More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1456 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1456  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
532 aa  1089    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1598  extracellular solute-binding protein family 5  39.41 
 
 
561 aa  359  6e-98  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0732805  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3692  extracellular solute-binding protein family 5  32.69 
 
 
526 aa  261  2e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  29.7 
 
 
532 aa  163  7e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  25.66 
 
 
520 aa  145  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  24.52 
 
 
535 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3648  extracellular solute-binding protein family 5  26.11 
 
 
556 aa  140  6e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3647  extracellular solute-binding protein family 5  26.98 
 
 
556 aa  139  2e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0862095  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  28.17 
 
 
512 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  28.17 
 
 
512 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  28.17 
 
 
512 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26 
 
 
510 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0263  extracellular solute-binding protein family 5  26.56 
 
 
516 aa  131  3e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0801202  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  24.7 
 
 
528 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  25.3 
 
 
520 aa  125  1e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  26.26 
 
 
516 aa  125  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  25.99 
 
 
528 aa  125  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  22.22 
 
 
534 aa  124  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0387  extracellular solute-binding protein family 5  23.5 
 
 
503 aa  121  3e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000219856  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  23.75 
 
 
509 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  26.53 
 
 
515 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  26.44 
 
 
565 aa  119  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  25.41 
 
 
510 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  26.64 
 
 
508 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1344  extracellular solute-binding protein  25.66 
 
 
506 aa  118  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.088373  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0753  extracellular solute-binding protein  26.42 
 
 
490 aa  116  7.999999999999999e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139724  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0960  extracellular solute-binding protein family 5  25.59 
 
 
547 aa  116  7.999999999999999e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  23.15 
 
 
541 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  25.74 
 
 
511 aa  115  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  25.55 
 
 
505 aa  114  4.0000000000000004e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3804  extracellular solute-binding protein  24.81 
 
 
509 aa  114  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00625229  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3028  twin-arginine translocation pathway signal  25.21 
 
 
562 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000374916  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  23.93 
 
 
524 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4455  extracellular solute-binding protein  23.75 
 
 
509 aa  111  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.661138  hitchhiker  0.000234808 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4369  extracellular solute-binding protein family 5  25.56 
 
 
536 aa  110  7.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1224  extracellular solute-binding protein family 5  23.99 
 
 
544 aa  110  8.000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0137957 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  25.32 
 
 
510 aa  110  9.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  25.66 
 
 
531 aa  109  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2626  extracellular solute-binding protein family 5  24.85 
 
 
503 aa  109  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.253128  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  22.57 
 
 
521 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  22.57 
 
 
521 aa  108  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  22.57 
 
 
521 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  22.57 
 
 
521 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18790  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.67 
 
 
540 aa  108  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00232176  normal  0.206883 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  22.57 
 
 
521 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  24.73 
 
 
502 aa  109  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  24.02 
 
 
522 aa  108  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2471  putative ABC transporter periplasmic binding protein  30.13 
 
 
530 aa  108  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.10018 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3039  4-phytase  27.35 
 
 
518 aa  108  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1751  extracellular solute-binding protein  24.76 
 
 
538 aa  108  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150343  normal  0.0954392 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2847  4-phytase  23.58 
 
 
495 aa  108  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.640082  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1086  extracellular solute-binding protein  27.46 
 
 
523 aa  107  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13240  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  24.28 
 
 
504 aa  107  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0803154  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3630  extracellular solute-binding protein family 5  24.59 
 
 
514 aa  107  5e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1271  ABC transporter, periplasmic binding protein  27.11 
 
 
528 aa  107  7e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000259921  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2375  twin-arginine translocation pathway signal  26.5 
 
 
514 aa  105  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2998  extracellular solute-binding protein family 5  25.17 
 
 
610 aa  105  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.869563  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4285  extracellular solute-binding protein  24.1 
 
 
530 aa  104  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.261799  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0074  twin-arginine translocation pathway signal  26.96 
 
 
514 aa  104  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0403886  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  25.6 
 
 
505 aa  104  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4404  extracellular solute-binding protein  24.81 
 
 
536 aa  103  7e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  26.07 
 
 
505 aa  103  8e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3678  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.26 
 
 
525 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0885273 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0139  extracellular solute-binding protein  23.8 
 
 
520 aa  102  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.382397 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0450  extracellular solute-binding protein family 5  23.31 
 
 
519 aa  102  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.15126 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0924  extracellular solute-binding protein  21.82 
 
 
541 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0885  dipeptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  21.82 
 
 
541 aa  101  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.575043  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  22.55 
 
 
520 aa  101  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5357  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  25.16 
 
 
502 aa  100  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0991682  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  25.79 
 
 
523 aa  99.4  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2930  extracellular solute-binding protein family 5  22.55 
 
 
531 aa  99.8  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.892948  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3906  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  21.5 
 
 
526 aa  99.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.938997 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4010  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  21.5 
 
 
526 aa  99  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3950  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  21.5 
 
 
526 aa  99.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2758  extracellular solute-binding protein family 5  24.8 
 
 
524 aa  98.6  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3842  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  21.5 
 
 
526 aa  99.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1235  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.86 
 
 
542 aa  99  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.650831  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  24.9 
 
 
532 aa  99.4  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4591  extracellular solute-binding protein  23.98 
 
 
517 aa  98.6  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0777489  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1506  extracellular solute-binding protein  23.94 
 
 
501 aa  98.2  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0306373  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58350  putative binding protein component of ABC transpor  21.41 
 
 
537 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  22.9 
 
 
544 aa  98.2  3e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0844  extracellular solute-binding protein  24.85 
 
 
531 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1531  extracellular solute-binding protein family 5  21.76 
 
 
531 aa  98.2  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0782  extracellular solute-binding protein  25.2 
 
 
494 aa  97.8  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.319175  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3828  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  21.29 
 
 
526 aa  97.8  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.808847  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4405  extracellular solute-binding protein  21.06 
 
 
532 aa  97.8  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3387  extracellular solute-binding protein family 5  24.61 
 
 
550 aa  97.8  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4268  extracellular solute-binding protein family 5  21.78 
 
 
551 aa  97.8  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4328  extracellular solute-binding protein family 5  21.78 
 
 
551 aa  97.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.310509  normal  0.0771259 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3907  extracellular solute-binding protein family 5  21.34 
 
 
535 aa  97.8  5e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0094  extracellular solute-binding protein  23.17 
 
 
498 aa  97.4  6e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2258  solute-binding family 5 protein  21.17 
 
 
579 aa  97.4  6e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07058  hypothetical protein  23.33 
 
 
559 aa  97.1  7e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7328  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  23.28 
 
 
517 aa  97.1  7e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.399444  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2555  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, oligopeptide/dipeptide-binding protein  21.17 
 
 
580 aa  97.1  7e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4294  extracellular solute-binding protein  22.62 
 
 
530 aa  97.1  8e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.502669  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58390  putative binding protein component of ABC transpor  21.94 
 
 
533 aa  96.7  9e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7613  nickel ABC transporter periplasmic nickel-binding protein  23.19 
 
 
526 aa  96.7  9e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2701  extracellular solute-binding protein  22.71 
 
 
545 aa  96.7  9e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.301975  hitchhiker  0.00251286 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>