More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3996 on replicon NC_013924
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013924  Nmag_3996  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
563 aa  1143    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2201  extracellular solute-binding protein family 5  24.61 
 
 
567 aa  137  8e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1438  extracellular solute-binding protein family 5  25.29 
 
 
554 aa  130  5.0000000000000004e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.3177  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4407  twin-arginine translocation pathway signal  23.14 
 
 
541 aa  126  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.095613 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4406  twin-arginine translocation pathway signal  22.77 
 
 
541 aa  120  7e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0490152 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0883  extracellular solute-binding protein family 5  25.57 
 
 
547 aa  103  6e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  29.77 
 
 
533 aa  97.1  8e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  28.66 
 
 
534 aa  95.5  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3203  extracellular solute-binding protein family 5  24.92 
 
 
641 aa  93.6  8e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  25.89 
 
 
540 aa  92.8  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  26.69 
 
 
576 aa  91.7  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2388  extracellular solute-binding protein family 5  26.18 
 
 
583 aa  90.9  5e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  26.16 
 
 
526 aa  90.1  9e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.56 
 
 
538 aa  89  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  24.76 
 
 
539 aa  89.4  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  26.91 
 
 
540 aa  89  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  25.89 
 
 
538 aa  88.6  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  27.39 
 
 
546 aa  87.4  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0876  extracellular solute-binding protein family 5  23.84 
 
 
559 aa  87  9e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  26.91 
 
 
542 aa  86.7  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  26.47 
 
 
544 aa  84.7  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  25.15 
 
 
524 aa  84  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1565  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  24.42 
 
 
534 aa  84  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0140  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.67 
 
 
534 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259377  normal  0.633025 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0146  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.32 
 
 
539 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  26.55 
 
 
565 aa  80.5  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1414  extracellular solute-binding protein family 5  22.6 
 
 
636 aa  80.5  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1565  oligopeptide-binding protein, putative  26.62 
 
 
381 aa  80.1  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.306093  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0748  extracellular solute-binding protein  25.09 
 
 
535 aa  80.1  0.00000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4327  putative ABC transporter, extracellular substrate binding protein  26.6 
 
 
538 aa  80.1  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0563  extracellular solute-binding protein  25.65 
 
 
536 aa  79.7  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0406443  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0398  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.16 
 
 
527 aa  79.3  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7212  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  25.33 
 
 
531 aa  79  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0161  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.95 
 
 
529 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.485134  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2546  extracellular solute-binding protein  27.63 
 
 
531 aa  79  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.145645  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0750  extracellular solute-binding protein  25.58 
 
 
535 aa  79  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.4 
 
 
510 aa  78.2  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  27.47 
 
 
532 aa  78.2  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1038  extracellular solute-binding protein  25.84 
 
 
524 aa  77.8  0.0000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2624  extracellular solute-binding protein family 5  27.4 
 
 
547 aa  77.4  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.276954  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1152  extracellular solute-binding protein  26.97 
 
 
538 aa  77  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.296162 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2913  extracellular solute-binding protein family 5  25.64 
 
 
533 aa  77  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.037834  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  26.49 
 
 
532 aa  77  0.0000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  25.94 
 
 
510 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4859  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.67 
 
 
532 aa  76.3  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2547  extracellular solute-binding protein  25.78 
 
 
534 aa  75.5  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220611  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  26.51 
 
 
508 aa  75.9  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2918  extracellular solute-binding protein family 5  26.97 
 
 
538 aa  75.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258086  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0745  extracellular solute-binding protein  24.62 
 
 
534 aa  75.9  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1807  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 
528 aa  75.9  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3320  extracellular solute-binding protein  24.83 
 
 
528 aa  75.1  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0123121  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0094  extracellular solute-binding protein  24.46 
 
 
498 aa  75.1  0.000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4254  extracellular solute-binding protein  26.82 
 
 
527 aa  75.1  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.340537  normal  0.123719 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1041  extracellular solute-binding protein  25.73 
 
