More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1860 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1860  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
544 aa  1120    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.44883  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1271  extracellular solute-binding protein family 5  47.69 
 
 
533 aa  457  1e-127  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000259985  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1345  dipeptide ABC transporter, solute-binding protein  45.54 
 
 
552 aa  456  1e-127  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.932628 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2203  extracellular solute-binding protein family 5  44.04 
 
 
549 aa  445  1e-123  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3066  extracellular solute-binding protein family 5  42.46 
 
 
547 aa  436  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1329  dipeptide ABC transporter, solute-binding protein  46.63 
 
 
532 aa  430  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0011  extracellular solute-binding protein  41.71 
 
 
534 aa  409  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0146567 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0035  extracellular solute-binding protein family 5  41.49 
 
 
546 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000195087  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1465  extracellular solute-binding protein family 5  39.96 
 
 
541 aa  389  1e-106  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0187  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  38.16 
 
 
542 aa  375  1e-102  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1125  extracellular solute-binding protein  40.16 
 
 
525 aa  360  5e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0107082  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1071  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  40.16 
 
 
525 aa  360  5e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0509495  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3547  nickel ABC transporter periplasmic nickel-binding protein  39.96 
 
 
515 aa  358  1.9999999999999998e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000727174  normal  0.0236631 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2550  extracellular solute-binding protein family 5  40.23 
 
 
523 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00133049  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0216  extracellular solute-binding protein  37.25 
 
 
569 aa  352  1e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1925  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  35.4 
 
 
544 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.176538  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1345  nickel ABC transporter periplasmic nickel-binding protein  35.22 
 
 
544 aa  328  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.38578 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3644  extracellular solute-binding protein  36.53 
 
 
510 aa  326  7e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1376  nickel ABC transporter periplasmic nickel-binding protein  35.96 
 
 
544 aa  323  5e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.268389 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0331  extracellular solute-binding protein family 5  35.39 
 
 
542 aa  322  8e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000557928  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1361  nickel ABC transporter periplasmic nickel-binding protein  35.96 
 
 
544 aa  322  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0151112 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2106  nickel ABC transporter periplasmic nickel-binding protein  35.96 
 
 
544 aa  321  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000610577 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1675  oligopeptide-binding protein OppA  35.32 
 
 
512 aa  318  2e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.642155  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  33.58 
 
 
509 aa  262  1e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3039  4-phytase  30.55 
 
 
518 aa  229  8e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5725  extracellular solute-binding protein family 5  27.92 
 
 
519 aa  185  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1450  peptide ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.99 
 
 
511 aa  176  9e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000430411  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  25.99 
 
 
526 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1652  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.76 
 
 
511 aa  176  9.999999999999999e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.2387  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  26.22 
 
 
540 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04010  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.76 
 
 
548 aa  164  3e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.115797  normal  0.0514058 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1755  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.03 
 
 
511 aa  161  2e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2798  extracellular solute-binding protein family 5  26.18 
 
 
557 aa  160  6e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.64 
 
 
538 aa  160  8e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2116  hypothetical protein  26.6 
 
 
510 aa  158  3e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1569  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.09 
 
 
511 aa  154  5e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2555  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, oligopeptide/dipeptide-binding protein  25.87 
 
 
580 aa  154  5e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  24.38 
 
 
559 aa  154  5e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2258  solute-binding family 5 protein  26.25 
 
 
579 aa  152  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1971  extracellular solute-binding protein family 5  27.27 
 
 
525 aa  152  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.743088  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1935  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.2 
 
 
511 aa  152  2e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  25.54 
 
 
540 aa  150  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  24.78 
 
 
538 aa  150  6e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0119  extracellular solute-binding protein  26.19 
 
 
532 aa  147  6e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.135782 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  27.7 
 
 
515 aa  146  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4500  extracellular solute-binding protein family 5  27.7 
 
 
528 aa  145  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.275925  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  26.96 
 
 
534 aa  143  7e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  28.39 
 
 
533 aa  143  9e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  24.07 
 
 
516 aa  141  3e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  24.95 
 
 
546 aa  141  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0398  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.76 
 
 
527 aa  138  2e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  23.93 
 
 
539 aa  138  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1284  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  25.86 
 
 
545 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000669385  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3566  dipeptide/oligopeptide-binding protein  28.48 
 
 
562 aa  137  4e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.672958  normal  0.0864129 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2583  putative ABC transporter, substrate binding subunit  30.57 
 
 
524 aa  137  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0432339 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0169  hypothetical protein  26.69 
 
 
518 aa  137  7.000000000000001e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2758  extracellular solute-binding protein family 5  24.76 
 
 
524 aa  135  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  25.28 
 
 
551 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  23.63 
 
 
505 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_002936  DET1494  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  29.51 
 
 
543 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0931394  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1284  extracellular solute-binding protein  29.51 
 
 
543 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0910  extracellular solute-binding protein  26.82 
 
 
555 aa  133  7.999999999999999e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.463169  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0947  extracellular solute-binding protein family 5  25.27 
 
 
622 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0930  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  31.02 
 
 
588 aa  131  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.476779  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  25.72 
 
 
576 aa  131  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0248  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein, putative  29.48 
 
 
575 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.15 
 
 
575 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.019765  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0510  extracellular solute-binding protein  29.8 
 
 
510 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0306064  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0520  extracellular solute-binding protein family 5  28.32 
 
 
545 aa  130  6e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 
565 aa  130  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0219  extracellular solute-binding protein  27.31 
 
 
575 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0645  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  27.03 
 
 
524 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0266  extracellular solute-binding protein family 5  26.96 
 
 
575 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0785  extracellular solute-binding protein  32.04 
 
 
512 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0600833  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  25.65 
 
 
508 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0241  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.78 
 
 
575 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0231  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  26.78 
 
 
555 aa  128  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  25.5 
 
 
528 aa  128  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1270  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  30.54 
 
 
542 aa  127  5e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.593504  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0218  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  29.02 
 
 
559 aa  127  6e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0391  extracellular solute-binding protein  27.03 
 
 
522 aa  126  8.000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  24.91 
 
 
535 aa  126  8.000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2770  extracellular solute-binding protein  25.21 
 
 
618 aa  124  3e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000172881  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1897  extracellular solute-binding protein family 5  28.41 
 
 
554 aa  124  5e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0038  extracellular solute-binding protein family 5  31.06 
 
 
568 aa  124  6e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0614  extracellular solute-binding protein family 5  26.89 
 
 
593 aa  123  7e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.459899  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0599  extracellular solute-binding protein family 5  23.42 
 
 
619 aa  122  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.300607 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  24.82 
 
 
534 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0782  extracellular solute-binding protein  31.97 
 
 
494 aa  122  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.319175  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0245  oligopeptide-binding protein OppA  26.09 
 
 
575 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0551474  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3058  extracellular solute-binding protein family 5  28 
 
 
554 aa  121  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000104524 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0205  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.35 
 
 
575 aa  121  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0343  extracellular solute-binding protein family 5  29.41 
 
 
537 aa  121  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0208  extracellular solute-binding protein  26.51 
 
 
575 aa  121  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4859  putative ABC transporter, substrate-binding protein  27.07 
 
 
532 aa  121  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1572  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  25.61 
 
 
516 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1621  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.85 
 
 
594 aa  121  3.9999999999999996e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  28.25 
 
 
542 aa  120  4.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0140  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.31 
 
 
534 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259377  normal  0.633025 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0132  extracellular solute-binding protein  26.64 
 
 
532 aa  120  6e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>