More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1837 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1001  twin-arginine translocation pathway signal  68.51 
 
 
542 aa  785    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.483502  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2237  extracellular solute-binding protein  58.86 
 
 
550 aa  662    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6464  putative oligopeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  76.65 
 
 
545 aa  885    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.69774 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2857  extracellular solute-binding protein  67.46 
 
 
542 aa  783    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.791512  normal  0.700488 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1837  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
544 aa  1127    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2700  ABC transporter substrate binding protein (agrocinopine)  33.64 
 
 
521 aa  284  3.0000000000000004e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1077  extracellular solute-binding protein  28.33 
 
 
522 aa  196  8.000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.108497 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  27.77 
 
 
505 aa  157  4e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1873  extracellular solute-binding protein  27.05 
 
 
526 aa  150  7e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.021803  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  27.31 
 
 
541 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1440  extracellular solute-binding protein family 5  25.62 
 
 
514 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  26.44 
 
 
520 aa  140  7e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  28.07 
 
 
535 aa  139  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4455  extracellular solute-binding protein  28 
 
 
509 aa  139  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.661138  hitchhiker  0.000234808 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  27.51 
 
 
534 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5070  extracellular solute-binding protein  29.38 
 
 
495 aa  136  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.27843  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2790  extracellular solute-binding protein family 5  26.9 
 
 
527 aa  134  3.9999999999999996e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4103  extracellular solute-binding protein family 5  26.18 
 
 
502 aa  134  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1189  extracellular solute-binding protein  24.67 
 
 
525 aa  134  6e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0440454  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  26.46 
 
 
521 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  26.46 
 
 
521 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.46 
 
 
521 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  26.46 
 
 
521 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  26.46 
 
 
521 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3603  extracellular solute-binding protein  28.3 
 
 
507 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.721238 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0015  extracellular solute-binding protein family 5  26.58 
 
 
516 aa  131  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3383  extracellular solute-binding protein family 5  29.4 
 
 
533 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3881  extracellular solute-binding protein  25.46 
 
 
515 aa  129  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.441306  normal  0.0413131 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  24.28 
 
 
528 aa  128  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0872  extracellular solute-binding protein family 5  27.76 
 
 
527 aa  127  6e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.625735 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0044  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  29.27 
 
 
530 aa  126  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2870  periplasmic dipeptide transport protein  29.4 
 
 
509 aa  126  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00619899  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2532  extracellular solute-binding protein  27.88 
 
 
535 aa  126  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00384928 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3706  extracellular solute-binding protein family 5  28.64 
 
 
533 aa  126  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0015  extracellular solute-binding protein family 5  25.75 
 
 
516 aa  126  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.406265  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  24.69 
 
 
532 aa  125  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0038  extracellular solute-binding protein  25.38 
 
 
533 aa  125  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830083  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3804  extracellular solute-binding protein  29.16 
 
 
509 aa  125  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00625229  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3969  extracellular solute-binding protein  25.54 
 
 
532 aa  124  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3231  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  25.54 
 
 
532 aa  124  4e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.704667  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4293  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 
541 aa  124  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.5263  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4734  extracellular solute-binding protein  25.13 
 
 
521 aa  124  6e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.676308  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2619  extracellular solute-binding protein family 5  25.54 
 
 
512 aa  123  8e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.181451  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5067  extracellular solute-binding protein  28.78 
 
 
495 aa  123  9e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.68424  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13240  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.57 
 
 
504 aa  123  9e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0803154  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0067  extracellular solute-binding protein  25.64 
 
 
542 aa  122  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0810  extracellular solute-binding protein  24.37 
 
 
489 aa  123  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0449  extracellular solute-binding protein  28.2 
 
 
520 aa  122  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4405  extracellular solute-binding protein  23.98 
 
 
532 aa  123  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  23.93 
 
 
509 aa  121  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0391  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 
522 aa  121  3e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1361  extracellular solute-binding protein family 5  25.97 
 
 
516 aa  121  3e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000166548  normal  0.279813 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  26.67 
 
 
509 aa  121  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1284  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  25.83 
 
 
545 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000669385  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1764  extracellular solute-binding protein family 5  28.29 
 
 
526 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1671  extracellular solute-binding protein  25.16 
 
 
538 aa  120  7e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.901467 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2505  extracellular solute-binding protein family 5  24.2 
 
 
531 aa  120  7e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  26.58 
 
 
532 aa  120  7.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  30.86 
 
 
528 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0275  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide/dipeptide-binding protein  25.16 
 
 
595 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3653  extracellular solute-binding protein family 5  30.61 
 
 
513 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0310608  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2930  extracellular solute-binding protein family 5  23.13 
 
 
531 aa  119  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.892948  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1977  extracellular solute-binding protein  24.15 
 
 
506 aa  119  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.719795 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3006  extracellular solute-binding protein  26.77 
 
 
528 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165169  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1189  extracellular solute-binding protein family 5  27.3 
 
 
497 aa  118  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0095  transport protein, extracellular solute-binding protein  26.52 
 
 
517 aa  117  3.9999999999999997e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0865281  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3158  extracellular solute-binding protein  26.52 
 
 
535 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1886  periplasmic dipeptide transport protein precursor  28.32 
 
 
525 aa  117  6e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.105927  normal  0.91526 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4381  extracellular solute-binding protein  29.67 
 
 
510 aa  117  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.582693  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1240  extracellular solute-binding protein  26.22 
 
 
530 aa  117  7.999999999999999e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0114  extracellular solute-binding protein  24.74 
 
 
530 aa  116  8.999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2564  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.98 
 
 
542 aa  116  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0172077  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2087  extracellular solute-binding protein family 5  28.02 
 
 
522 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159106  normal  0.621098 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3828  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  25.27 
 
 
526 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.808847  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25 
 
 
510 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  24.75 
 
 
502 aa  115  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2974  extracellular solute-binding protein  30.3 
 
 
530 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2857  putative oligopeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  26 
 
 
532 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.207734 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0562  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  25.67 
 
 
518 aa  115  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1792  extracellular solute-binding protein family 5  26.91 
 
 
514 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0136295  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0329  extracellular solute-binding protein  26.44 
 
 
531 aa  114  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  0.0616043 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  23.83 
 
 
526 aa  114  5e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3842  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  25.05 
 
 
526 aa  114  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2497  extracellular solute-binding protein family 5  25.33 
 
 
528 aa  114  6e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0778602 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3906  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  25.05 
 
 
526 aa  114  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.938997 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3950  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  25.05 
 
 
526 aa  114  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1531  extracellular solute-binding protein family 5  22.95 
 
 
531 aa  113  7.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5110  ABC transporter periplasmic binding protein  24.26 
 
 
537 aa  113  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.321263  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1632  extracellular solute-binding protein family 5  26.33 
 
 
517 aa  113  9e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0450  extracellular solute-binding protein family 5  24.28 
 
 
519 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.15126 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  24.38 
 
 
512 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4010  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  25.05 
 
 
526 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1582  extracellular solute-binding protein  24.84 
 
 
531 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264898  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0928  extracellular solute-binding protein  25.81 
 
 
541 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4912  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  25.21 
 
 
535 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2411  extracellular solute-binding protein family 5  24.53 
 
 
531 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.334082  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0184  extracellular solute-binding protein family 5  25.61 
 
 
518 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0538  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  24.69 
 
 
525 aa  112  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.461639  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0750  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  25.61 
 
 
559 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0146598  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2678  extracellular solute-binding protein  22.76 
 
 
500 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00233729  normal  0.64261 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>