More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4407 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4406  twin-arginine translocation pathway signal  94.27 
 
 		 541 aa  1045    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0490152 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4407  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 541 aa  1118    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.095613 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1438  extracellular solute-binding protein family 5  31.84 
 
 		 554 aa  292  1e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.3177  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2201  extracellular solute-binding protein family 5  31.05 
 
 		 567 aa  287  2.9999999999999996e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2388  extracellular solute-binding protein family 5  30.31 
 
 		 583 aa  259  8e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1414  extracellular solute-binding protein family 5  26.43 
 
 		 636 aa  177  6e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0132  extracellular solute-binding protein  31.46 
 
 		 532 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  32.08 
 
 		 544 aa  129  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3996  extracellular solute-binding protein family 5  23.14 
 
 		 563 aa  126  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1652  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  29.67 
 
 		 511 aa  125  2e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.2387  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0328  extracellular solute-binding protein family 5  29.47 
 
 		 540 aa  123  8e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3203  extracellular solute-binding protein family 5  22.36 
 
 		 641 aa  121  3e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1244  extracellular solute-binding protein family 5  24.23 
 
 		 588 aa  121  3.9999999999999996e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.863592  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3082  twin-arginine translocation pathway signal  29.58 
 
 		 535 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.49552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0106  extracellular solute-binding protein family 5  29.86 
 
 		 533 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0909337  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3798  extracellular solute-binding protein family 5  29.41 
 
 		 557 aa  119  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0510  extracellular solute-binding protein  29.43 
 
 		 510 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0306064  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0876  extracellular solute-binding protein family 5  23.64 
 
 		 559 aa  117  3.9999999999999997e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5138  putative periplasmic peptide-binding protein ABC transporter  34.07 
 
 		 495 aa  117  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0462348 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3167  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  29.23 
 
 		 542 aa  116  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  27.05 
 
 		 532 aa  116  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0785  extracellular solute-binding protein  29.57 
 
 		 512 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0600833  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4285  extracellular solute-binding protein  29.28 
 
 		 530 aa  116  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.261799  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4764  extracellular solute-binding protein  30.56 
 
 		 539 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3490  extracellular solute-binding protein  29.16 
 
 		 529 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0133  extracellular solute-binding protein family 5  25.65 
 
 		 664 aa  114  5e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2569  ABC transporter substrate-binding protein  27.32 
 
 		 558 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.217608 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0343  extracellular solute-binding protein family 5  25.74 
 
 		 537 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3133  twin-arginine translocation pathway signal  29.08 
 
 		 529 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2624  extracellular solute-binding protein family 5  30.84 
 
 		 547 aa  111  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.276954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2972  extracellular solute-binding protein  29.81 
 
 		 535 aa  110  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.439804  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0748  extracellular solute-binding protein  29.35 
 
 		 535 aa  110  6e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  31.8 
 
 		 544 aa  110  7.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0794  extracellular solute-binding protein family 5  24.12 
 
 		 1437 aa  110  8.000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0894131  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4254  extracellular solute-binding protein  31.15 
 
 		 527 aa  110  8.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.340537  normal  0.123719 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  31.5 
 
 		 542 aa  109  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1045  extracellular solute-binding protein family 5  21.74 
 
 		 607 aa  108  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6684  extracellular solute-binding protein family 5  27.89 
 
 		 548 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.692475 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0750  extracellular solute-binding protein  29.35 
 
 		 535 aa  107  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0803  extracellular solute-binding protein  25.95 
 
 		 529 aa  107  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000165149  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1000  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.28 
 
 		 529 aa  107  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1507  extracellular solute-binding protein family 5  28.75 
 
 		 516 aa  106  9e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.221484  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7214  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  30.56 
 
 		 532 aa  106  9e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0807  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.27 
 
 		 528 aa  106  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000107652  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0996  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.27 
 
 		 528 aa  106  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.41324e-61 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0398  extracellular solute-binding protein  27.65 
 
 		 559 aa  106  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.333674  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0398  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.01 
 
 		 527 aa  105  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0858  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  25.75 
 
 		 528 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000478589  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0822  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.59 
 
 		 528 aa  105  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0908  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  25.75 
 
