More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1001 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6464  putative oligopeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  65.93 
 
 		 545 aa  746    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.69774 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2857  extracellular solute-binding protein  82.66 
 
 		 542 aa  961    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.791512  normal  0.700488 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1837  extracellular solute-binding protein  68.51 
 
 		 544 aa  785    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1001  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 542 aa  1120    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.483502  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2237  extracellular solute-binding protein  51.76 
 
 		 550 aa  571  1e-161  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2700  ABC transporter substrate binding protein (agrocinopine)  32.37 
 
 		 521 aa  269  8e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1077  extracellular solute-binding protein  31.35 
 
 		 522 aa  219  1e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.108497 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4455  extracellular solute-binding protein  31.69 
 
 		 509 aa  155  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.661138  hitchhiker  0.000234808 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  26.81 
 
 		 505 aa  151  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0810  extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 		 489 aa  142  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5067  extracellular solute-binding protein  27.89 
 
 		 495 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.68424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1873  extracellular solute-binding protein  26.64 
 
 		 526 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.021803  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5070  extracellular solute-binding protein  26.01 
 
 		 495 aa  139  8.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.27843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3804  extracellular solute-binding protein  30.33 
 
 		 509 aa  139  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00625229  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3383  extracellular solute-binding protein family 5  29.12 
 
 		 533 aa  137  5e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1440  extracellular solute-binding protein family 5  26.34 
 
 		 514 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1189  extracellular solute-binding protein  24.84 
 
 		 525 aa  132  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0440454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3706  extracellular solute-binding protein family 5  28.44 
 
 		 533 aa  131  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0782  extracellular solute-binding protein  28.34 
 
 		 494 aa  130  5.0000000000000004e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.319175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0872  extracellular solute-binding protein family 5  29.39 
 
 		 527 aa  130  6e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.625735 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3603  extracellular solute-binding protein  27.85 
 
 		 507 aa  130  6e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.721238 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3653  extracellular solute-binding protein family 5  27.59 
 
 		 513 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0310608  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  26.61 
 
 		 535 aa  128  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  27.08 
 
 		 534 aa  128  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  24.68 
 
 		 521 aa  126  9e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  24.68 
 
 		 521 aa  126  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.68 
 
 		 521 aa  126  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0275  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide/dipeptide-binding protein  24.39 
 
 		 595 aa  126  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  24.68 
 
 		 521 aa  126  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  24.68 
 
 		 521 aa  126  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0015  extracellular solute-binding protein family 5  25.88 
 
 		 516 aa  125  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1189  extracellular solute-binding protein family 5  24.95 
 
 		 497 aa  126  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  25.73 
 
 		 532 aa  125  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0450  extracellular solute-binding protein family 5  26.34 
 
 		 519 aa  125  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.15126 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  26.05 
 
 		 541 aa  125  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3144  extracellular solute-binding protein  28.06 
 
 		 526 aa  124  5e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.000116165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  24.54 
 
 		 520 aa  124  6e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5796  extracellular solute-binding protein  26.44 
 
 		 526 aa  122  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00815808  hitchhiker  0.00391201 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2583  putative ABC transporter, substrate binding subunit  26.57 
 
 		 524 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432339 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0015  extracellular solute-binding protein family 5  26.03 
 
 		 516 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.406265  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0114  extracellular solute-binding protein  25.83 
 
 		 530 aa  120  9e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0095  transport protein, extracellular solute-binding protein  25.66 
 
 		 517 aa  120  9e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0865281  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  27.01 
 
 		 532 aa  119  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3551  extracellular solute-binding protein family 5  27.02 
 
 		 531 aa  119  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.186732  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13240  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.7 
 
 		 504 aa  119  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0803154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0449  extracellular solute-binding protein  27.37 
 
 		 520 aa  119  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3969  extracellular solute-binding protein  25.7 
 
 		 532 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3231  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  25.7 
 
 		 532 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.704667  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2974  extracellular solute-binding protein  26.02 
 
 		 530 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  25.32 
 
 		 528 aa  117  5e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4381  extracellular solute-binding protein  29.18 
 
 		 510 aa  117  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.582693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1571  4-phytase  30.56 
 
 		 510 aa  117  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.624152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4734  extracellular solute-binding protein  26.6 
 
 		 521 aa  117  6e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.676308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1240  extracellular solute-binding protein  25.87 
 
