More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3201 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_3201  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 638 aa  1282    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1045  extracellular solute-binding protein family 5  48.32 
 
 		 607 aa  570  1e-161  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3203  extracellular solute-binding protein family 5  44.88 
 
 		 641 aa  496  1e-139  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0876  extracellular solute-binding protein family 5  43.14 
 
 		 559 aa  456  1e-127  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1244  extracellular solute-binding protein family 5  35.6 
 
 		 588 aa  341  2.9999999999999998e-92  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.863592  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0005  extracellular solute-binding protein family 5  31.81 
 
 		 599 aa  241  2.9999999999999997e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.369822  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0133  extracellular solute-binding protein family 5  34.03 
 
 		 664 aa  183  8.000000000000001e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2201  extracellular solute-binding protein family 5  24.16 
 
 		 567 aa  94.4  6e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  27.27 
 
 		 532 aa  85.5  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4406  twin-arginine translocation pathway signal  20.95 
 
 		 541 aa  79.3  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0490152 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4407  twin-arginine translocation pathway signal  21.31 
 
 		 541 aa  79.3  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.095613 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1438  extracellular solute-binding protein family 5  23.22 
 
 		 554 aa  77.8  0.0000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.3177  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  25.42 
 
 		 540 aa  74.3  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1663  extracellular solute-binding protein family 5  23.58 
 
 		 578 aa  71.2  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0397427  normal  0.183706 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0398  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  23.36 
 
 		 527 aa  70.9  0.00000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2388  extracellular solute-binding protein family 5  22.27 
 
 		 583 aa  70.1  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1768  extracellular solute-binding protein family 5  24.91 
 
 		 579 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000449992  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  26.03 
 
 		 539 aa  68.6  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  24.6 
 
 		 509 aa  66.2  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1678  extracellular solute-binding protein family 5  22.01 
 
 		 553 aa  65.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.495361  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  24.3 
 
 		 523 aa  65.5  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  23.96 
 
 		 538 aa  64.7  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1538  extracellular solute-binding protein  26.34 
 
 		 609 aa  64.3  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4082  extracellular solute-binding protein  25.45 
 
 		 526 aa  64.3  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.484283  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2998  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 		 610 aa  63.5  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.869563  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  21.74 
 
 		 534 aa  63.2  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0753  extracellular solute-binding protein  22.05 
 
 		 490 aa  62.8  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139724  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4455  extracellular solute-binding protein  21.14 
 
 		 509 aa  62.8  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.661138  hitchhiker  0.000234808 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  24.32 
 
 		 508 aa  62.8  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1450  peptide ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.23 
 
 		 511 aa  62  0.00000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000430411  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  23.7 
 
 		 526 aa  62  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4018  extracellular solute-binding protein  23.84 
 
 		 553 aa  62  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.112501  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  23.39 
 
 		 546 aa  61.6  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3666  extracellular solute-binding protein family 5  22.7 
 
 		 563 aa  61.6  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1592  extracellular solute-binding protein  24.59 
 
 		 560 aa  61.6  0.00000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.382923  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  22.66 
 
 		 532 aa  61.2  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2592  extracellular solute-binding protein family 5  25.23 
 
 		 573 aa  60.8  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  21.65 
 
 		 535 aa  60.5  0.00000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3653  extracellular solute-binding protein family 5  24.58 
 
 		 513 aa  60.5  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0310608  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4381  extracellular solute-binding protein  24.75 
 
 		 510 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.582693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0759  extracellular solute-binding protein  22.48 
 
 		 547 aa  60.1  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0395598 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3804  extracellular solute-binding protein  22.19 
 
 		 509 aa  60.1  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00625229  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4764  extracellular solute-binding protein  23.17 
 
 		 539 aa  59.7  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1897  extracellular solute-binding protein family 5  25.98 
 
 		 554 aa  58.9  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1538  extracellular solute-binding protein family 5  22.92 
 
 		 563 aa  59.3  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000498479  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0289  ABC transporter extracellular solute-binding protein  25.1 
 
 		 606 aa  58.9  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1552  extracellular solute-binding protein  19.94 
 
 		 551 aa  58.9  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560356 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0477  extracellular solute-binding protein family 5  24.02 
 
 		 573 aa  58.9  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1605  extracellular solute-binding protein  24.23 
 
 		 595 aa  58.2  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1769  extracellular solute-binding protein family 5  23.17 
 
