More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0267 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0267  diguanylate cyclase  100 
 
 		 550 aa  1051    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.92395  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0266  diguanylate cyclase  39.22 
 
 		 942 aa  188  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.955306  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1066  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  41.11 
 
 		 609 aa  120  4.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.94417  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6137  diguanylate cyclase  31.82 
 
 		 551 aa  120  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11555  normal  0.0857113 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6549  diguanylate cyclase  32.18 
 
 		 546 aa  120  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.530699 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2458  diguanylate cyclase  42 
 
 		 343 aa  118  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3011  serine/threonine protein kinase  42.78 
 
 		 1637 aa  114  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15444  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0148  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  41.32 
 
 		 560 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.189493 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1922  diguanylate cyclase  42.94 
 
 		 527 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.252712 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0602  diguanylate cyclase  42.56 
 
 		 637 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3643  diguanylate cyclase  40.33 
 
 		 516 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.93603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4028  diguanylate cyclase  40.11 
 
 		 447 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1157  PAS:GGDEF  40.48 
 
 		 418 aa  110  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal  0.862731 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0691  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  44.38 
 
 		 686 aa  110  6e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.343759  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1537  diguanylate cyclase  40.22 
 
 		 381 aa  110  6e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0100  diguanylate cyclase  39.52 
 
 		 446 aa  110  9.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.246337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7005  GGDEF family protein  37.5 
 
 		 568 aa  109  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1614  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.44 
 
 		 531 aa  110  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.423577 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1346  sensory box/GGDEF domain protein  41.42 
 
 		 425 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0034  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.24 
 
 		 728 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0767  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.74 
 
 		 675 aa  108  3e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000798179  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3308  diguanylate cyclase  37.88 
 
 		 603 aa  108  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000660005  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0319  two component diguanylate cyclase  38.64 
 
 		 661 aa  107  4e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1316  diguanylate cyclase  43.33 
 
 		 1004 aa  107  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.730261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1658  diguanylate cyclase  41.42 
 
 		 354 aa  107  5e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.287196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02778  GGDEF protein  38.83 
 
 		 946 aa  107  5e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1081  diguanylate cyclase  41.14 
 
 		 396 aa  107  5e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3387  diguanylate cyclase  40.91 
 
 		 385 aa  107  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.610096  normal  0.24043 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2731  diguanylate cyclase  38.46 
 
 		 714 aa  107  6e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1382  response regulator PleD  41.44 
 
 		 457 aa  106  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1282  diguanylate cyclase with GAF sensor  38.32 
 
 		 550 aa  106  9e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000101268  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3102  GGDEF domain-containing protein  39.78 
 
 		 580 aa  106  9e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4231  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.39 
 
 		 357 aa  106  9e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113145  normal  0.678212 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0178  diguanylate cyclase  43.02 
 
 		 521 aa  106  9e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.776824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1301  diguanylate cyclase  40.98 
 
 		 331 aa  106  9e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.298458  normal  0.144882 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1203  response regulator  38.1 
 
 		 634 aa  106  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1290  response regulator PleD  41.44 
 
 		 457 aa  106  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0138689  hitchhiker  0.00259394 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3248  diguanylate cyclase  39.9 
 
 		 420 aa  106  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1630  diguanylate cyclase with GAF sensor  40.8 
 
 		 739 aa  105  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0380  diguanylate cyclase  40.31 
 
 		 563 aa  106  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.620025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0443  diguanylate cyclase  35.64 
 
 		 378 aa  106  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0437  periplasmic/7TM domain sensor diguanylate cyclase  33.49 
 
 		 628 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0211155 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0620  diguanylate cyclase  41.67 
 
 		 517 aa  105  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0089586 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2940  sensor diguanylate cyclase  39.7 
 
 		 571 aa  106  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1425  diguanylate cyclase  44.74 
 
 		 381 aa  105  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4172  GGDEF domain-containing protein  36.59 
 
 		 431 aa  105  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0785  diguanylate cyclase with GAF sensor  44.65 
 
 		 367 aa  105  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0069  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.78 
 
 		 314 aa  105  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.840661 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0290  diguanylate cyclase  36.57 
 
 		 409 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1348  response regulator PleD  36.93 
 
 		 457 aa  105  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1163  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.95 
 
