252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1397 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_1397  ribosomal protein S4  100 
 
 		 187 aa  380  1e-105  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.861603  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1100  30S ribosomal protein S4P  56.11 
 
 		 177 aa  193  1e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0273  30S ribosomal protein S4P  54.55 
 
 		 178 aa  188  4e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0565  30S ribosomal protein S4P  54.55 
 
 		 178 aa  187  1e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1353  30S ribosomal protein S4P  54.55 
 
 		 178 aa  186  2e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.49235  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0631  30S ribosomal protein S4P  53.11 
 
 		 178 aa  181  7e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1619  30S ribosomal protein S4P  52.27 
 
 		 183 aa  180  1e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0037  30S ribosomal protein S4P  51.11 
 
 		 184 aa  174  6e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0421  ribosomal protein S4  49.71 
 
 		 173 aa  173  9.999999999999999e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0258  30S ribosomal protein S4P  52.69 
 
 		 172 aa  168  4e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2901  30S ribosomal protein S4P  51.41 
 
 		 181 aa  168  5e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.104435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2553  ribosomal protein S4  49.13 
 
 		 173 aa  167  8e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0077  30S ribosomal protein S4P  50.56 
 
 		 216 aa  166  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2590  30S ribosomal protein S4P  50.29 
 
 		 173 aa  166  2.9999999999999998e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.325159  normal  0.37704 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2224  30S ribosomal protein S4P  49.15 
 
 		 185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2523  30S ribosomal protein S4P  50 
 
 		 169 aa  161  4.0000000000000004e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0154222  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1054  ribosomal protein S4  52.2 
 
 		 181 aa  160  8.000000000000001e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00520973  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1801  30S ribosomal protein S4P  50.56 
 
 		 182 aa  160  9e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.147092  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2387  30S ribosomal protein S4P  48.3 
 
 		 181 aa  159  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.331094  normal  0.66938 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1246  30S ribosomal protein S4P  47.75 
 
 		 181 aa  153  1e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0000703727  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1817  30S ribosomal protein S4P  45.61 
 
 		 175 aa  152  2e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2147  30S ribosomal protein S4P  45.21 
 
 		 180 aa  132  3.9999999999999996e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000057291  hitchhiker  0.000326283 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1103  30S ribosomal protein S4P  43.29 
 
 		 181 aa  131  6e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.798829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0324  30S ribosomal protein S4P  45.76 
 
 		 201 aa  130  9e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04803  hypothetical protein similar to 40S ribosomal protein S9 (Broad)  40.12 
 
 		 193 aa  123  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02160  hypothetical protein  41.88 
 
 		 193 aa  120  9.999999999999999e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77059  predicted protein  41.88 
 
 		 189 aa  118  6e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.425894  normal  0.528605 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0909  30S ribosomal protein S4P  42.04 
 
 		 159 aa  104  8e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1893  30S ribosomal protein S4P  44.87 
 
 		 159 aa  103  1e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_6847  predicted protein  38.71 
 
 		 167 aa  103  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.118356  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1422  30S ribosomal protein S4P  41.98 
 
 		 159 aa  102  4e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.186865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_94716  Ribosomal protein S9, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  35.67 
 
 		 194 aa  102  4e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.321448 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0971  30S ribosomal protein S4P  39.62 
 
 		 159 aa  97.1  1e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.160491 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06171  U3 small nucleolar ribonucleoprotein subunit (Imp3), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08320)  30.26 
 
 		 188 aa  68.2  0.00000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.102135  normal  0.241972 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00090  u3 small nucleolar ribonucleoprotein protein imp3, putative  28.97 
 
 		 196 aa  64.3  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0416  30S ribosomal protein S4  56 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.338288  normal  0.0195935 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37810  predicted protein  25.85 
 
 		 183 aa  62  0.000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0000622727 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1943  ribosomal protein S4  39.56 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01440  ribosomal protein S4  52.73 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000107934  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0292  30S ribosomal protein S4  41.89 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188387  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1841  30S ribosomal protein S4  42.65 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.470668  normal  0.674871 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2137  30S ribosomal protein S4  38.64 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000101892  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1973  30S ribosomal protein S4  38.64 
 