 		 530 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0044  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  29.09 
 
 		 530 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0391  extracellular solute-binding protein  28.53 
 
 		 522 aa  116  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0360  extracellular solute-binding protein family 5  24.64 
 
 		 506 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2564  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.89 
 
 		 542 aa  116  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0172077  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1886  periplasmic dipeptide transport protein precursor  26.97 
 
 		 525 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.105927  normal  0.91526 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0184  extracellular solute-binding protein family 5  24.07 
 
 		 518 aa  115  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2870  periplasmic dipeptide transport protein  27.41 
 
 		 509 aa  115  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00619899  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0562  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  24.57 
 
 		 518 aa  114  3e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2790  extracellular solute-binding protein family 5  24.89 
 
 		 527 aa  114  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5411  extracellular solute-binding protein family 5  28.05 
 
 		 506 aa  114  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.253312  decreased coverage  0.00154474 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1792  extracellular solute-binding protein family 5  26 
 
 		 514 aa  114  5e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0136295  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  28 
 
 		 509 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002959  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  29.48 
 
 		 558 aa  113  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2113  extracellular solute-binding protein  25.46 
 
 		 527 aa  112  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142361  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5344  extracellular solute-binding protein family 5  27.52 
 
 		 506 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.297716  normal  0.516905 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0058  extracellular solute-binding protein  24.56 
 
 		 539 aa  111  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.112335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2087  extracellular solute-binding protein family 5  26.48 
 
 		 522 aa  111  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159106  normal  0.621098 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2187  extracellular solute-binding protein  24.62 
 
 		 519 aa  111  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.843737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02949  hypothetical protein  28.28 
 
 		 555 aa  111  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5794  extracellular solute-binding protein  24.43 
 
 		 520 aa  111  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000436692  decreased coverage  0.000177852 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  23.92 
 
 		 528 aa  111  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1603  extracellular solute-binding protein family 5  25.88 
 
 		 539 aa  110  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.654936  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4405  extracellular solute-binding protein  23.67 
 
 		 532 aa  110  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4103  extracellular solute-binding protein family 5  26.31 
 
 		 502 aa  110  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1250  extracellular solute-binding protein family 5  27.51 
 
 		 550 aa  110  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.405882  normal  0.0838621 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2497  extracellular solute-binding protein family 5  24.23 
 
 		 528 aa  110  8.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0778602 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3881  extracellular solute-binding protein  27.08 
 
 		 515 aa  110  9.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.441306  normal  0.0413131 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3006  extracellular solute-binding protein  26.9 
 
 		 528 aa  109  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165169  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1361  extracellular solute-binding protein family 5  24.58 
 
 		 516 aa  109  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000166548  normal  0.279813 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001974  peptide ABC transporter peptide-binding protein  26.04 
 
 		 517 aa  109  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  23.8 
 
 		 509 aa  109  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0112  extracellular solute-binding protein family 5  25.85 
 
 		 524 aa  109  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.214652  normal  0.175509 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3028  twin-arginine translocation pathway signal  25.45 
 
 		 562 aa  108  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000374916  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3963  hypothetical protein  23.24 
 
 		 508 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.81037  normal  0.136891 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2658  extracellular solute-binding protein family 5  26.97 
 
 		 529 aa  108  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293814 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2619  extracellular solute-binding protein family 5  23.49 
 
 		 512 aa  109  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.181451  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  25.16 
 
 		 502 aa  108  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1552  extracellular solute-binding protein  24.48 
 
 		 551 aa  108  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560356 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00493  ABC-type dipeptide transporter periplasmic component  25.93 
 
 		 519 aa  108  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1605  extracellular solute-binding protein  24.89 
 
 		 595 aa  108  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1671  extracellular solute-binding protein  23.7 
 
 		 538 aa  108  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.901467 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3602  extracellular solute-binding protein  26.37 
 
 		 539 aa  108  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.170805  hitchhiker  0.00309347 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3507  extracellular solute-binding protein family 5  26.08 
 
 		 510 aa  108  4e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.224944  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2375  twin-arginine translocation pathway signal  28.36 
 
 		 514 aa  107  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1764  extracellular solute-binding protein family 5  25.96 
 
 		 526 aa  107  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4426  extracellular solute-binding protein  28.19 
 
 		 556 aa  107  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.169116  normal  0.480332 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>