More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1171 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1171  30S ribosomal protein S4  100 
 
 		 201 aa  412  1e-114  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3670  ribosomal protein S4  73.63 
 
 		 201 aa  316  2e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13495  30S ribosomal protein S4  73.63 
 
 		 201 aa  313  9.999999999999999e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000412742  normal  0.375665 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3383  ribosomal protein S4  74.13 
 
 		 201 aa  313  9.999999999999999e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4971  30S ribosomal protein S4  74.63 
 
 		 201 aa  311  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.557252 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1435  30S ribosomal protein S4  74.63 
 
 		 201 aa  311  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6584  30S ribosomal protein S4  71.64 
 
 		 201 aa  308  2.9999999999999997e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.234143  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20600  30S ribosomal protein S4  73.13 
 
 		 202 aa  305  2.0000000000000002e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.725693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1112  30S ribosomal protein S4  73.13 
 
 		 201 aa  306  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1141  30S ribosomal protein S4  73.13 
 
 		 201 aa  306  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.273227 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1129  30S ribosomal protein S4  73.13 
 
 		 201 aa  306  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04260  30S ribosomal protein S4  70.65 
 
 		 202 aa  302  2.0000000000000002e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.342435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3876  30S ribosomal protein S4  69.15 
 
 		 202 aa  302  2.0000000000000002e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3896  30S ribosomal protein S4  58.65 
 
 		 208 aa  254  7e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4287  30S ribosomal protein S4  58.65 
 
 		 208 aa  254  8e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000360056 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0963  30S ribosomal protein S4  59.13 
 
 		 208 aa  251  7e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.877521  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1216  30S ribosomal protein S4  58.17 
 
 		 208 aa  250  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0261994 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1117  30S ribosomal protein S4  58.17 
 
 		 208 aa  248  4e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0333  30S ribosomal protein S4  59.13 
 
 		 208 aa  246  2e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0897396  decreased coverage  0.000428085 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0592  30S ribosomal protein S4  57.69 
 
 		 208 aa  240  7.999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4291  ribosomal protein S4  57.42 
 
 		 209 aa  236  2e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4480  ribosomal protein S4  55.77 
 
 		 208 aa  235  3e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131718  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0609  30S ribosomal protein S4  55.98 
 
 		 209 aa  231  5e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.19344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6023  30S ribosomal protein S4  55.02 
 
 		 209 aa  226  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.181485 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2684  30S ribosomal protein S4  49.52 
 
 		 208 aa  199  1.9999999999999998e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000106865  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1007  ribosomal protein S4  49.04 
 
 		 206 aa  192  3e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000469854  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0313  30S ribosomal protein S4  48.56 
 
 		 208 aa  188  4e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.977941  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1172  30S ribosomal protein S4  49.75 
 
 		 201 aa  187  5.999999999999999e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2931  SSU ribosomal protein S4P  49.52 
 
 		 208 aa  187  7e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0070755  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2040  ribosomal protein S4  48.08 
 
 		 208 aa  187  9e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00652573  hitchhiker  0.00144976 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2805  ribosomal protein S4  49.52 
 
 		 208 aa  187  1e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000815748  decreased coverage  0.00000000563481 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1825  30S ribosomal protein S4  48.28 
 
 		 203 aa  187  1e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1752  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 208 aa  185  4e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000068654  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4939  ribosomal protein S4  48.82 
 
 		 211 aa  185  4e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00864494  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0202  ribosomal protein S4  47.32 
 
 		 203 aa  185  4e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0715  30S ribosomal protein S4  49.5 
 
 		 200 aa  184  6e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0705  30S ribosomal protein S4  46.15 
 
 		 208 aa  184  8e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000946412  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01440  ribosomal protein S4  46.63 
 
 		 208 aa  182  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000107934  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0315  30S ribosomal protein S4  46.8 
 
 		 203 aa  182  3e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000187386  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05845  30S ribosomal protein S4  47.29 
 
 		 201 aa  181  4.0000000000000006e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.16626  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2305  ribosomal protein S4  45.93 
 
 		 209 aa  181  5.0000000000000004e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00950883  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2750  ribosomal protein S4  45.67 
 
 		 208 aa  181  6e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.462639  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01440  SSU ribosomal protein S4P  50.99 
 
 		 197 aa  181  6e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.164406  normal  0.69794 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0094  30S ribosomal protein S4  48.56 
 
 		 208 aa  181  7e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0810213  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2724  30S ribosomal protein S4  49.51 
 
 		 200 aa  181  8.000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000198678  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2432  30S ribosomal protein S4  47.6 
 
 		 208 aa  181  9.000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1009  30S ribosomal protein S4  48.56 
 
 		 208 aa  181  9.000000000000001e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.262144  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0372  30S ribosomal protein S4  46.31 
 
 		 201 aa  180  1e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2203  30S ribosomal protein S4  46.8 
 
 		 203 aa  180  1e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000224183  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2998  ribosomal protein S4  47.09 
 
 		 206 aa  179  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785982 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0628  ribosomal protein S4  46.34 
 