 		 325 aa  105  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.925084  normal  0.538197 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1056  diguanylate cyclase  38.58 
 
 		 580 aa  105  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.77678  normal  0.689214 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0411  diguanylate cyclase  33.94 
 
 		 628 aa  105  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0195  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.77 
 
 		 309 aa  104  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0106599  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1063  diguanylate cyclase  41.18 
 
 		 366 aa  104  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0365  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40 
 
 		 308 aa  105  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0838  diguanylate cyclase  39.44 
 
 		 332 aa  105  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.569939 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5389  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.92 
 
 		 372 aa  105  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0926  response regulator PleD  41.44 
 
 		 455 aa  104  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.773886 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1893  hypothetical protein  39.04 
 
 		 533 aa  104  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0317418  normal  0.65749 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3973  hypothetical protein  34.62 
 
 		 355 aa  104  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0517181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4330  diguanylate cyclase with GAF sensor  36.36 
 
 		 325 aa  104  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0096  diguanylate cyclase  39.68 
 
 		 555 aa  104  4e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2873  diguanylate cyclase  36.57 
 
 		 650 aa  104  4e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003519  diguanylate cyclase (GGDEF domain) with PAS/PAC sensor  34.97 
 
 		 280 aa  104  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000133532  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1107  two component signal transduction response regulator  35.71 
 
 		 323 aa  104  5e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3476  diguanylate cyclase  35.32 
 
 		 298 aa  104  5e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00597173 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0658  diguanylate cyclase  42.5 
 
 		 547 aa  104  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4238  diguanylate cyclase with GAF sensor  38.97 
 
 		 348 aa  103  6e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4126  diguanylate cyclase with GAF sensor  38.97 
 
 		 348 aa  103  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.859123  normal  0.0985842 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2518  diguanylate cyclase  37.99 
 
 		 372 aa  103  6e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.165269  normal  0.0137006 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3800  diguanylate cyclase  34.76 
 
 		 621 aa  103  7e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2050  diguanylate cyclase  41.9 
 
 		 523 aa  103  8e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645943 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1842  diguanylate cyclase  39.64 
 
 		 308 aa  103  8e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.721538  normal  0.677546 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3903  periplasmic/7TM domain sensor diguanylate cyclase  34.09 
 
 		 628 aa  103  9e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0802  diguanylate cyclase  38.24 
 
 		 321 aa  103  9e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0402  diguanylate cyclase  41.42 
 
 		 866 aa  103  9e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.362695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5323  diguanylate cyclase  42.86 
 
 		 422 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.666672  normal  0.745062 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0820  GGDEF domain-containing protein  31.63 
 
 		 333 aa  103  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1928  diguanylate cyclase  35.83 
 
 		 365 aa  102  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.851461 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0867  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.63 
 
 		 312 aa  102  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.711393  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2521  diguanylate cyclase  38.67 
 
 		 350 aa  103  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.848783 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4463  diguanylate cyclase  41.15 
 
 		 372 aa  103  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.379038 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3648  formamidopyrimidine-DNA glycolase  37.36 
 
 		 435 aa  102  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2834  diguanylate cyclase  32.26 
 
 		 355 aa  103  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.15225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1154  sensory box protein  33.16 
 
 		 340 aa  103  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0758  diguanylate cyclase  38.61 
 
 		 404 aa  103  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.017578  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1752  diguanylate cyclase  32.14 
 
 		 718 aa  102  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.972307  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0795  diguanylate cyclase  39.01 
 
 		 249 aa  102  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0423  diguanylate cyclase  35.58 
 
 		 621 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000679734 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1232  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.01 
 
 		 416 aa  102  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0021  diguanylate cyclase  34.92 
 
 		 423 aa  102  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1023  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  40 
 
 		 1104 aa  102  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0903314  normal  0.811378 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2063  diguanylate cyclase  38.5 
 
 		 338 aa  102  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.553076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02241  hypothetical protein  34.97 
 
 		 320 aa  102  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1085  diguanylate cyclase  31.98 
 
 		 357 aa  102  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0507  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.74 
 
 		 557 aa  102  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2867  diguanylate cyclase  35.96 
 
 		 402 aa  102  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0094  diguanylate cyclase  37.04 
 
 		 451 aa  102  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4352  diguanylate cyclase  40.29 
 
 		 369 aa  102  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.560351 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>