More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3692 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3692  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
526 aa  1077    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1598  extracellular solute-binding protein family 5  42.02 
 
 
561 aa  378  1e-103  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0732805  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1456  extracellular solute-binding protein family 5  32.69 
 
 
532 aa  273  7e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  28.36 
 
 
532 aa  188  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  27.03 
 
 
534 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  26.95 
 
 
535 aa  182  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  30.18 
 
 
510 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  28.88 
 
 
505 aa  168  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  27.42 
 
 
528 aa  168  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0074  twin-arginine translocation pathway signal  28.69 
 
 
514 aa  162  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0403886  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  27.69 
 
 
541 aa  160  4e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  26.44 
 
 
495 aa  159  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  27.45 
 
 
520 aa  157  5.0000000000000005e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  27.38 
 
 
528 aa  155  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  28.74 
 
 
510 aa  155  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  28.81 
 
 
509 aa  154  5e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  27.29 
 
 
516 aa  153  7e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  27.31 
 
 
512 aa  153  7e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  27.31 
 
 
512 aa  153  7e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  27.31 
 
 
512 aa  153  7e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  29.11 
 
 
511 aa  153  8e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  25.62 
 
 
521 aa  150  6e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  25.62 
 
 
521 aa  150  7e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  25.62 
 
 
521 aa  150  7e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.62 
 
 
521 aa  150  7e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  25.62 
 
 
521 aa  150  7e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1344  extracellular solute-binding protein  27.43 
 
 
506 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.088373  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0263  extracellular solute-binding protein family 5  25.27 
 
 
516 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0801202  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0184  extracellular solute-binding protein family 5  28.83 
 
 
518 aa  147  5e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.32 
 
 
538 aa  146  8.000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3678  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.93 
 
 
525 aa  146  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0885273 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  27.22 
 
 
515 aa  146  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  27.06 
 
 
524 aa  145  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  27.78 
 
 
565 aa  144  5e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1666  extracellular solute-binding protein  26.91 
 
 
501 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0139  extracellular solute-binding protein  23.77 
 
 
520 aa  141  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.382397 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  25.85 
 
 
502 aa  141  3e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  25.82 
 
 
509 aa  141  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  27.89 
 
 
515 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3648  extracellular solute-binding protein family 5  24.72 
 
 
556 aa  139  8.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  25.59 
 
 
544 aa  139  1e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  24.75 
 
 
533 aa  139  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  26.58 
 
 
520 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  24.08 
 
 
534 aa  137  4e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7328  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  24.37 
 
 
517 aa  136  9e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.399444  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3003  extracellular solute-binding protein family 5  24.18 
 
 
516 aa  135  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  26.33 
 
 
510 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4591  extracellular solute-binding protein  23.53 
 
 
517 aa  135  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0777489  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3103  extracellular solute-binding protein  25.21 
 
 
519 aa  135  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0146  extracellular solute-binding protein family 5  25.38 
 
 
513 aa  135  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.377896  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  25.1 
 
 
540 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2790  extracellular solute-binding protein family 5  25.48 
 
 
527 aa  134  3.9999999999999996e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  25.11 
 
 
538 aa  134  5e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1600  extracellular solute-binding protein  25.27 
 
 
501 aa  134  6e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1380  substate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  25.06 
 
 
517 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.630202  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0111  extracellular solute-binding protein family 5  23.04 
 
 
517 aa  132  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58360  putative binding protein component of ABC transpor  28.09 
 
 
532 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  25.74 
 
 
523 aa  131  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1319  extracellular solute-binding protein family 5  25.33 
 
 
521 aa  131  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0396363  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  22.97 
 
 
539 aa  131  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2309  extracellular solute-binding protein  25.1 
 
 
534 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2923  extracellular solute-binding protein  25.1 
 
 
534 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  27.1 
 
 
532 aa  131  4.0000000000000003e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0453  4-phytase  25.58 
 
 
526 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132073  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3971  extracellular solute-binding protein family 5  24.95 
 
 
518 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  24.51 
 
 
546 aa  130  7.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3570  extracellular solute-binding protein family 5  24.79 
 
 
506 aa  130  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3039  4-phytase  27.82 
 
 
518 aa  129  9.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1253  extracellular solute-binding protein family 5  25.11 
 
 
517 aa  129  9.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.245274  normal  0.49371 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4398  extracellular solute-binding protein family 5  24.46 
 
 
513 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0482953  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2938  extracellular solute-binding protein  24.9 
 
 
531 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  23.03 
 
 
540 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1224  extracellular solute-binding protein family 5  26.19 
 
 
544 aa  129  2.0000000000000002e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0137957 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  25.37 
 
 
505 aa  129  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2835  extracellular solute-binding protein  24.51 
 
 
531 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.827526 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0960  extracellular solute-binding protein family 5  25.27 
 
 
547 aa  127  3e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2375  twin-arginine translocation pathway signal  26.56 
 
 
514 aa  127  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0753  extracellular solute-binding protein  24.47 
 
 
490 aa  128  3e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139724  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1873  extracellular solute-binding protein  24.76 
 
 
526 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.021803  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4455  extracellular solute-binding protein  28.72 
 
 
509 aa  127  5e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.661138  hitchhiker  0.000234808 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  26.48 
 
 
505 aa  127  7e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4109  extracellular solute-binding protein family 5  23.81 
 
 
513 aa  126  8.000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344383  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 
508 aa  125  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2972  extracellular solute-binding protein  24.63 
 
 
531 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  24.01 
 
 
544 aa  125  2e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6266  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  24.12 
 
 
531 aa  125  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.857663  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1781  extracellular solute-binding protein  26.65 
 
 
501 aa  125  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000533035  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0387  extracellular solute-binding protein family 5  26.23 
 
 
503 aa  125  2e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000219856  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1920  extracellular solute-binding protein  25.22 
 
 
607 aa  125  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689476  normal  0.0152046 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1361  extracellular solute-binding protein family 5  24.95 
 
 
516 aa  124  3e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000166548  normal  0.279813 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2116  hypothetical protein  23.34 
 
 
510 aa  124  5e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1926  extracellular solute-binding protein  24.85 
 
 
518 aa  124  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.293523  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0244  extracellular solute-binding protein family 5  29.72 
 
 
575 aa  123  6e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.794885  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3647  extracellular solute-binding protein family 5  25.27 
 
 
556 aa  124  6e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0862095  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0722  radical SAM domain-containing protein  24.42 
 
 
522 aa  123  8e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.597639 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  26.09 
 
 
531 aa  123  8e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0381  extracellular solute-binding protein  24.63 
 
 
531 aa  123  8e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.265556 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2678  extracellular solute-binding protein  24.1 
 
 
500 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00233729  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.03 
 
 
520 aa  123  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1552  extracellular solute-binding protein  23.32 
 
 
551 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000560356 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>