 
538 aa  74.7  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3133  twin-arginine translocation pathway signal  26.14 
 
 
529 aa  74.7  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2571  extracellular solute-binding protein family 5  26.14 
 
 
529 aa  73.9  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13754  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1902  extracellular solute-binding protein family 5  23.21 
 
 
501 aa  73.2  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000145643  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5138  putative periplasmic peptide-binding protein ABC transporter  26.61 
 
 
495 aa  72  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0462348 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  24.44 
 
 
544 aa  72.4  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5088  extracellular solute-binding protein family 5  28.88 
 
 
553 aa  72.4  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.416607 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2129  extracellular solute-binding protein  25.6 
 
 
627 aa  72  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.641802  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0426  extracellular solute-binding protein  23.53 
 
 
522 aa  72  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.133353  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1507  extracellular solute-binding protein family 5  23.97 
 
 
516 aa  72  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.221484  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5235  extracellular solute-binding protein family 5  22.59 
 
 
522 aa  71.2  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0807  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.49 
 
 
528 aa  71.2  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000107652  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0996  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.49 
 
 
528 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.41324e-61 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1000  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.49 
 
 
529 aa  70.5  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3496  extracellular solute-binding protein  24.39 
 
 
590 aa  69.7  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0858  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  22.73 
 
 
528 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000478589  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0822  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.08 
 
 
528 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4386  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.08 
 
 
529 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.775513  hitchhiker  3.14637e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0945  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.08 
 
 
528 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00751792  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0908  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  22.73 
 
 
528 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000813115  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0803  extracellular solute-binding protein  22.73 
 
 
529 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000165149  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5411  extracellular solute-binding protein family 5  25.51 
 
 
506 aa  68.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.253312  decreased coverage  0.00154474 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1450  peptide ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  22.44 
 
 
511 aa  69.3  0.0000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000430411  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0288  extracellular solute-binding protein  24.82 
 
 
631 aa  68.6  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4611  extracellular solute-binding protein family 5  27.2 
 
 
553 aa  68.2  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.596915 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  24.21 
 
 
509 aa  67.8  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1678  extracellular solute-binding protein family 5  28.04 
 
 
553 aa  68.2  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.495361  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  25.27 
 
 
515 aa  68.2  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4831  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  24.59 
 
 
527 aa  68.2  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.153883  normal  0.947205 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1244  extracellular solute-binding protein family 5  23.65 
 
 
588 aa  67.8  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.863592  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0015  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 
622 aa  67.8  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.440164  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2146  extracellular solute-binding protein  26.91 
 
 
661 aa  67.8  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155446  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0132  extracellular solute-binding protein  24.57 
 
 
532 aa  67.4  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3490  extracellular solute-binding protein  24.22 
 
 
529 aa  67.4  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3968  extracellular solute-binding protein  23.12 
 
 
537 aa  67.4  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.252184  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6684  extracellular solute-binding protein family 5  25.91 
 
 
548 aa  67.4  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.692475 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  24.43 
 
 
510 aa  67.4  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5671  extracellular solute-binding protein  25.26 
 
 
531 aa  67  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.880059  normal  0.0905991 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0671  extracellular solute-binding protein  22.79 
 
 
534 aa  67  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1651  extracellular solute-binding protein  22.92 
 
 
516 aa  67  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2583  putative ABC transporter, substrate binding subunit  23.44 
 
 
524 aa  67  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0432339 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2116  hypothetical protein  22.98 
 
 
510 aa  66.6  0.000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4354  extracellular solute-binding protein family 5  26.61 
 
 
497 aa  66.2  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.148655  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1169  oligopeptide-binding protein of oligopeptide ABC transporter  25.23 
 
 
587 aa  67  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.317639  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3167  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  25.66 
 
 
542 aa  66.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0244  ABC transporter substrate binding protein (peptide)  20.75 
 
 
631 aa  66.6  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0207  extracellular solute-binding protein  22.57 
 
 
567 aa  65.5  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>