 		 528 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000813115  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0945  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.58 
 
 		 528 aa  105  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00751792  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4386  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.58 
 
 		 529 aa  105  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.775513  hitchhiker  3.14637e-22 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0671  extracellular solute-binding protein  29.38 
 
 		 534 aa  105  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2571  extracellular solute-binding protein family 5  28.76 
 
 		 529 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13754  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3982  extracellular solute-binding protein  26.69 
 
 		 503 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2377  extracellular solute-binding protein  27.16 
 
 		 552 aa  105  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000449683  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  28.01 
 
 		 509 aa  104  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3248  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  26.69 
 
 		 503 aa  104  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336639  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  27.33 
 
 		 546 aa  104  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1651  extracellular solute-binding protein  30.53 
 
 		 516 aa  104  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0734  extracellular solute-binding protein family 5  29.24 
 
 		 594 aa  104  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.780369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4859  putative ABC transporter, substrate-binding protein  27.63 
 
 		 532 aa  104  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3196  extracellular solute-binding protein family 5  28.82 
 
 		 600 aa  103  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000171923  unclonable  0.0000000000413572 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3221  extracellular solute-binding protein  29.39 
 
 		 517 aa  103  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0146  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.62 
 
 		 539 aa  103  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3566  dipeptide/oligopeptide-binding protein  27.91 
 
 		 562 aa  103  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.672958  normal  0.0864129 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0883  extracellular solute-binding protein family 5  21.39 
 
 		 547 aa  103  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5780  extracellular solute-binding protein family 5  27.68 
 
 		 548 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0222518  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1553  extracellular solute-binding protein  27.61 
 
 		 559 aa  102  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.208561  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5235  extracellular solute-binding protein family 5  27.9 
 
 		 522 aa  102  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2798  extracellular solute-binding protein family 5  25.14 
 
 		 557 aa  101  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0930  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  28.17 
 
 		 588 aa  102  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.476779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0872  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 		 541 aa  101  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00426332  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3400  extracellular solute-binding protein family 5  27.33 
 
 		 567 aa  101  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.110204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  28.16 
 
 		 524 aa  100  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0782  extracellular solute-binding protein  27.48 
 
 		 494 aa  100  5e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.319175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0426  extracellular solute-binding protein  28.7 
 
 		 522 aa  100  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.133353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  28.53 
 
 		 505 aa  100  6e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  24.61 
 
 		 508 aa  100  6e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3971  extracellular solute-binding protein family 5  26.36 
 
 		 518 aa  100  6e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  25.15 
 
 		 495 aa  100  7e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2816  extracellular solute-binding protein  27.54 
 
 		 545 aa  100  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.54552  normal  0.0589435 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  28.49 
 
 		 524 aa  99.8  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0005  extracellular solute-binding protein family 5  22.33 
 
 		 599 aa  99.8  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.369822  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1578  extracellular solute-binding protein  29.79 
 
 		 595 aa  99.4  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.259952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  29.39 
 
 		 531 aa  99.4  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_002936  DET1494  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  29.5 
 
 		 543 aa  99  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0931394  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4398  extracellular solute-binding protein family 5  27.19 
 
 		 513 aa  98.6  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0482953  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4109  extracellular solute-binding protein family 5  27.19 
 
 		 513 aa  99  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344383  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9144  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  25.87 
 
 		 507 aa  98.6  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.215146  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0745  extracellular solute-binding protein  28.39 
 
 		 534 aa  99.4  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4290  extracellular solute-binding protein  26.59 
 
 		 530 aa  99  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00787986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  27.19 
 
 		 540 aa  98.2  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1284  extracellular solute-binding protein  29.5 
 
 		 543 aa  98.6  3e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3863  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  26.3 
 
 		 535 aa  98.2  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2769  extracellular solute-binding protein  27 
 
 		 507 aa  97.4  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12042  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2116  hypothetical protein  28.57 
 
 		 510 aa  97.1  7e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0171  4-phytase  26.03 
 
 		 535 aa  96.7  9e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4912  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  26.03 
 
 		 535 aa  96.7  9e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03346  hypothetical protein  26.03 
 
 		 535 aa  96.7  9e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>