More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4745 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4745  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 533 aa  1077    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5818  extracellular solute-binding protein  72.37 
 
 		 531 aa  791    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0665054  normal  0.029553 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4251  extracellular solute-binding protein  53.16 
 
 		 523 aa  535  1e-151  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.497786  normal  0.0434638 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5806  extracellular solute-binding protein  50.4 
 
 		 530 aa  491  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.068843  normal  0.564208 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3922  extracellular solute-binding protein  48.05 
 
 		 526 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.824445  normal  0.0767976 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3055  extracellular solute-binding protein  47.85 
 
 		 530 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.169958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4438  extracellular solute-binding protein  47.31 
 
 		 523 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3927  extracellular solute-binding protein  46.68 
 
 		 533 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.180708  normal  0.0370442 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4366  extracellular solute-binding protein  44.47 
 
 		 528 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5122  putative ABC transporter periplasmic-binding protein  44.93 
 
 		 534 aa  435  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.259122 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0400  extracellular solute-binding protein family 5  42.83 
 
 		 525 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1411  extracellular solute-binding protein family 5  39.1 
 
 		 537 aa  398  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2210  extracellular solute-binding protein  42.32 
 
 		 530 aa  395  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.046819 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1226  extracellular solute-binding protein  40.59 
 
 		 536 aa  391  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.560776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1971  extracellular solute-binding protein  41.63 
 
 		 529 aa  392  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.19178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5254  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  38.26 
 
 		 537 aa  387  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.534405  normal  0.0632497 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4022  extracellular solute-binding protein  39.41 
 
 		 536 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00714098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1200  extracellular solute-binding protein  39.8 
 
 		 535 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5253  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  39.16 
 
 		 537 aa  380  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0401744 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5251  putative ABC transporter substrate-binding protein  39.88 
 
 		 517 aa  375  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1867  extracellular solute-binding protein  41.18 
 
 		 527 aa  360  3e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.546614  normal  0.0646948 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1556  extracellular solute-binding protein family 5  40 
 
 		 525 aa  350  2e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.251844  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5088  putative oligopeptide/dipeptide ABC transporter  41.04 
 
 		 527 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0437131  normal  0.457948 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2002  extracellular solute-binding protein  36.36 
 
 		 527 aa  334  2e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.956925 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3643  twin-arginine translocation pathway signal  37.27 
 
 		 533 aa  332  1e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.166369  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0979  extracellular solute-binding protein  37.45 
 
 		 530 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.297745  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1835  extracellular solute-binding protein family 5  37.36 
 
 		 544 aa  327  4.0000000000000003e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.274279  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3800  extracellular solute-binding protein  36.33 
 
 		 530 aa  323  4e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.129084 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1499  extracellular solute-binding protein  36.96 
 
 		 524 aa  303  6.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.779721  normal  0.296474 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2984  extracellular solute-binding protein  25.51 
 
 		 508 aa  153  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00198911  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1090  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.19 
 
 		 514 aa  147  5e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0985  extracellular solute-binding protein  27.19 
 
 		 511 aa  145  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.252461  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6670  extracellular solute-binding protein family 5  24.19 
 
 		 508 aa  141  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.0000010094  normal  0.0327722 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5086  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  24.75 
 
 		 517 aa  140  6e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.243076  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5763  extracellular solute-binding protein family 5  23.98 
 
 		 508 aa  140  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  unclonable  0.000000000235373  normal  0.926009 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0934  twin-arginine translocation pathway signal  25.41 
 
 		 537 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  30.83 
 
 		 505 aa  130  4.0000000000000003e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0656  twin-arginine translocation pathway signal  25.83 
 
 		 521 aa  128  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.435676  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1214  extracellular solute-binding protein family 5  24.95 
 
 		 524 aa  125  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3323  extracellular solute-binding protein  24.67 
 
 		 527 aa  124  5e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.187539 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3892  ABC di/oligopeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  24.35 
 
 		 518 aa  121  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.206545  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4147  extracellular solute-binding protein  24.35 
 
 		 518 aa  120  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6643  extracellular solute-binding protein family 5  26.22 
 
 		 514 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.19211 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  25.59 
 
 		 512 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2436  extracellular solute-binding protein  26.86 
 
