More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0541 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0541  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 632 aa  1290    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.843572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0582  extracellular solute-binding protein family 5  40.57 
 
 		 645 aa  429  1e-119  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  25.11 
 
 		 534 aa  124  8e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0883  extracellular solute-binding protein family 5  30.17 
 
 		 547 aa  121  3.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  29.72 
 
 		 532 aa  118  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  23.87 
 
 		 535 aa  109  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0212  extracellular solute-binding protein  31.07 
 
 		 538 aa  109  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0260102  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0244  extracellular solute-binding protein family 5  29.5 
 
 		 575 aa  106  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.794885  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3028  twin-arginine translocation pathway signal  29.25 
 
 		 562 aa  106  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000374916  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  27.4 
 
 		 565 aa  107  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0562  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  30.46 
 
 		 518 aa  103  7e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  24.2 
 
 		 516 aa  103  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3275  hypothetical protein  30 
 
 		 540 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.349389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7328  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  27.16 
 
 		 517 aa  102  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.399444  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0114  extracellular solute-binding protein  24.83 
 
 		 530 aa  102  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  23.08 
 
 		 538 aa  101  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3003  extracellular solute-binding protein family 5  25.91 
 
 		 516 aa  100  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  25.85 
 
 		 539 aa  101  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0389  extracellular solute-binding protein  28.3 
 
 		 527 aa  100  6e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000716553  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0139  extracellular solute-binding protein  24.7 
 
 		 520 aa  100  8e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.382397 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00493  ABC-type dipeptide transporter periplasmic component  31.16 
 
 		 519 aa  99.8  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  24.19 
 
 		 534 aa  99.8  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1873  extracellular solute-binding protein  29.73 
 
 		 526 aa  99.8  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.021803  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3988  extracellular solute-binding protein  30 
 
 		 540 aa  99.8  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0095  transport protein, extracellular solute-binding protein  30.43 
 
 		 517 aa  99  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0865281  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  24.49 
 
 		 538 aa  98.2  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1658  extracellular solute-binding protein  25.83 
 
 		 516 aa  98.2  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.710594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  28.16 
 
 		 528 aa  97.4  7e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3103  extracellular solute-binding protein  25.76 
 
 		 519 aa  97.1  8e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3255  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  29.41 
 
 		 540 aa  97.1  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.433609  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2613  extracellular solute-binding protein family 5  27 
 
 		 562 aa  96.7  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0942045  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3231  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  25.32 
 
 		 532 aa  95.9  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.704667  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  24.18 
 
 		 542 aa  95.9  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  29.74 
 
 		 510 aa  95.9  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3969  extracellular solute-binding protein  25.32 
 
 		 532 aa  95.9  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0753  extracellular solute-binding protein  24.12 
 
 		 490 aa  95.5  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139724  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  25 
 
 		 546 aa  94.7  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1751  extracellular solute-binding protein  28.91 
 
 		 538 aa  94.4  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150343  normal  0.0954392 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  26.44 
 
 		 520 aa  94.4  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3243  extracellular solute-binding protein  24.7 
 
 		 509 aa  94  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.649697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4591  extracellular solute-binding protein  25.47 
 
 		 517 aa  94  8e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0777489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  26.51 
 
 		 516 aa  94  9e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1319  extracellular solute-binding protein family 5  25.39 
 
 		 521 aa  93.2  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0396363  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  24.61 
 
 		 521 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001974  peptide ABC transporter peptide-binding protein  29.11 
 
 		 517 aa  93.2  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0067  extracellular solute-binding protein  23.81 
 
 		 542 aa  93.6  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  25.06 
 
 		 510 aa  93.6  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4426  extracellular solute-binding protein  25.8 
 
 		 520 aa  93.2  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2342  extracellular solute-binding protein family 5  27 
 
 		 580 aa  92.8  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2505  extracellular solute-binding protein family 5  24.19 
 
 		 531 aa  92.8  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0184  extracellular solute-binding protein  22.94 
 