 		 589 aa  58.5  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0608  extracellular solute-binding protein family 5  20.69 
 
 		 549 aa  58.5  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.995783  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2678  extracellular solute-binding protein  23.8 
 
 		 500 aa  58.2  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00233729  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0883  extracellular solute-binding protein family 5  25.42 
 
 		 547 aa  57.8  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5349  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  26.67 
 
 		 539 aa  57.8  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.60385  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0671  extracellular solute-binding protein  23.81 
 
 		 534 aa  57.8  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2498  extracellular solute-binding protein  20.69 
 
 		 547 aa  57.8  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.228611  normal  0.10844 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1596  extracellular solute-binding protein family 5  23.15 
 
 		 572 aa  57.8  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0368881  unclonable  7.93881e-23 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  23.29 
 
 		 515 aa  57.8  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0207  extracellular solute-binding protein  21.45 
 
 		 567 aa  57.4  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1652  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  18.66 
 
 		 511 aa  57.4  0.0000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.2387  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2857  extracellular solute-binding protein  22.08 
 
 		 593 aa  57  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.358002 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  20.68 
 
 		 538 aa  56.6  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0019  extracellular solute-binding protein  25.34 
 
 		 533 aa  57  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1526  extracellular solute-binding protein  21.71 
 
 		 544 aa  56.6  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2626  extracellular solute-binding protein family 5  20.7 
 
 		 503 aa  57  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.253128  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0132  extracellular solute-binding protein  23.25 
 
 		 532 aa  57  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  22.19 
 
 		 566 aa  56.6  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.70881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2835  extracellular solute-binding protein  24.92 
 
 		 531 aa  57  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.827526 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1506  extracellular solute-binding protein  20.47 
 
 		 501 aa  57  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0306373  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0910  extracellular solute-binding protein  21.47 
 
 		 555 aa  56.2  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.463169  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0426  extracellular solute-binding protein  21.71 
 
 		 522 aa  56.2  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.133353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19540  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  21.35 
 
 		 567 aa  56.2  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.394832  normal  0.058637 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5037  extracellular solute-binding protein  22.61 
 
 		 534 aa  55.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4089  normal  0.963466 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0389  extracellular solute-binding protein  27.14 
 
 		 527 aa  55.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000716553  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  21.36 
 
 		 565 aa  55.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0631  extracellular solute-binding protein family 5  22.39 
 
 		 631 aa  55.5  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00116155  normal  0.250691 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0247  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein, putative  22.16 
 
 		 567 aa  55.5  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.460021  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5671  extracellular solute-binding protein  20.66 
 
 		 531 aa  55.8  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.880059  normal  0.0905991 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0658  extracellular solute-binding protein family 5  24.25 
 
 		 577 aa  55.5  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  22.62 
 
 		 541 aa  55.1  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0216  extracellular solute-binding protein  24.57 
 
 		 553 aa  55.5  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.923383 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0265  oligopeptide-binding protein OppA  21.77 
 
 		 566 aa  55.5  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2226  extracellular solute-binding protein family 5  23.33 
 
 		 507 aa  55.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0969064 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0217  extracellular solute-binding protein family 5  23.53 
 
 		 588 aa  55.1  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.745298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  24.48 
 
 		 510 aa  55.1  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  22.62 
 
 		 544 aa  54.7  0.000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0816  extracellular solute-binding protein  21.38 
 
 		 533 aa  54.7  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5416  extracellular solute-binding protein  22.61 
 
 		 534 aa  54.7  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.604179 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0106  extracellular solute-binding protein family 5  21.84 
 
 		 533 aa  54.7  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0909337  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0402  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.77 
 
 		 528 aa  54.7  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.882442  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1507  extracellular solute-binding protein family 5  21.59 
 
 		 516 aa  54.7  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.221484  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2283  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.77 
 
 		 528 aa  54.3  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0708849  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0091  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.77 
 
 		 528 aa  54.3  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2005  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.77 
 
 		 528 aa  54.3  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2032  ABC transporter, periplasmic binding protein  20.79 
 
 		 524 aa  54.3  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662418  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0584  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.77 
 
 		 528 aa  54.3  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.542939  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0564  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 		 607 aa  54.7  0.000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000010438  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  23.22 
 
 		 510 aa  54.7  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3091  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.77 
 
 		 528 aa  54.3  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  20.49 
 
 		 540 aa  54.3  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>