More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5818 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_5818  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 531 aa  1073    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0665054  normal  0.029553 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4745  extracellular solute-binding protein  72.37 
 
 		 533 aa  798    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4251  extracellular solute-binding protein  55.64 
 
 		 523 aa  558  1e-158  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.497786  normal  0.0434638 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5806  extracellular solute-binding protein  51.99 
 
 		 530 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.068843  normal  0.564208 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3055  extracellular solute-binding protein  50.66 
 
 		 530 aa  500  1e-140  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.169958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4366  extracellular solute-binding protein  49.06 
 
 		 528 aa  490  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3922  extracellular solute-binding protein  49.62 
 
 		 526 aa  488  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.824445  normal  0.0767976 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3927  extracellular solute-binding protein  49.22 
 
 		 533 aa  484  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.180708  normal  0.0370442 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5122  putative ABC transporter periplasmic-binding protein  48.19 
 
 		 534 aa  481  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.259122 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4438  extracellular solute-binding protein  49.01 
 
 		 523 aa  462  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1971  extracellular solute-binding protein  43.91 
 
 		 529 aa  423  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.19178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0400  extracellular solute-binding protein family 5  44.53 
 
 		 525 aa  415  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2210  extracellular solute-binding protein  44.91 
 
 		 530 aa  411  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.046819 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5254  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  42.23 
 
 		 537 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.534405  normal  0.0632497 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1411  extracellular solute-binding protein family 5  42.74 
 
 		 537 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5251  putative ABC transporter substrate-binding protein  43.46 
 
 		 517 aa  404  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5253  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  42.18 
 
 		 537 aa  402  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0401744 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1226  extracellular solute-binding protein  43.17 
 
 		 536 aa  402  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.560776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4022  extracellular solute-binding protein  42.74 
 
 		 536 aa  398  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00714098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1200  extracellular solute-binding protein  42.6 
 
 		 535 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2002  extracellular solute-binding protein  38.56 
 
 		 527 aa  355  7.999999999999999e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.956925 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3800  extracellular solute-binding protein  39.05 
 
 		 530 aa  351  2e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.129084 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1835  extracellular solute-binding protein family 5  38 
 
 		 544 aa  348  2e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.274279  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1867  extracellular solute-binding protein  40.16 
 
 		 527 aa  347  3e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.546614  normal  0.0646948 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1556  extracellular solute-binding protein family 5  40.32 
 
 		 525 aa  346  5e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.251844  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3643  twin-arginine translocation pathway signal  38.61 
 
 		 533 aa  343  5e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.166369  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5088  putative oligopeptide/dipeptide ABC transporter  40.08 
 
 		 527 aa  340  4e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0437131  normal  0.457948 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0979  extracellular solute-binding protein  38.6 
 
 		 530 aa  336  5e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.297745  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1499  extracellular solute-binding protein  37.08 
 
 		 524 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.779721  normal  0.296474 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0985  extracellular solute-binding protein  28.97 
 
 		 511 aa  163  6e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.252461  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2984  extracellular solute-binding protein  25.9 
 
 		 508 aa  153  7e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00198911  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1214  extracellular solute-binding protein family 5  27.27 
 
 		 524 aa  148  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1090  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26 
 
 		 514 aa  146  8.000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3323  extracellular solute-binding protein  26.23 
 
 		 527 aa  146  9e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.187539 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5763  extracellular solute-binding protein family 5  25.94 
 
 		 508 aa  145  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  unclonable  0.000000000235373  normal  0.926009 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6670  extracellular solute-binding protein family 5  25.75 
 
 		 508 aa  145  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.0000010094  normal  0.0327722 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5086  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  26.54 
 
 		 517 aa  143  8e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.243076  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3892  ABC di/oligopeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  27.46 
 
 		 518 aa  143  8e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.206545  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4147  extracellular solute-binding protein  27.46 
 
 		 518 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0934  twin-arginine translocation pathway signal  26.21 
 
 		 537 aa  140  6e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  27.94 
 
 		 512 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0656  twin-arginine translocation pathway signal  26.62 
 
 		 521 aa  129  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.435676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  26.77 
 
 		 505 aa  129  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  27.8 
 
 		 523 aa  124  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.2 
 
 		 510 aa  124  4e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  28.24 
 
 		 515 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  27.62 
 
 		 510 aa  120  6e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6643  extracellular solute-binding protein family 5  25.19 
 