 		 202 aa  179  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1943  ribosomal protein S4  47.6 
 
 		 208 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0058  30S ribosomal protein S4  47.6 
 
 		 208 aa  179  2.9999999999999997e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4295  30S ribosomal protein S4  47.09 
 
 		 206 aa  178  4e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000502229  hitchhiker  0.00000000110473 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0264  30S ribosomal protein S4  47.06 
 
 		 204 aa  179  4e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4666  30S ribosomal protein S4  47.09 
 
 		 206 aa  179  4e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000332608  unclonable  0.00000000965042 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4252  ribosomal protein S4  47.09 
 
 		 206 aa  178  4e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000019621  unclonable  0.00000000000276102 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2348  30S ribosomal protein S4  46.12 
 
 		 206 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0206  30S ribosomal protein S4  47.6 
 
 		 208 aa  177  5.999999999999999e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0237  30S ribosomal protein S4  47.09 
 
 		 206 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000435795  unclonable  0.0000101717 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1766  30S ribosomal protein S4  47.6 
 
 		 208 aa  177  1e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.534162  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0206  30S ribosomal protein S4  47.78 
 
 		 203 aa  177  1e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000707941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0340  ribosomal protein S4  47.29 
 
 		 195 aa  177  1e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0786  ribosomal protein S4  47.12 
 
 		 208 aa  177  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0220407  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1718  ribosomal protein S4  46.15 
 
 		 208 aa  176  2e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000245759  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0182  30S ribosomal protein S4  46.6 
 
 		 206 aa  176  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000162542  hitchhiker  0.00157389 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1581  30S ribosomal protein S4  47.6 
 
 		 208 aa  176  2e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1947  30S ribosomal protein S4  47.6 
 
 		 208 aa  176  2e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.134861  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1973  30S ribosomal protein S4  49.76 
 
 		 203 aa  176  2e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000312348  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2044  30S ribosomal protein S4  46.15 
 
 		 208 aa  175  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0881453  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1959  30S ribosomal protein S4  46.15 
 
 		 208 aa  175  4e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1920  30S ribosomal protein S4  46.15 
 
 		 208 aa  175  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3885  30S ribosomal protein S4  46.12 
 
 		 206 aa  175  4e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0632608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4032  30S ribosomal protein S4  45.63 
 
 		 206 aa  175  5e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000124947  hitchhiker  0.0000000000798632 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0223  30S ribosomal protein S4  45.63 
 
 		 206 aa  175  5e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000278242  normal  0.0713336 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4146  30S ribosomal protein S4  45.63 
 
 		 206 aa  175  5e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000109466  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0220  30S ribosomal protein S4  45.63 
 
 		 206 aa  175  5e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000964484  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1013  30S ribosomal protein S4  47.57 
 
 		 206 aa  174  5e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000212014  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0208  30S ribosomal protein S4  45.63 
 
 		 206 aa  174  5e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000624869  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3735  30S ribosomal protein S4  45.63 
 
 		 206 aa  174  6e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000110035  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2137  30S ribosomal protein S4  48.78 
 
 		 203 aa  174  7e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000101892  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0894  30S ribosomal protein S4  47.37 
 
 		 206 aa  174  7e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000013906  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19720  SSU ribosomal protein S4P  48.76 
 
 		 198 aa  174  8e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000575799  normal  0.771365 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0223  30S ribosomal protein S4  45.63 
 
 		 206 aa  174  8e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00230473  unclonable  0.0000000000516884 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0743  ribosomal protein S4  46.6 
 
 		 206 aa  174  8e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.068041  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0255  30S ribosomal protein S4  45.63 
 
 		 206 aa  174  9e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0223  30S ribosomal protein S4  45.63 
 
 		 206 aa  174  9e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000007109  unclonable  0.0000000000236085 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0218  30S ribosomal protein S4  45.63 
 
 		 206 aa  174  9e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000114073  hitchhiker  0.00573009 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0172  30S ribosomal protein S4  46.12 
 
 		 206 aa  174  9e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000508668  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09100  30S ribosomal protein S4  46.12 
 
 		 206 aa  174  9e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.908313 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1134  ribosomal protein S4  47.29 
 
 		 197 aa  173  9.999999999999999e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00609491  normal  0.0863667 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0318  ribosomal protein S4  46.6 
 
 		 206 aa  173  9.999999999999999e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.665336  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00962  30S ribosomal protein S4  46.6 
 
 		 206 aa  174  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00755213  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0194  30S ribosomal protein S4  46.12 
 
 		 206 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127646  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2150  30S ribosomal protein S4  47.09 
 
 		 206 aa  173  9.999999999999999e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000017924  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4725  30S ribosomal protein S4  45.63 
 
 		 206 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.766159  normal  0.270309 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0861  30S ribosomal protein S4  45.63 
 
 		 206 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1937  30S ribosomal protein S4  45.67 
 
 		 208 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0471  30S ribosomal protein S4  47.52 
 
 		 200 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000100944  hitchhiker  4.8786299999999993e-20 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3327  30S ribosomal protein S4  47.52 
 
 		 200 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000248743  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>