 		 203 aa  57.8  0.00000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000312348  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4000  ribosomal protein S4  50.94 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00226649  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1226  30S ribosomal protein S4  37.62 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6584  30S ribosomal protein S4  51.85 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.234143  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2583  30S ribosomal protein S4  41.89 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.542638  normal  0.610834 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1159  ribosomal protein S4  50.94 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000286157  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2998  ribosomal protein S4  38.83 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785982 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3383  ribosomal protein S4  40.85 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0500  30S ribosomal protein S4  36.27 
 
 		 201 aa  53.9  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000917743  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04260  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.342435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1254  SSU ribosomal protein S4P  50 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.119667  normal  0.172003 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1842  SSU ribosomal protein S4P  37.5 
 
 		 203 aa  53.9  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1810  30S ribosomal protein S4  52.17 
 
 		 200 aa  53.1  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000029578  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3670  ribosomal protein S4  48.15 
 
 		 201 aa  53.1  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1775  30S ribosomal protein S4  52.17 
 
 		 200 aa  53.1  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000000344809  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4291  ribosomal protein S4  38.1 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0715  30S ribosomal protein S4  52.17 
 
 		 200 aa  53.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1216  30S ribosomal protein S4  41.18 
 
 		 208 aa  52.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0261994 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1171  30S ribosomal protein S4  44.44 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2249  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 205 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0123403  normal  0.0465366 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01440  SSU ribosomal protein S4P  36.84 
 
 		 197 aa  53.1  0.000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.164406  normal  0.69794 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2592  30S ribosomal protein S4  40.68 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.907343 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1112  30S ribosomal protein S4  48.15 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1129  30S ribosomal protein S4  48.15 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1141  30S ribosomal protein S4  48.15 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.273227 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19720  SSU ribosomal protein S4P  52.17 
 
 		 198 aa  52  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000575799  normal  0.771365 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1548  ribosomal protein S4  42.59 
 
 		 197 aa  52.4  0.000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1435  30S ribosomal protein S4  46.3 
 
 		 201 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3980  ribosomal protein S4  40.68 
 
 		 209 aa  52.4  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0454614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4971  30S ribosomal protein S4  46.3 
 
 		 201 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.557252 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2724  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 200 aa  52  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000198678  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5277  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 205 aa  52  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.9692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5204  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 205 aa  51.6  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.795696  normal  0.228879 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0300  30S ribosomal protein S4  40 
 
 		 203 aa  51.6  0.000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00214384  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4737  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 205 aa  51.6  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0664  30S ribosomal protein S4  48.94 
 
 		 204 aa  51.6  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359087  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0202  ribosomal protein S4  43.08 
 
 		 203 aa  51.6  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0894  30S ribosomal protein S4  37.5 
 
 		 206 aa  51.2  0.000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000013906  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0763  RNA-binding S4 domain-containing protein  35.77 
 
 		 211 aa  51.2  0.000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2931  SSU ribosomal protein S4P  47.83 
 
 		 208 aa  51.2  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0070755  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0478  30S ribosomal protein S4  30.19 
 
 		 197 aa  51.2  0.000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000852694  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0566  30S ribosomal protein S4  42.59 
 
 		 202 aa  51.2  0.000009  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1284  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 200 aa  50.4  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000240031  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4287  30S ribosomal protein S4  46.3 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000360056 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0237  30S ribosomal protein S4  41.07 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0862147  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2432  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0359  30S ribosomal protein S4  45.65 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193969  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0609  30S ribosomal protein S4  42.65 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.19344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2305  ribosomal protein S4  37.5 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00950883  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2684  30S ribosomal protein S4  40 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000106865  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1394  SSU ribosomal protein S4P  50 
 
 		 262 aa  50.4  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00631065  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4939  ribosomal protein S4  44.62 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00864494  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4485  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.644744  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1117  30S ribosomal protein S4  48.15 
 
 		 208 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6023  30S ribosomal protein S4  38.04 
 
 		 209 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.181485 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1134  ribosomal protein S4  34.21 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00609491  normal  0.0863667 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3876  30S ribosomal protein S4  40.58 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13495  30S ribosomal protein S4  44.44 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000412742  normal  0.375665 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>