 		 514 aa  116  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.19211 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0111  extracellular solute-binding protein family 5  23.97 
 
 		 517 aa  115  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7558  putative dipeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  26.48 
 
 		 515 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  26.22 
 
 		 519 aa  114  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1565  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  27.25 
 
 		 534 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1651  extracellular solute-binding protein  25.56 
 
 		 516 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5235  extracellular solute-binding protein family 5  25.36 
 
 		 522 aa  111  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  27.5 
 
 		 516 aa  111  4.0000000000000004e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2678  extracellular solute-binding protein  24.94 
 
 		 500 aa  110  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00233729  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0140  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  33.88 
 
 		 534 aa  110  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259377  normal  0.633025 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  25.31 
 
 		 510 aa  109  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4877  putative ABC transporter, substrate binding protein  26.97 
 
 		 560 aa  109  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.674427  normal  0.0830201 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2436  extracellular solute-binding protein  25.37 
 
 		 514 aa  109  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  24.42 
 
 		 541 aa  108  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3016  extracellular solute-binding protein family 5  27.13 
 
 		 545 aa  108  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0244604  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2583  putative ABC transporter, substrate binding subunit  26.67 
 
 		 524 aa  107  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432339 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1443  extracellular solute-binding protein  24.3 
 
 		 517 aa  107  8e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.13157 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  24.95 
 
 		 512 aa  106  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  24.95 
 
 		 512 aa  106  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  24.95 
 
 		 512 aa  106  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  26.21 
 
 		 511 aa  105  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2585  putative ABC transporter, substrate binding subunit  27.75 
 
 		 520 aa  105  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598963 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4831  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  26.03 
 
 		 527 aa  105  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.153883  normal  0.947205 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5138  putative periplasmic peptide-binding protein ABC transporter  26.4 
 
 		 495 aa  104  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0462348 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3635  extracellular solute-binding protein  25.98 
 
 		 515 aa  103  7e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.014259  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4726  extracellular solute-binding protein  23.26 
 
 		 529 aa  103  8e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1313  extracellular solute-binding protein  28.7 
 
 		 493 aa  102  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  22.67 
 
 		 495 aa  102  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4491  extracellular solute-binding protein family 5  26.81 
 
 		 509 aa  101  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5641  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  26.72 
 
 		 508 aa  101  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1041  extracellular solute-binding protein  27.24 
 
 		 538 aa  101  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3028  twin-arginine translocation pathway signal  29.13 
 
 		 562 aa  100  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000374916  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4201  extracellular solute-binding protein family 5  26.54 
 
 		 508 aa  100  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2000  extracellular solute-binding protein  25.66 
 
 		 550 aa  100  7e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  31.06 
 
 		 544 aa  100  9e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4858  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.89 
 
 		 531 aa  100  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.185299  normal  0.554017 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5947  extracellular solute-binding protein family 5  24.37 
 
 		 521 aa  99.4  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.281116  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4327  putative ABC transporter, extracellular substrate binding protein  26.97 
 
 		 538 aa  99.4  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  24.89 
 
 		 505 aa  99.4  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2547  extracellular solute-binding protein  30.11 
 
 		 534 aa  99.4  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  24.8 
 
 		 515 aa  98.6  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  23.53 
 
 		 565 aa  98.2  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7212  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  24.32 
 
 		 531 aa  97.8  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2918  extracellular solute-binding protein family 5  26.49 
 
 		 538 aa  97.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258086  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0753  extracellular solute-binding protein  23.58 
 
 		 490 aa  97.4  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139724  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2913  extracellular solute-binding protein family 5  25.32 
 
 		 533 aa  97.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.037834  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  28.43 
 
 		 544 aa  97.1  7e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18790  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.2 
 
 		 540 aa  97.1  8e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00232176  normal  0.206883 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0360  extracellular solute-binding protein family 5  24.48 
 
 		 506 aa  96.3  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2850  putative ABC transporter substrate-binding protein  23.03 
 
 		 490 aa  96.7  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.938621  normal  0.738445 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  29.37 
 
 		 542 aa  96.3  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5589  extracellular solute-binding protein  23.98 
 
 		 513 aa  95.9  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.333853 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1152  extracellular solute-binding protein  26.49 
 
 		 538 aa  95.9  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.296162 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>