 		 535 aa  92.4  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.507506 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  23.56 
 
 		 533 aa  92.4  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3950  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  23.39 
 
 		 526 aa  92  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3842  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  23.39 
 
 		 526 aa  92  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3906  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  23.39 
 
 		 526 aa  92  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.938997 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1718  extracellular solute-binding protein family 5  25.94 
 
 		 581 aa  92  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.264997  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4010  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  23.39 
 
 		 526 aa  91.7  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  24.3 
 
 		 521 aa  91.7  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.3 
 
 		 521 aa  91.7  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1784  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.35 
 
 		 547 aa  91.7  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  24.3 
 
 		 521 aa  91.7  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1892  extracellular solute-binding protein  27.35 
 
 		 547 aa  91.7  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.110335  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  24.3 
 
 		 521 aa  91.7  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0044  extracellular solute-binding protein family 5  24.28 
 
 		 535 aa  91.3  5e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  22.39 
 
 		 502 aa  91.3  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  23.15 
 
 		 540 aa  91.3  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4103  extracellular solute-binding protein family 5  24.94 
 
 		 502 aa  90.9  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1752  extracellular solute-binding protein family 5  24.82 
 
 		 582 aa  90.9  6e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2816  extracellular solute-binding protein  23.57 
 
 		 545 aa  91.3  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.54552  normal  0.0589435 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3828  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  23.17 
 
 		 526 aa  90.5  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.808847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0782  extracellular solute-binding protein  27.62 
 
 		 494 aa  90.5  7e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.319175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1926  extracellular solute-binding protein  27.67 
 
 		 518 aa  90.5  8e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.293523  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1690  extracellular solute-binding protein  24.81 
 
 		 532 aa  90.5  8e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23662  normal  0.232631 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  24.08 
 
 		 512 aa  90.5  8e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4912  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  23.62 
 
 		 535 aa  90.5  8e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  24.08 
 
 		 512 aa  90.5  8e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3907  extracellular solute-binding protein family 5  23.6 
 
 		 535 aa  90.5  8e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  24.08 
 
 		 512 aa  90.5  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0490  extracellular solute-binding protein family 5  24.08 
 
 		 531 aa  90.1  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0275  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide/dipeptide-binding protein  26.18 
 
 		 595 aa  90.5  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2648  extracellular solute-binding protein  24.4 
 
 		 524 aa  90.1  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3692  extracellular solute-binding protein family 5  26.01 
 
 		 526 aa  89.7  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4098  extracellular solute-binding protein family 5  22.68 
 
 		 535 aa  89.7  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03395  dipeptide transporter  23.39 
 
 		 535 aa  89  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0168  4-phytase  23.39 
 
 		 535 aa  89  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03346  hypothetical protein  23.39 
 
 		 535 aa  89  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13240  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.35 
 
 		 504 aa  89.4  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0803154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0049  extracellular solute-binding protein family 5  23.69 
 
 		 535 aa  89.4  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.46848  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3744  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  23.39 
 
 		 535 aa  89  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2626  extracellular solute-binding protein family 5  24.59 
 
 		 503 aa  89.4  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.253128  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3863  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  23.39 
 
 		 535 aa  89.4  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0171  4-phytase  23.39 
 
 		 535 aa  89  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4037  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  23.39 
 
 		 535 aa  89  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1361  extracellular solute-binding protein family 5  27.18 
 
 		 516 aa  88.6  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000166548  normal  0.279813 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2629  extracellular solute-binding protein  24.72 
 
 		 550 aa  88.6  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.553559  normal  0.405199 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  24.49 
 
 		 512 aa  88.6  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3479  extracellular solute-binding protein  23.89 
 
 		 546 aa  89  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.116614  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5114  ABC transporter periplasmic binding protein  22.73 
 
 		 533 aa  88.6  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  25 
 
 		 532 aa  88.2  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1408  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 		 518 aa  88.2  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00741999  normal  0.0556416 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>