  113  8.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  27.53 
 
 		 523 aa  112  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6643  extracellular solute-binding protein family 5  25.66 
 
 		 514 aa  109  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.19211 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3842  extracellular solute-binding protein  23.58 
 
 		 568 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0450891  normal  0.108057 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  27.68 
 
 		 535 aa  107  5e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  26.63 
 
 		 515 aa  106  9e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7212  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  27.59 
 
 		 531 aa  106  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  25.49 
 
 		 512 aa  104  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  25.49 
 
 		 512 aa  104  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  25.49 
 
 		 512 aa  104  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3635  extracellular solute-binding protein  24.89 
 
 		 515 aa  102  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.014259  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1271  ABC transporter, periplasmic binding protein  30.25 
 
 		 528 aa  103  1e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000259921  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2436  extracellular solute-binding protein  25.56 
 
 		 514 aa  102  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1651  extracellular solute-binding protein  26.86 
 
 		 516 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  27.66 
 
 		 516 aa  100  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1926  extracellular solute-binding protein  27 
 
 		 518 aa  100  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.293523  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2173  extracellular solute-binding protein family 5  27.43 
 
 		 544 aa  100  9e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3551  extracellular solute-binding protein family 5  24.79 
 
 		 531 aa  100  9e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.186732  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  28.22 
 
 		 542 aa  99.4  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3016  extracellular solute-binding protein family 5  25.43 
 
 		 545 aa  98.6  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0244604  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  28.09 
 
 		 534 aa  99  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2847  4-phytase  27.64 
 
 		 495 aa  97.8  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.640082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4052  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 520 aa  98.2  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2585  putative ABC transporter, substrate binding subunit  28.28 
 
 		 520 aa  97.8  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598963 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  26.04 
 
 		 512 aa  97.4  6e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3571  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 520 aa  97.1  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57508  normal  0.258108 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4426  extracellular solute-binding protein  24.17 
 
 		 520 aa  97.1  8e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2547  extracellular solute-binding protein  26.73 
 
 		 534 aa  96.3  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220611  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1599  extracellular solute-binding protein family 5  25.49 
 
 		 535 aa  96.7  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.525219 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7558  putative dipeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  25.2 
 
 		 515 aa  95.1  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4203  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 520 aa  95.5  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237738  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  23.97 
 
 		 522 aa  95.9  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4163  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 520 aa  95.5  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0633493  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3353  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 520 aa  95.1  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.587262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1253  extracellular solute-binding protein family 5  25.28 
 
 		 517 aa  94.4  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.245274  normal  0.49371 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  25.98 
 
 		 510 aa  93.6  7e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1551  extracellular solute-binding protein  24.45 
 
 		 512 aa  92.8  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5235  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 		 522 aa  93.2  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2974  extracellular solute-binding protein family 5  24.67 
 
 		 514 aa  93.2  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1380  substate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  24.66 
 
 		 517 aa  92.4  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.630202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5121  extracellular solute-binding protein family 5  30.63 
 
 		 522 aa  92.4  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3003  extracellular solute-binding protein family 5  24.54 
 
 		 516 aa  92.4  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2375  twin-arginine translocation pathway signal  24.95 
 
 		 514 aa  92  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4225  extracellular solute-binding protein  25.06 
 
 		 520 aa  92  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4615  4-phytase  27.14 
 
 		 502 aa  92  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1319  extracellular solute-binding protein family 5  25.4 
 
 		 521 aa  91.7  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0396363  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  24.69 
 
 		 502 aa  91.7  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0428  extracellular solute-binding protein family 5  26.86 
 
 		 537 aa  92  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6559  extracellular solute-binding protein family 5  28.57 
 
 		 536 aa  91.3  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67626  normal  0.403463 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3853  4-phytase  30.26 
 
 		 528 aa  91.3  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0387528  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0077  extracellular solute-binding protein family 5  26.72 
 
 		 501 aa  90.5  6e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4285  extracellular solute-binding protein  27.71 
 
 		 530 aa  90.5  7e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.261799  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1867  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC periplasmic ligand-binding protein  24.81 
 
 		 520 aa  90.1  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.30378  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0387  extracellular solute-binding protein family 5  24.64 
 
 		 503 aa  90.1  9e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000219856  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0140  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.7 
 
 		 534 aa  89.7  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259377  normal  0.633025 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2795  extracellular solute-binding protein family 5  26.17 
 
 		 499 aa  90.1  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.730452 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3167  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  24.68 
 
 		 542 aa  89  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>