 		 514 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25 
 
 		 510 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4491  extracellular solute-binding protein family 5  25.75 
 
 		 509 aa  111  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  27.5 
 
 		 515 aa  110  6e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3016  extracellular solute-binding protein family 5  27.64 
 
 		 545 aa  110  8.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0244604  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  25.85 
 
 		 516 aa  107  5e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0140  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.4 
 
 		 534 aa  107  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259377  normal  0.633025 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5641  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  26.46 
 
 		 508 aa  107  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  25.86 
 
 		 523 aa  107  8e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2678  extracellular solute-binding protein  25.74 
 
 		 500 aa  104  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00233729  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  26.25 
 
 		 510 aa  104  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1565  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  32.6 
 
 		 534 aa  104  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  26.71 
 
 		 519 aa  104  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7558  putative dipeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  24.52 
 
 		 515 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0111  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 		 517 aa  103  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4201  extracellular solute-binding protein family 5  26.2 
 
 		 508 aa  102  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3635  extracellular solute-binding protein  24.27 
 
 		 515 aa  101  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.014259  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4858  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.29 
 
 		 531 aa  101  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.185299  normal  0.554017 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1651  extracellular solute-binding protein  25.19 
 
 		 516 aa  101  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5589  extracellular solute-binding protein  25.43 
 
 		 513 aa  100  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.333853 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4109  extracellular solute-binding protein family 5  25.94 
 
 		 513 aa  100  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344383  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0074  twin-arginine translocation pathway signal  24.9 
 
 		 514 aa  100  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0403886  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7212  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  23.26 
 
 		 531 aa  100  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4398  extracellular solute-binding protein family 5  25.94 
 
 		 513 aa  100  7e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0482953  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4877  putative ABC transporter, substrate binding protein  25.59 
 
 		 560 aa  100  8e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.674427  normal  0.0830201 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2585  putative ABC transporter, substrate binding subunit  26.32 
 
 		 520 aa  99.4  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598963 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1313  extracellular solute-binding protein  25.31 
 
 		 493 aa  99  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0753  extracellular solute-binding protein  24.76 
 
 		 490 aa  98.2  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139724  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  25.14 
 
 		 544 aa  98.2  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5088  extracellular solute-binding protein family 5  25.41 
 
 		 553 aa  97.8  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.416607 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  24.52 
 
 		 505 aa  97.4  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4859  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.9 
 
 		 532 aa  97.4  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  23.58 
 
 		 522 aa  97.1  8e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5138  putative periplasmic peptide-binding protein ABC transporter  24.4 
 
 		 495 aa  95.9  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0462348 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0611  extracellular solute-binding protein family 5  26.78 
 
 		 527 aa  96.3  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4831  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  25.4 
 
 		 527 aa  95.5  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.153883  normal  0.947205 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5235  extracellular solute-binding protein family 5  23.04 
 
 		 522 aa  95.9  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2583  putative ABC transporter, substrate binding subunit  27.99 
 
 		 524 aa  94.7  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432339 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5947  extracellular solute-binding protein family 5  24.09 
 
 		 521 aa  94.7  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.281116  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2000  extracellular solute-binding protein  23.65 
 
 		 550 aa  94.4  5e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5794  extracellular solute-binding protein  23.02 
 
 		 520 aa  94  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000436692  decreased coverage  0.000177852 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0750  extracellular solute-binding protein  23.99 
 
 		 535 aa  94  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  24.57 
 
 		 515 aa  93.6  7e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2547  extracellular solute-binding protein  26.36 
 
 		 534 aa  94  7e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2847  4-phytase  26.36 
 
 		 495 aa  93.6  8e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.640082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  30.21 
 
 		 544 aa  93.6  9e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  24.9 
 
 		 520 aa  93.2  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  22.77 
 
 		 541 aa  93.2  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  24.24 
 
 		 510 aa  92.8  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  24.46 
 
 		 502 aa  92  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3028  twin-arginine translocation pathway signal  27.27 
 
 		 562 aa  92.4  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000374916  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  24.51 
 
 		 535 aa  91.7  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  24.25 
 
 		 512 aa  92  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  30.45 
 
 		 524 aa  91.7  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  24.25 
 
 		 512 aa  92  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1807  extracellular solute-binding protein family 5  27.01 
 
 		 528 aa  91.7  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>